MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF MA0772.1 IRF7 letter-probability matrix: alength= 4 w= 14 nsites= 958 E= 0 0.389353 0.337161 0.074113 0.199374 0.084348 0.832174 0.043478 0.040000 0.031304 0.058261 0.832174 0.078261 0.995838 0.003122 0.001041 0.000000 0.998956 0.000000 0.000000 0.001044 0.995838 0.002081 0.001041 0.001041 0.291536 0.163009 0.527691 0.017764 0.008273 0.601861 0.002068 0.387797 0.030090 0.003009 0.959880 0.007021 0.974542 0.016293 0.004073 0.005092 0.992739 0.003112 0.003112 0.001037 0.942857 0.009852 0.006897 0.040394 0.322002 0.260267 0.335872 0.081860 0.139373 0.133275 0.027003 0.700348 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0772.1 MOTIF MA0652.1 IRF8 letter-probability matrix: alength= 4 w= 14 nsites= 5878 E= 0 0.222695 0.339571 0.097142 0.340592 0.009205 0.858854 0.002776 0.129164 0.000510 0.000000 0.999150 0.000340 0.999660 0.000340 0.000000 0.000000 0.994417 0.000000 0.000000 0.005583 0.999490 0.000000 0.000000 0.000510 0.008285 0.901810 0.088984 0.000921 0.000844 0.826490 0.000000 0.172666 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.999490 0.000000 0.000510 0.000000 0.988231 0.000000 0.000336 0.011432 0.999150 0.000850 0.000000 0.000000 0.001579 0.843934 0.152333 0.002154 0.041901 0.189792 0.001044 0.767263 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0652.1 MOTIF MA0653.1 IRF9 letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 3672 E= 0 0.944172 0.014161 0.011710 0.029956 0.573621 0.119424 0.048921 0.258034 0.013362 0.945460 0.008999 0.032179 0.012223 0.000853 0.985503 0.001421 0.998272 0.001440 0.000288 0.000000 0.999135 0.000000 0.000000 0.000865 0.999135 0.000576 0.000000 0.000288 0.011572 0.932992 0.053014 0.002422 0.003709 0.803662 0.000000 0.192629 0.000576 0.000000 0.999135 0.000288 0.999423 0.000577 0.000000 0.000000 0.993694 0.000287 0.000000 0.006019 0.999135 0.000000 0.000000 0.000865 0.001078 0.933998 0.064386 0.000539 0.027708 0.315981 0.001959 0.654352 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0653.1 MOTIF MA0914.1 ISL2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 10934 E= 0 0.144961 0.239254 0.514999 0.100787 0.023068 0.811851 0.018166 0.146915 0.911903 0.026235 0.021700 0.040162 0.337678 0.601538 0.018267 0.042517 0.035459 0.021145 0.027489 0.915908 0.041867 0.108133 0.001958 0.848042 0.776690 0.028414 0.008138 0.186759 0.484262 0.105865 0.280186 0.129687 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0914.1 MOTIF MA0654.1 ISX letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 2065 E= 0 0.153995 0.417918 0.176271 0.251816 0.004822 0.483607 0.000000 0.511572 0.964052 0.022409 0.002334 0.011204 0.987566 0.007652 0.000000 0.004782 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.011489 0.988511 0.976821 0.000000 0.000000 0.023179 0.373062 0.148740 0.341085 0.137112 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0654.1 MOTIF MA0323.1 IXR1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 161 E= 0 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.765823 0.000000 0.000000 0.234177 0.326923 0.000000 0.538462 0.134615 0.106870 0.870229 0.000000 0.022901 0.239837 0.760163 0.000000 0.000000 0.239837 0.000000 0.760163 0.000000 0.119658 0.000000 0.722222 0.158120 0.630208 0.000000 0.369792 0.000000 0.765823 0.000000 0.000000 0.234177 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.102941 0.000000 0.897059 0.000000 0.020619 0.000000 0.979381 0.000000 0.000000 0.000000 0.530806 0.469194 0.000000 0.000000 0.897059 0.102941 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0323.1 MOTIF MA0617.1 Id2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 1000 E= 0 0.278000 0.167000 0.499000 0.056000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.499500 0.045954 0.272727 0.181818 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0617.1 MOTIF PB0033.1 Irf3_1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 14 nsites= 100 E= 0 0.180000 0.240000 0.340000 0.240000 0.500000 0.100000 0.240000 0.160000 0.444444 0.020202 0.494949 0.040404 0.760000 0.020000 0.090000 0.130000 0.810000 0.030000 0.020000 0.140000 0.310000 0.320000 0.100000 0.270000 0.050000 0.480000 0.430000 0.040000 0.050000 0.010000 0.930000 0.010000 0.790000 0.100000 0.100000 0.010000 0.850000 0.020000 0.010000 0.120000 0.890000 0.050000 0.010000 0.050000 0.050000 0.780000 0.120000 0.050000 0.100000 0.400000 0.090000 0.410000 0.290000 0.150000 0.410000 0.150000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PB0033.1 MOTIF PB0137.1 Irf3_2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 14 nsites= 100 E= 0 0.240000 0.150000 0.410000 0.200000 0.198020 0.138614 0.435644 0.227723 0.600000 0.090000 0.120000 0.190000 0.210000 0.060000 0.650000 0.080000 0.742574 0.029703 0.049505 0.178218 0.770000 0.050000 0.040000 0.140000 0.475248 0.089109 0.178218 0.257426 0.060606 0.111111 0.757576 0.070707 0.060000 0.070000 0.820000 0.050000 0.270000 0.090000 0.220000 0.420000 0.060606 0.383838 0.424242 0.131313 0.049505 0.594059 0.168317 0.188119 0.270000 0.150000 0.380000 0.200000 0.380000 0.200000 0.220000 0.200000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PB0137.1 MOTIF PB0034.1 Irf4_1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 99 E= 0 0.303030 0.393939 0.161616 0.141414 0.260000 0.110000 0.470000 0.160000 0.310000 0.080000 0.170000 0.440000 0.666667 0.040404 0.050505 0.242424 0.180000 0.280000 0.070000 0.470000 0.010000 0.890000 0.010000 0.090000 0.010101 0.000000 0.989899 0.000000 0.980198 0.009901 0.009901 0.000000 0.939394 0.000000 0.000000 0.060606 0.990000 0.000000 0.000000 0.010000 0.019802 0.940594 0.029703 0.009901 0.030000 0.570000 0.020000 0.380000 0.400000 0.130000 0.320000 0.150000 0.326733 0.277228 0.198020 0.198020 0.504950 0.138614 0.168317 0.188119 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PB0034.1