MEME version 4

ALPHABET= ACGT

strands: + -

Background letter frequencies
A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25

MOTIF MA0943.1 ARF5
letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 999 E= 0
 0.303303  0.160160  0.477477  0.059059
 0.008991  0.968032  0.014985  0.007992
 0.096903  0.897103  0.003996  0.001998
 0.012000  0.001000  0.985000  0.002000
 0.952000  0.001000  0.046000  0.001000
 0.002000  0.992000  0.003000  0.003000
 0.772228  0.223776  0.001998  0.001998
 0.491000  0.098000  0.218000  0.193000
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0943.1

MOTIF MA0944.1 ARF8
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 1000 E= 0
 0.270000  0.233000  0.204000  0.293000
 0.225000  0.259000  0.106000  0.410000
 0.004000  0.000000  0.090000  0.906000
 0.038038  0.001001  0.900901  0.060060
 0.000000  0.013000  0.000000  0.987000
 0.053946  0.862138  0.001998  0.081918
 0.061000  0.027000  0.798000  0.114000
 0.121121  0.138138  0.651652  0.089089
 0.227772  0.336663  0.216783  0.218781
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0944.1

MOTIF MA0271.1 ARG80
letter-probability matrix: alength= 4 w= 6 nsites= 158 E= 0
 0.563291  0.000000  0.000000  0.436709
 0.000000  0.000000  1.000000  0.000000
 1.000000  0.000000  0.000000  0.000000
 0.000000  1.000000  0.000000  0.000000
 0.229167  0.000000  0.411458  0.359375
 0.000000  0.927536  0.000000  0.072464
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0271.1

MOTIF MA0272.1 ARG81
letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 198 E= 0
 0.297980  0.060606  0.419192  0.222222
 0.036585  0.000000  0.024390  0.939024
 0.077220  0.000000  0.922780  0.000000
 1.000000  0.000000  0.000000  0.000000
 0.000000  0.996324  0.000000  0.003676
 0.006061  0.000000  0.000000  0.993939
 0.000000  1.000000  0.000000  0.000000
 0.317204  0.317204  0.021505  0.344086
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0272.1

MOTIF PF0065.1 ARGGGTTAA
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 348 E= 0
 1.000000  0.000000  0.000000  0.000000
 0.551724  0.000000  0.448276  0.000000
 0.000000  0.000000  1.000000  0.000000
 0.000000  0.000000  1.000000  0.000000
 0.000000  0.000000  1.000000  0.000000
 0.000000  0.000000  0.000000  1.000000
 0.000000  0.000000  0.000000  1.000000
 1.000000  0.000000  0.000000  0.000000
 1.000000  0.000000  0.000000  0.000000
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PF0065.1

MOTIF MA0259.1 ARNT::HIF1A
letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 104 E= 0
 0.259615  0.269231  0.471154  0.000000
 0.096154  0.278846  0.326923  0.298077
 0.750000  0.019231  0.221154  0.009615
 0.000000  0.990385  0.000000  0.009615
 0.000000  0.000000  1.000000  0.000000
 0.000000  0.000000  0.000000  1.000000
 0.000000  0.000000  1.000000  0.000000
 0.173077  0.490385  0.192308  0.144231
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0259.1

MOTIF MA0273.1 ARO80
letter-probability matrix: alength= 4 w= 21 nsites= 998 E= 0
 0.102204  0.155311  0.532064  0.210421
 0.330661  0.193387  0.301603  0.174349
 0.126253  0.232465  0.317635  0.323647
 0.407407  0.253253  0.203203  0.136136
 0.390782  0.193387  0.229459  0.186373
 0.310621  0.198397  0.135271  0.355711
 0.083083  0.154154  0.336336  0.426426
 0.040040  0.744745  0.030030  0.185185
 0.005015  0.231695  0.008024  0.755266
 0.005010  0.988978  0.001002  0.005010
 0.001001  0.022022  0.975976  0.001001
 0.001002  0.005010  0.991984  0.002004
 0.015030  0.359719  0.295591  0.329659
 0.671343  0.004008  0.006012  0.318637
 0.690691  0.068068  0.060060  0.181181
 0.105210  0.222445  0.372745  0.299599
 0.269269  0.119119  0.193193  0.418418
 0.353707  0.210421  0.205411  0.230461
 0.257257  0.217217  0.178178  0.347347
 0.236473  0.103206  0.349699  0.310621
 0.278557  0.252505  0.170341  0.298597
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0273.1

MOTIF MA0274.1 ARR1
letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 160 E= 0
 1.000000  0.000000  0.000000  0.000000
 0.119403  0.373134  0.144279  0.363184
 0.160428  0.374332  0.000000  0.465241
 0.000000  0.000000  0.000000  1.000000
 0.311966  0.000000  0.688034  0.000000
 0.708791  0.225275  0.065934  0.000000
 0.810651  0.000000  0.171598  0.017751
 0.067073  0.000000  0.146341  0.786585
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0274.1

MOTIF MA0945.1 ARR1
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 1000 E= 0
 0.406000  0.168000  0.208000  0.218000
 0.172172  0.292292  0.343343  0.192192
 0.296703  0.465534  0.138861  0.098901
 0.306000  0.083000  0.564000  0.047000
 0.423000  0.022000  0.235000  0.320000
 0.965966  0.000000  0.000000  0.034034
 0.021000  0.001000  0.001000  0.977000
 0.056000  0.897000  0.004000  0.043000
 0.143143  0.156156  0.091091  0.609610
 0.257000  0.190000  0.181000  0.372000
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0945.1

MOTIF MA0121.1 ARR10
letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 15 E= 0
 0.933333  0.066667  0.000000  0.000000
 0.000000  0.000000  1.000000  0.000000
 0.933333  0.000000  0.066667  0.000000
 0.000000  0.000000  0.000000  1.000000
 0.266667  0.400000  0.000000  0.333333
 0.066667  0.533333  0.000000  0.400000
 0.000000  0.000000  0.600000  0.400000
 0.200000  0.400000  0.266667  0.133333
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0121.1

