MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF MA0114.1 HNF4A letter-probability matrix: alength= 4 w= 13 nsites= 67 E= 0 0.417910 0.104478 0.402985 0.074627 0.029851 0.029851 0.835821 0.104478 0.179104 0.059701 0.522388 0.238806 0.074627 0.343284 0.298507 0.283582 0.044776 0.761194 0.059701 0.134328 0.880597 0.014925 0.044776 0.059701 0.791045 0.029851 0.149254 0.029851 0.835821 0.014925 0.119403 0.029851 0.059701 0.059701 0.865672 0.014925 0.089552 0.029851 0.492537 0.388060 0.044776 0.328358 0.164179 0.462687 0.059701 0.731343 0.074627 0.134328 0.626866 0.104478 0.149254 0.119403 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0114.1 MOTIF MA0114.2 HNF4A letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 16768 E= 0 0.164957 0.356095 0.236999 0.241949 0.103232 0.042939 0.054091 0.799738 0.049917 0.003042 0.942867 0.004175 0.362297 0.110091 0.499165 0.028447 0.657562 0.263896 0.019621 0.058922 0.006978 0.986104 0.003996 0.002922 0.001551 0.097209 0.000000 0.901240 0.010615 0.157264 0.021887 0.810234 0.000000 0.010317 0.024272 0.965410 0.051527 0.002087 0.938752 0.007634 0.314289 0.223342 0.318464 0.143905 0.364921 0.337130 0.099117 0.198831 0.068941 0.804568 0.020992 0.105499 0.111522 0.387524 0.024750 0.476205 0.123449 0.384661 0.178972 0.312917 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0114.2 MOTIF MA0484.1 HNF4G letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 9452 E= 0 0.371773 0.197207 0.212759 0.218261 0.344795 0.161976 0.405205 0.088024 0.496826 0.010791 0.403195 0.089187 0.116695 0.021265 0.791367 0.070673 0.205671 0.075434 0.349238 0.369657 0.159860 0.303639 0.241113 0.295387 0.000000 0.933876 0.023381 0.042742 0.988468 0.005819 0.005713 0.000000 0.834638 0.008675 0.156686 0.000000 0.895472 0.000000 0.099238 0.005290 0.010474 0.000635 0.962548 0.026344 0.034278 0.015129 0.383411 0.567182 0.023804 0.458950 0.117118 0.400127 0.016822 0.886267 0.008993 0.087918 0.717837 0.084003 0.058824 0.139336 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0484.1 MOTIF MA0899.1 HOXA10 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 8382 E= 0 0.276187 0.169769 0.357075 0.196970 0.174410 0.126367 0.602776 0.096447 0.017803 0.449965 0.006865 0.525367 0.563391 0.303576 0.068701 0.064332 0.853375 0.046329 0.073109 0.027187 0.041900 0.001256 0.000000 0.956844 0.694072 0.009782 0.014091 0.282054 0.944125 0.004055 0.008561 0.043258 0.891122 0.060393 0.013291 0.035194 0.595199 0.147859 0.110788 0.146154 0.359981 0.249254 0.146761 0.244004 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0899.1 MOTIF MA0650.1 HOXA13 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 384 E= 0 0.161458 0.643229 0.184896 0.010417 0.002625 0.648294 0.020997 0.328084 0.669377 0.189702 0.024390 0.116531 0.888489 0.000000 0.000000 0.111511 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.894928 0.032609 0.018116 0.054348 0.939163 0.000000 0.000000 0.060837 0.988000 0.012000 0.000000 0.000000 0.641558 0.155844 0.114286 0.088312 0.421053 0.291498 0.093117 0.194332 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0650.1 MOTIF MA0900.1 HOXA2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 8986 E= 0 0.244380 0.291453 0.263744 0.200423 0.175161 0.377699 0.296350 0.150790 0.087082 0.265667 0.049308 0.597943 0.595265 0.317854 0.066152 0.020730 0.911165 0.034885 0.049792 0.004158 0.000000 0.000000 0.000667 0.999333 0.015491 0.119985 0.000000 0.864524 0.947085 0.014230 0.003268 0.035417 0.243517 0.317084 0.316082 0.123317 0.182506 0.421322 0.227020 0.169152 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0900.1 MOTIF MA0158.1 HOXA5 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 15 E= 0 0.133333 0.866667 0.000000 0.000000 0.437500 0.000000 0.312500 0.250000 0.000000 0.437500 0.312500 0.250000 0.375000 0.000000 0.062500 0.562500 0.875000 0.000000 0.000000 0.125000 0.875000 0.000000 0.125000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.062500 0.375000 0.562500 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0158.1 MOTIF MA0901.1 HOXB13 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 3737 E= 0 0.074124 0.744180 0.138614 0.043083 0.032204 0.772071 0.003887 0.191838 0.644645 0.231803 0.002782 0.120770 0.944312 0.007470 0.012903 0.035314 0.000000 0.002511 0.000000 0.997489 0.887648 0.007022 0.008299 0.097032 0.993924 0.000000 0.000000 0.006076 0.966632 0.026764 0.000348 0.006257 0.723465 0.143080 0.043704 0.089750 0.355268 0.364617 0.069040 0.211075 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0901.1 MOTIF MA0902.1 HOXB2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 6678 E= 0 0.282570 0.225367 0.267296 0.224768 0.214254 0.286570 0.326995 0.172181 0.129120 0.249475 0.046414 0.574991 0.575861 0.302261 0.095057 0.026821 0.912058 0.025536 0.051482 0.010924 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.058104 0.093522 0.006554 0.841820 0.919972 0.024518 0.004683 0.050826 0.324599 0.195987 0.313071 0.166342 0.239707 0.321306 0.236712 0.202276 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0902.1 MOTIF MA0903.1 HOXB3 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 12899 E= 0 0.348864 0.195829 0.244283 0.211024 0.198015 0.321368 0.310513 0.170104 0.114383 0.326556 0.039614 0.519446 0.539906 0.353748 0.058057 0.048289 0.900391 0.038043 0.044674 0.016892 0.000000 0.011495 0.000000 0.988505 0.031102 0.059172 0.000000 0.909726 0.949014 0.008755 0.000000 0.042231 0.352120 0.164276 0.366850 0.116753 0.248004 0.309714 0.231103 0.211179 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0903.1