MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF POL001.1 MTE letter-probability matrix: alength= 4 w= 19 nsites= 9 E= 0 0.111111 0.222222 0.222222 0.444444 0.111111 0.333333 0.000000 0.555556 0.111111 0.222222 0.111111 0.555556 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.222222 0.000000 0.777778 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.444444 0.000000 0.555556 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.444444 0.555556 0.000000 0.222222 0.333333 0.444444 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.444444 0.000000 0.444444 0.111111 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.222222 0.777778 0.000000 0.444444 0.000000 0.000000 0.555556 0.222222 0.444444 0.000000 0.333333 0.111111 0.333333 0.555556 0.000000 0.111111 0.333333 0.222222 0.333333 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/POL001.1 MOTIF POL002.1 INR letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 303 E= 0 0.161716 0.158416 0.227723 0.452145 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.950495 0.000000 0.000000 0.049505 0.085809 0.267327 0.382838 0.264026 0.254125 0.313531 0.000000 0.432343 0.221122 0.389439 0.151815 0.237624 0.148515 0.280528 0.240924 0.330033 0.165017 0.316832 0.184818 0.333333 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/POL002.1 MOTIF POL003.1 GC-box letter-probability matrix: alength= 4 w= 14 nsites= 274 E= 0 0.372263 0.145985 0.182482 0.299270 0.354015 0.113139 0.408759 0.124088 0.182482 0.021898 0.562044 0.233577 0.244526 0.003650 0.751825 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.007299 0.000000 0.992701 0.000000 0.197080 0.620438 0.000000 0.182482 0.167883 0.003650 0.817518 0.010949 0.003650 0.010949 0.810219 0.175182 0.288321 0.000000 0.624088 0.087591 0.083942 0.062044 0.700730 0.153285 0.000000 0.605839 0.127737 0.266423 0.072993 0.313869 0.189781 0.423358 0.145985 0.087591 0.397810 0.368613 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/POL003.1 MOTIF POL004.1 CCAAT-box letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 175 E= 0 0.320000 0.314286 0.068571 0.297143 0.182857 0.297143 0.245714 0.274286 0.142857 0.268571 0.137143 0.451429 0.582857 0.005714 0.400000 0.011429 0.291429 0.034286 0.565714 0.108571 0.000000 0.988571 0.005714 0.005714 0.000000 0.994286 0.000000 0.005714 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.680000 0.045714 0.120000 0.154286 0.097143 0.000000 0.085714 0.817143 0.131429 0.514286 0.337143 0.017143 0.662857 0.034286 0.297143 0.005714 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/POL004.1 MOTIF POL005.1 DPE letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 82 E= 0 0.292683 0.219512 0.365854 0.121951 0.439024 0.256098 0.073171 0.231707 0.500000 0.036585 0.341463 0.121951 0.024390 0.365854 0.573171 0.036585 0.524390 0.024390 0.012195 0.439024 0.085366 0.365854 0.048780 0.500000 0.195122 0.378049 0.426829 0.000000 0.182927 0.256098 0.134146 0.426829 0.231707 0.268293 0.207317 0.292683 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/POL005.1 MOTIF POL006.1 BREu letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 22 E= 0 0.545455 0.318182 0.090909 0.045455 0.136364 0.363636 0.500000 0.000000 0.045455 0.636364 0.318182 0.000000 0.272727 0.181818 0.545455 0.000000 0.181818 0.681818 0.090909 0.045455 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.909091 0.045455 0.045455 0.045455 0.818182 0.045455 0.090909 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/POL006.1 MOTIF POL007.1 BREd letter-probability matrix: alength= 4 w= 7 nsites= 41 E= 0 0.243902 0.097561 0.463415 0.195122 0.121951 0.195122 0.195122 0.487805 0.243902 0.146341 0.268293 0.341463 0.073171 0.146341 0.365854 0.414634 0.097561 0.195122 0.365854 0.341463 0.048780 0.146341 0.317073 0.487805 0.146341 0.219512 0.243902 0.390244 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/POL007.1 MOTIF POL008.1 DCE_S_I letter-probability matrix: alength= 4 w= 6 nsites= 108 E= 0 0.166667 0.175926 0.425926 0.231481 0.037037 0.861111 0.055556 0.046296 0.027778 0.111111 0.074074 0.787037 0.037037 0.111111 0.185185 0.666667 0.018519 0.861111 0.064815 0.055556 0.203704 0.314815 0.250000 0.231481 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/POL008.1 MOTIF POL009.1 DCE_S_II letter-probability matrix: alength= 4 w= 6 nsites= 108 E= 0 0.148148 0.314815 0.398148 0.138889 0.027778 0.925926 0.027778 0.018519 0.055556 0.046296 0.120370 0.777778 0.018519 0.101852 0.833333 0.046296 0.129630 0.194444 0.120370 0.555556 0.148148 0.259259 0.416667 0.175926 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/POL009.1 MOTIF POL010.1 DCE_S_III letter-probability matrix: alength= 4 w= 5 nsites= 108 E= 0 0.157407 0.398148 0.324074 0.120370 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.185185 0.333333 0.268519 0.212963 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/POL010.1 MOTIF POL011.1 XCPE1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 21 E= 0 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.285714 0.714286 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.904762 0.000000 0.095238 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.142857 0.000000 0.857143 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.666667 0.333333 0.000000 0.095238 0.904762 0.000000 0.000000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/POL011.1 MOTIF POL012.1 TATA-Box letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 389 E= 0 0.156812 0.372751 0.390746 0.079692 0.041131 0.118252 0.046272 0.794344 0.904884 0.000000 0.005141 0.089974 0.007712 0.025707 0.005141 0.961440 0.910026 0.000000 0.012853 0.077121 0.688946 0.000000 0.000000 0.311054 0.949868 0.007916 0.026385 0.015831 0.570694 0.005141 0.113111 0.311054 0.398458 0.113111 0.403599 0.084833 0.143959 0.347044 0.385604 0.123393 0.213368 0.377892 0.329049 0.079692 0.210797 0.326478 0.329049 0.133676 0.210797 0.303342 0.329049 0.156812 0.174807 0.275064 0.357326 0.192802 0.197943 0.259640 0.359897 0.182519 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/POL012.1 MOTIF POL013.1 MED-1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 6 nsites= 14 E= 0 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.357143 0.642857 0.000000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/POL013.1