MEME version 4

ALPHABET= ACGT

strands: + -

Background letter frequencies
A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25

MOTIF MA0770.1 HSF2
letter-probability matrix: alength= 4 w= 13 nsites= 3488 E= 0
 0.049599  0.010608  0.026089  0.913704
 0.007057  0.000614  0.014422  0.977907
 0.004992  0.994384  0.000624  0.000000
 0.000239  0.169411  0.069912  0.760439
 0.701364  0.124340  0.174296  0.000000
 0.000627  0.000000  0.999060  0.000313
 0.975214  0.014994  0.001224  0.008568
 0.960229  0.000301  0.006930  0.032540
 0.053342  0.441167  0.197678  0.307813
 0.313461  0.146847  0.379354  0.160339
 0.040746  0.019512  0.025251  0.914491
 0.013377  0.026457  0.012782  0.947384
 0.023689  0.848283  0.031142  0.096886
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0770.1

MOTIF MA0771.1 HSF4
letter-probability matrix: alength= 4 w= 13 nsites= 14127 E= 0
 0.135768  0.072627  0.078998  0.712607
 0.061326  0.007666  0.082975  0.848033
 0.009089  0.973409  0.010733  0.006769
 0.003501  0.244438  0.183625  0.568436
 0.532589  0.212253  0.253412  0.001746
 0.000297  0.001189  0.997721  0.000793
 0.854221  0.070598  0.004158  0.071022
 0.805102  0.033109  0.029511  0.132278
 0.134698  0.366147  0.216946  0.282209
 0.258468  0.220522  0.330287  0.190722
 0.109276  0.023565  0.031862  0.835297
 0.030180  0.007545  0.012827  0.949448
 0.009353  0.960775  0.009544  0.020328
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0771.1

MOTIF MA0551.1 HY5
letter-probability matrix: alength= 4 w= 16 nsites= 320 E= 0
 0.321875  0.187500  0.212500  0.278125
 0.337500  0.175000  0.193750  0.293750
 0.162500  0.171875  0.093750  0.571875
 0.028125  0.025000  0.871875  0.075000
 0.468750  0.515625  0.003125  0.012500
 0.000000  0.990625  0.003125  0.006250
 0.968750  0.003125  0.028125  0.000000
 0.009375  0.971875  0.015625  0.003125
 0.003125  0.015625  0.971875  0.009375
 0.000000  0.028125  0.003125  0.968750
 0.006250  0.003125  0.990625  0.000000
 0.012500  0.003125  0.515625  0.468750
 0.075000  0.871875  0.025000  0.028125
 0.571875  0.093750  0.171875  0.162500
 0.293750  0.193750  0.175000  0.337500
 0.278125  0.212500  0.187500  0.321875
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0551.1

MOTIF MA0092.1 Hand1::Tcf3
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 29 E= 0
 0.137931  0.275862  0.344828  0.241379
 0.344828  0.000000  0.517241  0.137931
 0.068966  0.068966  0.034483  0.827586
 0.000000  0.965517  0.000000  0.034483
 0.000000  0.000000  0.000000  1.000000
 0.000000  0.000000  1.000000  0.000000
 0.000000  0.103448  0.862069  0.034483
 0.310345  0.482759  0.034483  0.172414
 0.551724  0.000000  0.103448  0.344828
 0.172414  0.137931  0.137931  0.551724
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0092.1

MOTIF PB0028.1 Hbp1_1
letter-probability matrix: alength= 4 w= 16 nsites= 101 E= 0
 0.346535  0.178218  0.158416  0.316832
 0.240000  0.300000  0.230000  0.230000
 0.300000  0.180000  0.190000  0.330000
 0.414141  0.141414  0.101010  0.343434
 0.030303  0.020202  0.000000  0.949495
 0.020000  0.330000  0.640000  0.010000
 0.970000  0.000000  0.010000  0.020000
 0.979798  0.000000  0.000000  0.020202
 0.010101  0.000000  0.000000  0.989899
 0.010000  0.020000  0.930000  0.040000
 0.760000  0.000000  0.230000  0.010000
 0.870000  0.040000  0.070000  0.020000
 0.111111  0.111111  0.040404  0.737374
 0.190000  0.150000  0.440000  0.220000
 0.370000  0.150000  0.260000  0.220000
 0.220000  0.260000  0.240000  0.280000
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PB0028.1

MOTIF PB0132.1 Hbp1_2
letter-probability matrix: alength= 4 w= 17 nsites= 100 E= 0
 0.310000  0.150000  0.200000  0.340000
 0.262626  0.151515  0.333333  0.252525
 0.180000  0.140000  0.290000  0.390000
 0.050000  0.360000  0.180000  0.410000
 0.090909  0.727273  0.090909  0.090909
 0.101010  0.727273  0.040404  0.131313
 0.059406  0.782178  0.029703  0.128713
 0.900000  0.020000  0.020000  0.060000
 0.040404  0.040404  0.020202  0.898990
 0.040404  0.010101  0.010101  0.939394
 0.100000  0.030000  0.710000  0.160000
 0.059406  0.049505  0.138614  0.752475
 0.300000  0.280000  0.320000  0.100000
 0.260000  0.260000  0.200000  0.280000
 0.565657  0.121212  0.191919  0.121212
 0.100000  0.360000  0.310000  0.230000
 0.270000  0.230000  0.200000  0.300000
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PB0132.1

MOTIF PH0037.1 Hdx
letter-probability matrix: alength= 4 w= 17 nsites= 99 E= 0
 0.313131  0.202020  0.212121  0.272727
 0.340000  0.180000  0.260000  0.220000
 0.049505  0.089109  0.514851  0.346535
 0.200000  0.120000  0.350000  0.330000
 0.297030  0.306931  0.158416  0.237624
 0.212121  0.020202  0.727273  0.040404
 0.700000  0.230000  0.050000  0.020000
 0.830000  0.010000  0.060000  0.100000
 0.910891  0.009901  0.029703  0.049505
 0.020000  0.020000  0.030000  0.930000
 0.030000  0.900000  0.040000  0.030000
 0.868687  0.040404  0.010101  0.080808
 0.178218  0.217822  0.158416  0.445545
 0.230000  0.330000  0.200000  0.240000
 0.138614  0.297030  0.306931  0.257426
 0.336634  0.346535  0.059406  0.257426
 0.400000  0.230000  0.190000  0.180000
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PH0037.1

MOTIF MA1099.1 Hes1
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 1000 E= 0
 0.187000  0.258000  0.377000  0.178000
 0.209000  0.299000  0.396000  0.096000
 0.040000  0.875000  0.014000  0.071000
 0.743744  0.033033  0.141141  0.082082
 0.029000  0.833000  0.056000  0.082000
 0.164835  0.040959  0.768232  0.025974
 0.115884  0.469530  0.066933  0.347652
 0.058000  0.113000  0.661000  0.168000
 0.226000  0.302000  0.151000  0.321000
 0.217217  0.384384  0.198198  0.200200
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1099.1

MOTIF MA0616.1 Hes2
letter-probability matrix: alength= 4 w= 13 nsites= 999 E= 0
 0.214214  0.214214  0.214214  0.357357
 0.341341  0.197197  0.197197  0.264264
 0.341341  0.197197  0.197197  0.264264
 0.245000  0.333000  0.245000  0.177000
 0.083000  0.152000  0.682000  0.083000
 0.603000  0.000000  0.397000  0.000000
 0.282000  0.718000  0.000000  0.000000
 0.930000  0.000000  0.070000  0.000000
 0.174000  0.754000  0.036000  0.036000
 0.123000  0.053000  0.771000  0.053000
 0.053000  0.053000  0.053000  0.841000
 0.143000  0.073000  0.711000  0.073000
 0.238000  0.428000  0.167000  0.167000
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0616.1

MOTIF MA0739.1 Hic1
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 12392 E= 0
 0.511378  0.058021  0.376856  0.053744
 0.005361  0.036493  0.006313  0.951833
 0.074639  0.046197  0.864786  0.014378
 0.004473  0.984702  0.010825  0.000000
 0.007861  0.983295  0.002769  0.006075
 0.795268  0.176481  0.000265  0.027986
 0.557827  0.180431  0.205960  0.055783
 0.079510  0.717349  0.106165  0.096976
 0.146257  0.438045  0.171148  0.244549
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0739.1

