MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF PH0087.1 Irx6 letter-probability matrix: alength= 4 w= 17 nsites= 100 E= 0 0.360000 0.180000 0.120000 0.340000 0.540000 0.130000 0.120000 0.210000 0.400000 0.160000 0.120000 0.320000 0.313131 0.161616 0.282828 0.242424 0.200000 0.010000 0.030000 0.760000 0.950000 0.010000 0.010000 0.030000 0.009901 0.950495 0.009901 0.029703 0.950000 0.000000 0.020000 0.030000 0.030000 0.020000 0.000000 0.950000 0.029703 0.009901 0.950495 0.009901 0.030000 0.010000 0.010000 0.950000 0.760000 0.030000 0.010000 0.200000 0.370000 0.270000 0.180000 0.180000 0.404040 0.101010 0.212121 0.282828 0.480000 0.110000 0.110000 0.300000 0.320000 0.220000 0.210000 0.250000 0.130000 0.060000 0.070000 0.740000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PH0087.1 MOTIF PB0037.1 Isgf3g_1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 100 E= 0 0.280000 0.310000 0.210000 0.200000 0.400000 0.110000 0.250000 0.240000 0.464646 0.090909 0.333333 0.111111 0.772277 0.019802 0.059406 0.148515 0.860000 0.030000 0.020000 0.090000 0.323232 0.131313 0.111111 0.434343 0.030000 0.820000 0.030000 0.120000 0.039604 0.009901 0.940594 0.009901 0.960000 0.020000 0.010000 0.010000 0.949495 0.000000 0.010101 0.040404 0.969697 0.010101 0.000000 0.020202 0.030000 0.880000 0.080000 0.010000 0.030303 0.292929 0.010101 0.666667 0.366337 0.168317 0.227723 0.237624 0.808081 0.070707 0.050505 0.070707 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PB0037.1 MOTIF PB0141.1 Isgf3g_2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 14 nsites= 100 E= 0 0.110000 0.180000 0.480000 0.230000 0.220000 0.350000 0.320000 0.110000 0.530000 0.140000 0.160000 0.170000 0.594059 0.059406 0.148515 0.198020 0.790000 0.050000 0.070000 0.090000 0.780000 0.030000 0.110000 0.080000 0.118812 0.584158 0.227723 0.069307 0.633663 0.069307 0.108911 0.188119 0.108911 0.257426 0.306931 0.326733 0.210000 0.070000 0.300000 0.420000 0.640000 0.090000 0.090000 0.180000 0.188119 0.534653 0.128713 0.148515 0.190000 0.240000 0.180000 0.390000 0.390000 0.110000 0.280000 0.220000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PB0141.1 MOTIF PH0088.1 Isl2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 16 nsites= 100 E= 0 0.380000 0.460000 0.070000 0.090000 0.373737 0.252525 0.090909 0.282828 0.400000 0.350000 0.120000 0.130000 0.580000 0.150000 0.130000 0.140000 0.740000 0.120000 0.050000 0.090000 0.060000 0.300000 0.090000 0.550000 0.019802 0.504950 0.009901 0.465347 0.600000 0.360000 0.020000 0.020000 0.702970 0.277228 0.009901 0.009901 0.010101 0.010101 0.000000 0.979798 0.010101 0.010101 0.000000 0.979798 0.930000 0.000000 0.010000 0.060000 0.660000 0.040000 0.210000 0.090000 0.148515 0.108911 0.306931 0.435644 0.320000 0.100000 0.140000 0.440000 0.202020 0.282828 0.080808 0.434343 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PH0088.1 MOTIF PH0089.1 Isx letter-probability matrix: alength= 4 w= 16 nsites= 100 E= 0 0.340000 0.260000 0.120000 0.280000 0.270000 0.310000 0.220000 0.200000 0.198020 0.277228 0.198020 0.326733 0.300000 0.310000 0.270000 0.120000 0.040404 0.868687 0.010101 0.080808 0.000000 0.393939 0.000000 0.606061 0.980198 0.009901 0.000000 0.009901 0.990000 0.000000 0.000000 0.010000 0.010000 0.000000 0.000000 0.990000 0.009901 0.000000 0.009901 0.980198 0.606061 0.000000 0.393939 0.000000 0.080808 0.010101 0.868687 0.040404 0.120000 0.210000 0.330000 0.340000 0.140000 0.300000 0.280000 0.280000 0.161616 0.222222 0.474747 0.141414 0.320000 0.100000 0.170000 0.410000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PH0089.1 MOTIF MA0655.1 JDP2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 1801 E= 0 0.907274 0.010550 0.077735 0.004442 0.003038 0.003645 0.000608 0.992710 0.000000 0.001808 0.984931 0.013261 0.983153 0.000602 0.001203 0.015042 0.008429 0.722456 0.261288 0.007827 0.003645 0.000000 0.003645 0.992710 0.013189 0.979616 0.001799 0.005396 0.995734 0.000000 0.000000 0.004266 0.010654 0.195642 0.002421 0.791283 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0655.1 MOTIF MA0656.1 JDP2(var.2) letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 24402 E= 0 0.174576 0.224695 0.452258 0.148471 0.899086 0.048596 0.051691 0.000626 0.000123 0.000369 0.000123 0.999386 0.000417 0.000000 0.926005 0.073578 0.999222 0.000287 0.000246 0.000246 0.000202 0.985900 0.000242 0.013655 0.023483 0.000200 0.976237 0.000080 0.000614 0.000982 0.000286 0.998119 0.067863 0.931946 0.000153 0.000038 0.999222 0.000409 0.000369 0.000000 0.001859 0.479315 0.033025 0.485801 0.179616 0.496558 0.169003 0.154823 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0656.1 MOTIF MA1156.1 JKD letter-probability matrix: alength= 4 w= 20 nsites= 596 E= 0 0.273490 0.181208 0.112416 0.432886 0.270134 0.166107 0.120805 0.442953 0.271812 0.169463 0.132550 0.426174 0.295302 0.105705 0.125839 0.473154 0.243289 0.117450 0.124161 0.515101 0.139262 0.050336 0.052013 0.758389 0.010067 0.040268 0.021812 0.927852 0.000000 0.008389 0.006711 0.984899 0.000000 0.016779 0.000000 0.983221 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.021812 0.978188 0.018456 0.946309 0.000000 0.035235 0.052013 0.104027 0.555369 0.288591 0.015101 0.033557 0.070470 0.880872 0.095638 0.166107 0.057047 0.681208 0.145973 0.000000 0.000000 0.854027 0.224832 0.045302 0.013423 0.716443 0.119128 0.382550 0.323826 0.174497 0.078859 0.226510 0.065436 0.629195 0.239933 0.092282 0.350671 0.317114 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1156.1 MOTIF MA0488.1 JUN letter-probability matrix: alength= 4 w= 13 nsites= 20968 E= 0 0.388258 0.133155 0.233403 0.245183 0.339374 0.140118 0.237743 0.282764 0.309805 0.090757 0.461751 0.137686 0.788153 0.034767 0.177079 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.994325 0.005675 0.999952 0.000000 0.000000 0.000048 0.000000 0.163964 0.215185 0.620851 0.000000 0.028997 0.971003 0.000000 0.044735 0.168399 0.000000 0.786866 0.329264 0.670736 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.009681 0.176650 0.048455 0.765214 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0488.1 MOTIF MA0489.1 JUN(var.2) letter-probability matrix: alength= 4 w= 14 nsites= 10956 E= 0 0.442862 0.114093 0.257211 0.185834 0.358434 0.120847 0.375137 0.145582 0.340088 0.102866 0.395217 0.161829 0.401241 0.102410 0.315900 0.180449 0.378423 0.054126 0.384538 0.182913 0.541256 0.090635 0.368109 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.999726 0.000000 0.000000 0.000274 0.034867 0.520628 0.373311 0.071194 0.018164 0.000000 0.000000 0.981836 0.087258 0.912742 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.034319 0.229007 0.241420 0.495254 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0489.1