MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF PB0029.1 Hic1_1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 16 nsites= 100 E= 0 0.280000 0.210000 0.250000 0.260000 0.138614 0.326733 0.217822 0.316832 0.150000 0.240000 0.270000 0.340000 0.653465 0.009901 0.316832 0.019802 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.040000 0.000000 0.960000 0.000000 0.000000 0.979798 0.020202 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.920000 0.070000 0.000000 0.010000 0.580000 0.210000 0.120000 0.090000 0.009901 0.920792 0.029703 0.039604 0.030000 0.800000 0.050000 0.120000 0.200000 0.190000 0.170000 0.440000 0.404040 0.151515 0.292929 0.151515 0.200000 0.410000 0.150000 0.240000 0.242424 0.333333 0.141414 0.282828 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PB0029.1 MOTIF PB0133.1 Hic1_2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 16 nsites= 99 E= 0 0.202020 0.151515 0.363636 0.282828 0.110000 0.240000 0.440000 0.210000 0.210000 0.180000 0.380000 0.230000 0.240000 0.150000 0.300000 0.310000 0.310000 0.030000 0.590000 0.070000 0.009901 0.009901 0.009901 0.970297 0.128713 0.009901 0.851485 0.009901 0.010000 0.970000 0.010000 0.010000 0.010000 0.970000 0.010000 0.010000 0.019802 0.960396 0.009901 0.009901 0.560000 0.170000 0.110000 0.160000 0.590000 0.040000 0.070000 0.300000 0.303030 0.191919 0.222222 0.282828 0.300000 0.250000 0.210000 0.240000 0.280000 0.160000 0.310000 0.250000 0.267327 0.267327 0.297030 0.168317 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PB0133.1 MOTIF PH0038.1 Hlx letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 100 E= 0 0.180000 0.490000 0.160000 0.170000 0.270000 0.440000 0.130000 0.160000 0.450000 0.220000 0.160000 0.170000 0.070000 0.130000 0.050000 0.750000 0.760000 0.080000 0.050000 0.110000 0.717172 0.010101 0.070707 0.202020 0.040000 0.060000 0.020000 0.880000 0.160000 0.120000 0.030000 0.690000 0.630000 0.030000 0.250000 0.090000 0.880000 0.020000 0.060000 0.040000 0.202020 0.070707 0.010101 0.717172 0.110000 0.050000 0.080000 0.760000 0.750000 0.050000 0.130000 0.070000 0.160000 0.410000 0.150000 0.280000 0.420000 0.270000 0.090000 0.220000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PH0038.1 MOTIF PH0040.1 Hmbox1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 17 nsites= 99 E= 0 0.252525 0.232323 0.303030 0.212121 0.366337 0.198020 0.099010 0.336634 0.435644 0.099010 0.336634 0.128713 0.455446 0.148515 0.217822 0.178218 0.470000 0.090000 0.140000 0.300000 0.010000 0.850000 0.020000 0.120000 0.009901 0.009901 0.029703 0.950495 0.707071 0.000000 0.292929 0.000000 0.010000 0.000000 0.990000 0.000000 0.000000 0.000000 0.010101 0.989899 0.110000 0.010000 0.000000 0.880000 0.940000 0.010000 0.020000 0.030000 0.640000 0.060000 0.100000 0.200000 0.130000 0.440000 0.140000 0.290000 0.330000 0.130000 0.260000 0.280000 0.252525 0.111111 0.202020 0.434343 0.070000 0.430000 0.310000 0.190000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PH0040.1 MOTIF MA0192.1 Hmx letter-probability matrix: alength= 4 w= 7 nsites= 20 E= 0 0.050000 0.150000 0.000000 0.800000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.050000 0.000000 0.000000 0.950000 0.000000 0.150000 0.000000 0.850000 0.200000 0.000000 0.800000 0.000000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0192.1 MOTIF PH0041.1 Hmx1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 17 nsites= 100 E= 0 0.340000 0.290000 0.240000 0.130000 0.170000 0.430000 0.270000 0.130000 0.360000 0.290000 0.260000 0.090000 0.690000 0.060000 0.160000 0.090000 0.130000 0.080000 0.720000 0.070000 0.010000 0.950000 0.000000 0.040000 0.870000 0.000000 0.120000 0.010000 0.880000 0.110000 0.000000 0.010000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.019802 0.059406 0.000000 0.920792 0.959596 0.000000 0.010101 0.030303 0.888889 0.010101 0.040404 0.060606 0.250000 0.150000 0.170000 0.430000 0.141414 0.222222 0.505051 0.131313 0.383838 0.292929 0.282828 0.040404 0.326733 0.128713 0.237624 0.306931 0.180000 0.200000 0.220000 0.400000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PH0041.1 MOTIF MA0896.1 Hmx1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 17 nsites= 100 E= 0 0.340000 0.290000 0.240000 0.130000 0.170000 0.430000 0.270000 0.130000 0.360000 0.290000 0.260000 0.090000 0.690000 0.060000 0.160000 0.090000 0.130000 0.080000 0.720000 0.070000 0.010000 0.950000 0.000000 0.040000 0.870000 0.000000 0.120000 0.010000 0.880000 0.110000 0.000000 0.010000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.019802 0.059406 0.000000 0.920792 0.959596 0.000000 0.010101 0.030303 0.888889 0.010101 0.040404 0.060606 0.250000 0.150000 0.170000 0.430000 0.141414 0.222222 0.505051 0.131313 0.383838 0.292929 0.282828 0.040404 0.326733 0.128713 0.237624 0.306931 0.180000 0.200000 0.220000 0.400000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0896.1 MOTIF PH0042.1 Hmx2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 17 nsites= 100 E= 0 0.500000 0.200000 0.230000 0.070000 0.190000 0.440000 0.230000 0.140000 0.550000 0.190000 0.170000 0.090000 0.762376 0.059406 0.118812 0.059406 0.170000 0.150000 0.570000 0.110000 0.010101 0.979798 0.000000 0.010101 0.850000 0.000000 0.150000 0.000000 0.850000 0.130000 0.010000 0.010000 0.010000 0.000000 0.000000 0.990000 0.019802 0.059406 0.000000 0.920792 0.939394 0.000000 0.010101 0.050505 0.890000 0.010000 0.020000 0.080000 0.360000 0.190000 0.110000 0.340000 0.247525 0.207921 0.405941 0.138614 0.410000 0.270000 0.270000 0.050000 0.470000 0.100000 0.250000 0.180000 0.090909 0.070707 0.090909 0.747475 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PH0042.1 MOTIF MA0897.1 Hmx2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 17 nsites= 100 E= 0 0.500000 0.200000 0.230000 0.070000 0.190000 0.440000 0.230000 0.140000 0.550000 0.190000 0.170000 0.090000 0.762376 0.059406 0.118812 0.059406 0.170000 0.150000 0.570000 0.110000 0.010101 0.979798 0.000000 0.010101 0.850000 0.000000 0.150000 0.000000 0.850000 0.130000 0.010000 0.010000 0.010000 0.000000 0.000000 0.990000 0.019802 0.059406 0.000000 0.920792 0.939394 0.000000 0.010101 0.050505 0.890000 0.010000 0.020000 0.080000 0.360000 0.190000 0.110000 0.340000 0.247525 0.207921 0.405941 0.138614 0.410000 0.270000 0.270000 0.050000 0.470000 0.100000 0.250000 0.180000 0.090909 0.070707 0.090909 0.747475 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0897.1 MOTIF PH0043.1 Hmx3 letter-probability matrix: alength= 4 w= 17 nsites= 100 E= 0 0.490000 0.210000 0.210000 0.090000 0.121212 0.494949 0.252525 0.131313 0.480000 0.230000 0.190000 0.100000 0.760000 0.070000 0.110000 0.060000 0.151515 0.101010 0.595960 0.151515 0.020000 0.940000 0.000000 0.040000 0.831683 0.000000 0.158416 0.009901 0.870000 0.120000 0.000000 0.010000 0.010000 0.000000 0.000000 0.990000 0.010101 0.040404 0.000000 0.949495 0.929293 0.000000 0.020202 0.050505 0.878788 0.020202 0.030303 0.070707 0.386139 0.148515 0.118812 0.346535 0.260000 0.180000 0.380000 0.180000 0.470000 0.210000 0.260000 0.060000 0.520000 0.110000 0.180000 0.190000 0.130000 0.100000 0.130000 0.640000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PH0043.1