MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF PH0036.1 Gsx2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 16 nsites= 100 E= 0 0.470000 0.180000 0.230000 0.120000 0.180000 0.320000 0.330000 0.170000 0.250000 0.090000 0.550000 0.110000 0.130000 0.260000 0.240000 0.370000 0.010000 0.100000 0.000000 0.890000 0.950000 0.030000 0.010000 0.010000 0.979798 0.000000 0.000000 0.020202 0.020202 0.000000 0.000000 0.979798 0.010000 0.010000 0.030000 0.950000 0.890000 0.000000 0.100000 0.010000 0.202020 0.131313 0.555556 0.111111 0.110000 0.550000 0.090000 0.250000 0.168317 0.277228 0.227723 0.326733 0.180000 0.300000 0.330000 0.190000 0.750000 0.040000 0.120000 0.090000 0.181818 0.121212 0.323232 0.373737 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PH0036.1 MOTIF MA0448.1 H2.0 letter-probability matrix: alength= 4 w= 7 nsites= 32 E= 0 0.187500 0.093750 0.125000 0.593750 0.062500 0.031250 0.000000 0.906250 0.500000 0.031250 0.031250 0.437500 0.968750 0.000000 0.000000 0.031250 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.250000 0.000000 0.281250 0.468750 0.750000 0.000000 0.218750 0.031250 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0448.1 MOTIF MA0310.1 HAC1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 101 E= 0 0.237624 0.059406 0.554455 0.148515 0.680000 0.320000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.270000 0.180000 0.410000 0.140000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0310.1 MOTIF MA0311.1 HAL9 letter-probability matrix: alength= 4 w= 5 nsites= 99 E= 0 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.626263 0.000000 0.373737 0.000000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0311.1 MOTIF MA0312.1 HAP1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 0 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.890000 0.000000 0.110000 0.000000 0.050000 0.260000 0.530000 0.160000 0.510000 0.040000 0.040000 0.410000 0.040000 0.040000 0.040000 0.880000 0.570000 0.110000 0.110000 0.210000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0312.1 MOTIF MA0313.1 HAP2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 5 nsites= 3939 E= 0 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.010160 0.989840 0.005578 0.000000 0.994422 0.000000 0.000000 0.000000 0.998223 0.001777 0.158006 0.378979 0.030665 0.432350 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0313.1 MOTIF MA0314.1 HAP3 letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 2832 E= 0 0.000000 0.182203 0.189619 0.628178 0.120600 0.676010 0.097132 0.106258 0.000000 0.162324 0.000000 0.837676 0.033198 0.303862 0.498984 0.163957 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.488610 0.000000 0.511390 0.033117 0.399112 0.138272 0.429498 0.259295 0.376603 0.332692 0.031410 0.489262 0.088926 0.308054 0.113758 0.357213 0.087414 0.443970 0.111403 0.503021 0.191415 0.094118 0.211447 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0314.1 MOTIF MA0316.1 HAP5 letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 4398 E= 0 0.145748 0.212597 0.234879 0.406776 0.046307 0.443158 0.488076 0.022459 0.024868 0.332967 0.546875 0.095290 0.180704 0.248742 0.471450 0.099103 0.385775 0.308068 0.093418 0.212739 0.028694 0.143922 0.287619 0.539765 0.021314 0.695737 0.147238 0.135711 0.000000 0.158622 0.000000 0.841378 0.118230 0.287979 0.419199 0.174593 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.056304 0.943696 0.092695 0.000000 0.907305 0.000000 0.085081 0.117134 0.736036 0.061749 0.000000 0.381225 0.000000 0.618775 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0316.1 MOTIF MA1024.1 HAT1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 1000 E= 0 0.149000 0.374000 0.328000 0.149000 0.069000 0.506000 0.069000 0.356000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.098000 0.000000 0.000000 0.902000 0.101000 0.101000 0.286000 0.512000 0.349000 0.181000 0.289000 0.181000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1024.1 MOTIF MA1198.1 HAT2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 598 E= 0 0.501672 0.038462 0.071906 0.387960 0.183946 0.311037 0.187291 0.317726 0.000000 0.416388 0.000000 0.583612 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.904682 0.000000 0.095318 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.188963 0.020067 0.000000 0.790970 0.190635 0.070234 0.060201 0.678930 0.382943 0.086957 0.219064 0.311037 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1198.1