MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF MA0852.1 Foxk1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 17 nsites= 100 E= 0 0.340000 0.190000 0.210000 0.260000 0.405941 0.118812 0.277228 0.198020 0.600000 0.070000 0.120000 0.210000 0.710000 0.040000 0.050000 0.200000 0.120000 0.120000 0.180000 0.580000 0.200000 0.010000 0.790000 0.000000 0.020202 0.000000 0.000000 0.979798 0.920000 0.080000 0.000000 0.000000 0.970000 0.010000 0.000000 0.020000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.890000 0.000000 0.110000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.808081 0.060606 0.020202 0.111111 0.565657 0.090909 0.101010 0.242424 0.270000 0.300000 0.290000 0.140000 0.340000 0.220000 0.250000 0.190000 0.151515 0.272727 0.323232 0.252525 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0852.1 MOTIF PB0018.1 Foxk1_1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 17 nsites= 100 E= 0 0.340000 0.190000 0.210000 0.260000 0.405941 0.118812 0.277228 0.198020 0.600000 0.070000 0.120000 0.210000 0.710000 0.040000 0.050000 0.200000 0.120000 0.120000 0.180000 0.580000 0.200000 0.010000 0.790000 0.000000 0.020202 0.000000 0.000000 0.979798 0.920000 0.080000 0.000000 0.000000 0.970000 0.010000 0.000000 0.020000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.890000 0.000000 0.110000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.808081 0.060606 0.020202 0.111111 0.565657 0.090909 0.101010 0.242424 0.270000 0.300000 0.290000 0.140000 0.340000 0.220000 0.250000 0.190000 0.151515 0.272727 0.323232 0.252525 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PB0018.1 MOTIF PB0122.1 Foxk1_2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 100 E= 0 0.240000 0.430000 0.140000 0.190000 0.366337 0.247525 0.118812 0.267327 0.490000 0.220000 0.110000 0.180000 0.740000 0.040000 0.150000 0.070000 0.080000 0.550000 0.030000 0.340000 0.590000 0.290000 0.080000 0.040000 0.910000 0.030000 0.050000 0.010000 0.010000 0.570000 0.010000 0.410000 0.950000 0.020000 0.020000 0.010000 0.900000 0.020000 0.030000 0.050000 0.079208 0.792079 0.029703 0.099010 0.828283 0.040404 0.050505 0.080808 0.252525 0.343434 0.141414 0.262626 0.320000 0.340000 0.130000 0.210000 0.230000 0.260000 0.170000 0.340000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PB0122.1 MOTIF PB0019.1 Foxl1_1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 17 nsites= 100 E= 0 0.320000 0.150000 0.190000 0.340000 0.425743 0.059406 0.099010 0.415842 0.660000 0.040000 0.040000 0.260000 0.650000 0.050000 0.080000 0.220000 0.210000 0.080000 0.070000 0.640000 0.340000 0.000000 0.650000 0.010000 0.020000 0.000000 0.000000 0.980000 0.950000 0.050000 0.000000 0.000000 0.990000 0.000000 0.000000 0.010000 0.990000 0.000000 0.010000 0.000000 0.000000 0.787879 0.000000 0.212121 0.990000 0.000000 0.000000 0.010000 0.800000 0.040000 0.020000 0.140000 0.530000 0.090000 0.110000 0.270000 0.210000 0.270000 0.370000 0.150000 0.280000 0.220000 0.340000 0.160000 0.150000 0.250000 0.290000 0.310000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PB0019.1 MOTIF PB0123.1 Foxl1_2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 16 nsites= 99 E= 0 0.565657 0.121212 0.080808 0.232323 0.320000 0.150000 0.180000 0.350000 0.480000 0.120000 0.170000 0.230000 0.200000 0.160000 0.190000 0.450000 0.030000 0.570000 0.020000 0.380000 0.640000 0.170000 0.020000 0.170000 0.570000 0.110000 0.010000 0.310000 0.898990 0.050505 0.010101 0.040404 0.910000 0.030000 0.030000 0.030000 0.010101 0.747475 0.020202 0.222222 0.910000 0.020000 0.030000 0.040000 0.700000 0.070000 0.080000 0.150000 0.445545 0.316832 0.059406 0.178218 0.590000 0.130000 0.140000 0.140000 0.260000 0.330000 0.170000 0.240000 0.360000 0.330000 0.150000 0.160000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PB0123.1 MOTIF MA0480.1 Foxo1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 2490 E= 0 0.187952 0.111245 0.191968 0.508835 0.051004 0.513655 0.302008 0.133333 0.034940 0.564659 0.083936 0.316466 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.115261 0.884739 0.751406 0.063052 0.000000 0.185542 0.000000 0.806024 0.000000 0.193976 0.430522 0.230120 0.028514 0.310843 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0480.1 MOTIF MA0040.1 Foxq1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 18 E= 0 0.222222 0.222222 0.166667 0.388889 0.722222 0.055556 0.166667 0.055556 0.277778 0.111111 0.000000 0.611111 0.166667 0.000000 0.000000 0.833333 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.944444 0.000000 0.055556 0.000000 0.000000 0.055556 0.222222 0.722222 0.333333 0.000000 0.166667 0.500000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0040.1 MOTIF PF0137.1 GAANYNYGACNY letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 216 E= 0 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.416667 0.287037 0.152778 0.143519 0.000000 0.462963 0.000000 0.537037 0.134259 0.439815 0.175926 0.250000 0.000000 0.222222 0.000000 0.777778 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.254630 0.379630 0.125000 0.240741 0.000000 0.486111 0.000000 0.513889 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PF0137.1 MOTIF MA0062.1 GABPA letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 7 E= 0 0.714286 0.142857 0.142857 0.000000 0.142857 0.714286 0.142857 0.000000 0.142857 0.857143 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.428571 0.142857 0.142857 0.285714 0.000000 0.285714 0.571429 0.142857 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0062.1 MOTIF MA0299.1 GAL4 letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 2779 E= 0 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.155983 0.809473 0.034544 0.252844 0.212870 0.301267 0.233019 0.094867 0.369396 0.373944 0.161793 0.316361 0.251475 0.311084 0.121080 0.786218 0.000000 0.180840 0.032941 0.197768 0.452040 0.282525 0.067667 0.640871 0.112228 0.000000 0.246901 0.206002 0.185058 0.545170 0.063770 0.030544 0.244034 0.157175 0.568247 0.366083 0.161765 0.345745 0.126408 0.000000 0.480602 0.243813 0.275585 0.077125 0.128651 0.137512 0.656712 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0299.1