MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF MA0895.1 HMBOX1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 1231 E= 0 0.395613 0.364744 0.157595 0.082047 0.079324 0.444083 0.120936 0.355657 0.053802 0.017934 0.045194 0.883070 0.749695 0.000000 0.223508 0.026797 0.001552 0.039566 0.955004 0.003879 0.020586 0.000792 0.003959 0.974663 0.155308 0.032765 0.005242 0.806684 0.909158 0.002954 0.012555 0.075332 0.501666 0.318454 0.086609 0.093271 0.164094 0.440292 0.300569 0.095045 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0895.1 MOTIF MF0011.1 HMG class letter-probability matrix: alength= 4 w= 6 nsites= 100 E= 0 0.604240 0.089991 0.000000 0.305769 0.016802 0.063406 0.140314 0.779478 0.016100 0.049600 0.009200 0.925100 0.112900 0.066500 0.745300 0.075300 0.122800 0.083800 0.031400 0.762000 0.100500 0.175400 0.107000 0.617100 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MF0011.1 MOTIF MA0044.1 HMG-1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 13 E= 0 0.000000 0.384615 0.615385 0.000000 0.000000 0.000000 0.230769 0.769231 0.000000 0.307692 0.000000 0.692308 0.000000 0.153846 0.769231 0.076923 0.000000 0.076923 0.000000 0.923077 0.461538 0.076923 0.230769 0.230769 0.230769 0.384615 0.000000 0.384615 0.000000 0.076923 0.153846 0.769231 0.000000 0.615385 0.076923 0.307692 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0044.1 MOTIF MA0045.1 HMG-I/Y letter-probability matrix: alength= 4 w= 16 nsites= 14 E= 0 0.214286 0.357143 0.285714 0.142857 0.500000 0.000000 0.214286 0.285714 0.642857 0.071429 0.071429 0.214286 0.214286 0.428571 0.285714 0.071429 0.785714 0.000000 0.214286 0.000000 0.785714 0.000000 0.142857 0.071429 0.785714 0.000000 0.142857 0.071429 0.214286 0.214286 0.142857 0.428571 0.285714 0.071429 0.571429 0.071429 0.214286 0.285714 0.428571 0.071429 0.571429 0.357143 0.071429 0.000000 0.571429 0.071429 0.285714 0.071429 0.642857 0.000000 0.142857 0.214286 0.642857 0.357143 0.000000 0.000000 0.785714 0.000000 0.214286 0.000000 0.142857 0.500000 0.000000 0.357143 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0045.1 MOTIF MA0327.1 HMRA1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 7 nsites= 202 E= 0 0.500000 0.000000 0.500000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0327.1 MOTIF MA0318.1 HMRA2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 0 0.060000 0.670000 0.060000 0.210000 0.540000 0.000000 0.460000 0.000000 0.040000 0.000000 0.000000 0.960000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.930000 0.000000 0.000000 0.070000 0.871287 0.019802 0.019802 0.089109 0.400000 0.080000 0.080000 0.440000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0318.1 MOTIF MA0046.1 HNF1A letter-probability matrix: alength= 4 w= 14 nsites= 21 E= 0 0.238095 0.000000 0.666667 0.095238 0.047619 0.000000 0.952381 0.000000 0.047619 0.000000 0.000000 0.952381 0.047619 0.000000 0.000000 0.952381 0.952381 0.000000 0.000000 0.047619 0.761905 0.095238 0.047619 0.095238 0.047619 0.000000 0.000000 0.952381 0.380952 0.095238 0.190476 0.333333 0.666667 0.000000 0.047619 0.285714 0.095238 0.000000 0.000000 0.904762 0.000000 0.190476 0.000000 0.809524 0.619048 0.047619 0.142857 0.190476 0.380952 0.380952 0.142857 0.095238 0.238095 0.619048 0.000000 0.142857 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0046.1 MOTIF MA0046.2 HNF1A letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 14149 E= 0 0.368153 0.172521 0.246661 0.212665 0.459276 0.027303 0.471579 0.041842 0.022804 0.064289 0.054767 0.858139 0.147343 0.109723 0.027507 0.715427 0.981751 0.000208 0.017069 0.000971 0.933681 0.041771 0.000528 0.024020 0.080363 0.026683 0.000442 0.892512 0.236076 0.265055 0.320893 0.177976 0.934051 0.000594 0.022379 0.042976 0.045235 0.000827 0.053760 0.900178 0.002912 0.015808 0.000277 0.981003 0.814988 0.013651 0.077012 0.094349 0.878111 0.043133 0.067958 0.010799 0.086481 0.822329 0.038068 0.053121 0.280727 0.242208 0.160789 0.316277 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0046.2 MOTIF MA0153.1 HNF1B letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 9 E= 0 0.000000 0.333333 0.000000 0.666667 0.000000 0.333333 0.000000 0.666667 0.888889 0.111111 0.000000 0.000000 0.777778 0.111111 0.111111 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.555556 0.000000 0.444444 0.000000 0.333333 0.000000 0.111111 0.555556 0.000000 0.000000 0.111111 0.888889 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.888889 0.000000 0.111111 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.888889 0.000000 0.111111 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0153.1 MOTIF MA0153.2 HNF1B letter-probability matrix: alength= 4 w= 13 nsites= 35025 E= 0 0.043626 0.029408 0.880485 0.046481 0.015297 0.072160 0.040547 0.871996 0.140396 0.084924 0.019063 0.755617 0.985303 0.000415 0.012716 0.001566 0.941534 0.035507 0.004274 0.018685 0.057757 0.024036 0.001961 0.916246 0.210844 0.299501 0.312147 0.177508 0.947173 0.002242 0.018428 0.032157 0.038722 0.012175 0.046507 0.902596 0.002533 0.021054 0.000032 0.976381 0.770532 0.019839 0.131699 0.077930 0.888809 0.042424 0.057065 0.011701 0.053668 0.513117 0.021737 0.411477 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0153.2