MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF MA0557.1 FHY3 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 235 E= 0 0.195745 0.344681 0.170213 0.289362 0.319149 0.246809 0.106383 0.327660 0.038298 0.893617 0.038298 0.029787 0.961702 0.012766 0.008511 0.017021 0.008511 0.978723 0.004255 0.008511 0.012766 0.068085 0.906383 0.012766 0.000000 0.936170 0.000000 0.063830 0.017021 0.000000 0.970213 0.012766 0.076596 0.885106 0.025532 0.012766 0.068085 0.170213 0.072340 0.689362 0.268085 0.289362 0.170213 0.272340 0.348936 0.187234 0.212766 0.251064 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0557.1 MOTIF MA0820.1 FIGLA letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 1780 E= 0 0.497753 0.151685 0.098315 0.252247 0.387640 0.389326 0.089888 0.133146 0.000000 0.983969 0.000000 0.016031 0.967391 0.025000 0.000000 0.007609 0.000000 0.771565 0.228435 0.000000 0.004286 0.847619 0.148095 0.000000 0.030221 0.000000 0.009174 0.960604 0.018809 0.017241 0.929990 0.033960 0.086517 0.126404 0.319663 0.467416 0.255618 0.158989 0.162360 0.423034 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0820.1 MOTIF MA0296.1 FKH1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 20 nsites= 997 E= 0 0.177533 0.287864 0.207623 0.326981 0.247495 0.192385 0.334669 0.225451 0.520521 0.084084 0.098098 0.297297 0.527054 0.076152 0.129259 0.267535 0.365365 0.073073 0.150150 0.411411 0.119238 0.146293 0.133267 0.601202 0.146293 0.004008 0.848697 0.001002 0.007021 0.003009 0.000000 0.989970 0.961886 0.037111 0.000000 0.001003 0.978958 0.011022 0.001002 0.009018 0.991984 0.001002 0.002004 0.005010 0.001002 0.926854 0.001002 0.071142 0.991984 0.001002 0.003006 0.004008 0.875752 0.039078 0.016032 0.069138 0.672345 0.049098 0.070140 0.208417 0.248497 0.191383 0.407816 0.152305 0.374749 0.158317 0.296593 0.170341 0.284569 0.184369 0.330661 0.200401 0.205411 0.116232 0.452906 0.225451 0.421844 0.192385 0.248497 0.137275 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0296.1 MOTIF MA0297.1 FKH2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 7 nsites= 101 E= 0 0.128713 0.000000 0.871287 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0297.1 MOTIF MA0558.1 FLC letter-probability matrix: alength= 4 w= 21 nsites= 275 E= 0 0.440000 0.160000 0.163636 0.236364 0.327273 0.221818 0.229091 0.221818 0.345455 0.134545 0.076364 0.443636 0.298182 0.094545 0.130909 0.476364 0.283636 0.090909 0.240000 0.385455 0.196364 0.701818 0.043636 0.058182 0.032727 0.672727 0.014545 0.280000 0.490909 0.254545 0.134545 0.120000 0.720000 0.036364 0.138182 0.105455 0.949091 0.000000 0.010909 0.040000 0.847273 0.010909 0.010909 0.130909 0.701818 0.010909 0.065455 0.221818 0.283636 0.040000 0.054545 0.621818 0.512727 0.000000 0.487273 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.789091 0.076364 0.021818 0.112727 0.974545 0.010909 0.014545 0.000000 0.934545 0.003636 0.054545 0.007273 0.225455 0.156364 0.538182 0.080000 0.396364 0.170909 0.061818 0.370909 0.374545 0.181818 0.105455 0.338182 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0558.1 MOTIF MA0475.1 FLI1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 3667 E= 0 0.499046 0.055904 0.390510 0.054540 0.080447 0.767657 0.151895 0.000000 0.739569 0.260431 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.959913 0.000000 0.000000 0.040087 0.169076 0.000000 0.830924 0.000000 0.025907 0.272975 0.081811 0.619307 0.231797 0.081811 0.580856 0.105536 0.276520 0.125989 0.511317 0.086174 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0475.1 MOTIF MA0475.2 FLI1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 54661 E= 0 0.797388 0.026710 0.093888 0.082015 0.060129 0.895689 0.038182 0.006001 0.060367 0.937696 0.001936 0.000000 0.000115 0.000000 0.999839 0.000046 0.000000 0.000000 0.998625 0.001375 0.998831 0.000481 0.000435 0.000252 0.873379 0.004609 0.000481 0.121531 0.431859 0.012728 0.553536 0.001876 0.019303 0.240440 0.042738 0.697519 0.244161 0.177029 0.425825 0.152985 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0475.2 MOTIF MA0476.1 FOS letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 29396 E= 0 0.268030 0.024221 0.329501 0.378249 0.254286 0.346204 0.368792 0.030718 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.922166 0.077834 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.033950 0.478943 0.381208 0.105899 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.008777 0.198088 0.052320 0.740815 0.136277 0.280174 0.268642 0.314907 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0476.1 MOTIF MA0099.2 FOS::JUN letter-probability matrix: alength= 4 w= 7 nsites= 18 E= 0 0.000000 0.055556 0.000000 0.944444 0.000000 0.000000 0.833333 0.166667 0.888889 0.111111 0.000000 0.000000 0.277778 0.666667 0.055556 0.000000 0.166667 0.000000 0.055556 0.777778 0.000000 0.833333 0.166667 0.000000 0.888889 0.000000 0.055556 0.055556 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0099.2 MOTIF MA0099.3 FOS::JUN letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 1000 E= 0 0.592000 0.111000 0.257000 0.040000 0.003000 0.005000 0.002000 0.990000 0.007000 0.001000 0.824000 0.168000 0.820000 0.131000 0.004000 0.045000 0.078000 0.180000 0.688000 0.054000 0.005000 0.002000 0.002000 0.991000 0.030000 0.963000 0.003000 0.004000 0.992000 0.002000 0.002000 0.004000 0.024000 0.313000 0.095000 0.568000 0.277000 0.397000 0.164000 0.162000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0099.3