MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF PF0120.1 KRCTCNNNNMANAGC letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 536 E= 0 0.000000 0.000000 0.970149 0.029851 0.014925 0.000000 0.985075 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.016791 0.027985 0.000000 0.955224 0.046642 0.007463 0.386194 0.559701 0.492537 0.022388 0.013060 0.472015 0.483209 0.000000 0.050373 0.466418 0.611940 0.388060 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.018657 0.042910 0.936567 0.001866 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PF0120.1 MOTIF PF0112.1 KTGGYRSGAA letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 308 E= 0 0.000000 0.000000 0.474026 0.525974 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.798701 0.000000 0.201299 0.168831 0.000000 0.831169 0.000000 0.000000 0.217532 0.782468 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PF0112.1 MOTIF MA0493.1 Klf1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 526 E= 0 0.285171 0.144487 0.384030 0.186312 0.317490 0.076046 0.579848 0.026616 0.127376 0.752852 0.060837 0.058935 0.024715 0.876426 0.000000 0.098859 0.768061 0.224335 0.000000 0.007605 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.760456 0.000000 0.184411 0.055133 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.965779 0.000000 0.034221 0.532319 0.066540 0.000000 0.401141 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0493.1 MOTIF MA0742.1 Klf12 letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 1585 E= 0 0.105363 0.022082 0.730599 0.141956 0.505023 0.010046 0.484932 0.000000 0.026989 0.948864 0.011364 0.012784 0.007246 0.971014 0.017391 0.004348 0.967120 0.030612 0.002268 0.000000 0.013081 0.981105 0.000000 0.005814 0.136076 0.000633 0.853165 0.010127 0.000000 0.994211 0.000000 0.005789 0.000000 0.969780 0.012363 0.017857 0.000000 0.982143 0.000000 0.017857 0.404738 0.118460 0.000000 0.476802 0.248175 0.228363 0.103233 0.420229 0.334419 0.259501 0.091205 0.314875 0.245361 0.191753 0.120619 0.442268 0.284664 0.220588 0.148109 0.346639 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0742.1 MOTIF MA0039.1 Klf4 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 49 E= 0 0.367347 0.183673 0.040816 0.408163 0.673469 0.000000 0.265306 0.061224 0.612245 0.061224 0.306122 0.020408 0.469388 0.020408 0.387755 0.122449 0.265306 0.122449 0.591837 0.020408 0.408163 0.081633 0.469388 0.040816 0.734694 0.081633 0.102041 0.081633 0.653061 0.040816 0.265306 0.040816 0.265306 0.020408 0.673469 0.040816 0.040816 0.020408 0.938776 0.000000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0039.1 MOTIF MA0039.2 Klf4 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 4336 E= 0 0.338561 0.018681 0.235701 0.407057 0.020276 0.002074 0.976267 0.001382 0.003223 0.002993 0.990792 0.002993 0.003221 0.008282 0.984817 0.003681 0.063693 0.441941 0.002529 0.491837 0.005064 0.003453 0.983656 0.007827 0.009671 0.018420 0.501727 0.470182 0.060872 0.010606 0.899700 0.028822 0.028400 0.030016 0.874856 0.066728 0.058742 0.660962 0.064755 0.215541 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0039.2 MOTIF PB0039.1 Klf7_1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 16 nsites= 100 E= 0 0.200000 0.200000 0.170000 0.430000 0.168317 0.297030 0.247525 0.287129 0.267327 0.148515 0.396040 0.188119 0.550000 0.060000 0.340000 0.050000 0.050000 0.900000 0.020000 0.030000 0.040000 0.920000 0.010000 0.030000 0.405941 0.564356 0.019802 0.009901 0.010000 0.980000 0.000000 0.010000 0.200000 0.000000 0.750000 0.050000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.930000 0.000000 0.070000 0.262626 0.424242 0.020202 0.292929 0.180000 0.250000 0.090000 0.480000 0.346535 0.198020 0.138614 0.316832 0.257426 0.168317 0.237624 0.336634 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PB0039.1 MOTIF PB0143.1 Klf7_2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 17 nsites= 100 E= 0 0.390000 0.260000 0.250000 0.100000 0.420000 0.210000 0.230000 0.140000 0.262626 0.191919 0.313131 0.232323 0.060606 0.373737 0.212121 0.353535 0.603960 0.009901 0.108911 0.277228 0.180000 0.010000 0.070000 0.740000 0.760000 0.220000 0.010000 0.010000 0.000000 0.989899 0.000000 0.010101 0.040000 0.000000 0.950000 0.010000 0.010000 0.980000 0.010000 0.000000 0.010000 0.980000 0.010000 0.000000 0.010000 0.930000 0.000000 0.060000 0.390000 0.300000 0.050000 0.260000 0.510000 0.120000 0.160000 0.210000 0.297030 0.306931 0.198020 0.198020 0.300000 0.230000 0.150000 0.320000 0.188119 0.178218 0.287129 0.346535 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PB0143.1 MOTIF MA0452.1 Kr letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 31 E= 0 0.096774 0.548387 0.161290 0.193548 0.354839 0.129032 0.322581 0.193548 0.774194 0.000000 0.225806 0.000000 0.967742 0.000000 0.000000 0.032258 0.580645 0.193548 0.225806 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.064516 0.000000 0.935484 0.000000 0.064516 0.000000 0.935484 0.000000 0.000000 0.032258 0.225806 0.741935 0.129032 0.000000 0.161290 0.709677 0.645161 0.129032 0.096774 0.129032 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0452.1 MOTIF MA0452.2 Kr letter-probability matrix: alength= 4 w= 14 nsites= 1296 E= 0 0.138117 0.325617 0.183642 0.352623 0.158179 0.145833 0.168210 0.527778 0.116512 0.297840 0.056327 0.529321 0.962963 0.000000 0.000000 0.037037 0.833333 0.166667 0.000000 0.000000 0.008488 0.902778 0.000000 0.088735 0.000000 0.908179 0.000000 0.091821 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.155864 0.000000 0.844136 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.087191 0.000000 0.912809 0.087191 0.307870 0.178241 0.426698 0.245370 0.248457 0.219907 0.286265 0.162809 0.334877 0.168981 0.333333 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0452.2