MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF PH0017.1 Cux1_2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 99 E= 0 0.232323 0.080808 0.212121 0.474747 0.510000 0.190000 0.170000 0.130000 0.420000 0.140000 0.320000 0.120000 0.030303 0.181818 0.090909 0.696970 0.141414 0.050505 0.666667 0.141414 0.870000 0.050000 0.030000 0.050000 0.040000 0.010000 0.010000 0.940000 0.336634 0.059406 0.504950 0.099010 0.940000 0.010000 0.010000 0.040000 0.050000 0.030000 0.050000 0.870000 0.141414 0.666667 0.050505 0.141414 0.696970 0.090909 0.181818 0.030303 0.260000 0.410000 0.150000 0.180000 0.150000 0.070000 0.120000 0.660000 0.490000 0.130000 0.190000 0.190000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PH0017.1 MOTIF MA0445.1 D letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 29 E= 0 0.034483 0.275862 0.241379 0.448276 0.000000 0.862069 0.000000 0.137931 0.000000 0.586207 0.000000 0.413793 0.689655 0.000000 0.000000 0.310345 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.103448 0.896552 0.068966 0.000000 0.931034 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.034483 0.068966 0.137931 0.758621 0.137931 0.344828 0.206897 0.310345 0.206897 0.034483 0.034483 0.724138 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0445.1 MOTIF MA1271.1 DAG2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 600 E= 0 0.205000 0.313333 0.291667 0.190000 0.820000 0.051667 0.085000 0.043333 0.785000 0.000000 0.000000 0.215000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.995000 0.000000 0.005000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.021667 0.061667 0.308333 0.608333 0.343333 0.075000 0.253333 0.328333 0.650000 0.016667 0.260000 0.073333 0.548333 0.161667 0.081667 0.208333 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1271.1 MOTIF MA0289.1 DAL80 letter-probability matrix: alength= 4 w= 7 nsites= 101 E= 0 0.108911 0.663366 0.059406 0.168317 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.909091 0.010101 0.010101 0.070707 0.030000 0.190000 0.750000 0.030000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0289.1 MOTIF MA0290.1 DAL81 letter-probability matrix: alength= 4 w= 19 nsites= 203 E= 0 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0290.1 MOTIF MA0291.1 DAL82 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 98 E= 0 0.571429 0.142857 0.142857 0.142857 0.524752 0.108911 0.049505 0.316832 0.390000 0.030000 0.030000 0.550000 0.260000 0.110000 0.420000 0.210000 0.000000 0.260000 0.000000 0.740000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.108911 0.673267 0.108911 0.108911 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0291.1 MOTIF MA0639.1 DBP letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 7099 E= 0 0.218622 0.241442 0.268066 0.271869 0.445326 0.135785 0.407714 0.011175 0.000703 0.000563 0.000281 0.998453 0.000519 0.000778 0.078060 0.920643 0.933965 0.000000 0.065509 0.000526 0.000204 0.725452 0.002146 0.272198 0.308798 0.001651 0.689454 0.000097 0.000392 0.070710 0.000915 0.927983 0.959330 0.038914 0.000946 0.000811 0.999296 0.000141 0.000281 0.000281 0.017953 0.421202 0.175321 0.385524 0.362535 0.233380 0.246056 0.158028 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0639.1 MOTIF POL008.1 DCE_S_I letter-probability matrix: alength= 4 w= 6 nsites= 108 E= 0 0.166667 0.175926 0.425926 0.231481 0.037037 0.861111 0.055556 0.046296 0.027778 0.111111 0.074074 0.787037 0.037037 0.111111 0.185185 0.666667 0.018519 0.861111 0.064815 0.055556 0.203704 0.314815 0.250000 0.231481 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/POL008.1 MOTIF POL009.1 DCE_S_II letter-probability matrix: alength= 4 w= 6 nsites= 108 E= 0 0.148148 0.314815 0.398148 0.138889 0.027778 0.925926 0.027778 0.018519 0.055556 0.046296 0.120370 0.777778 0.018519 0.101852 0.833333 0.046296 0.129630 0.194444 0.120370 0.555556 0.148148 0.259259 0.416667 0.175926 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/POL009.1 MOTIF POL010.1 DCE_S_III letter-probability matrix: alength= 4 w= 5 nsites= 108 E= 0 0.157407 0.398148 0.324074 0.120370 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.185185 0.333333 0.268519 0.212963 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/POL010.1