MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF PH0013.1 Cdx2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 16 nsites= 100 E= 0 0.310000 0.150000 0.250000 0.290000 0.356436 0.178218 0.326733 0.138614 0.300000 0.300000 0.300000 0.100000 0.190000 0.060000 0.660000 0.090000 0.171717 0.030303 0.797980 0.000000 0.000000 0.464646 0.000000 0.535354 0.580000 0.400000 0.000000 0.020000 0.970000 0.000000 0.030000 0.000000 0.010000 0.000000 0.000000 0.990000 0.880000 0.000000 0.000000 0.120000 0.950000 0.000000 0.000000 0.050000 0.940000 0.010000 0.000000 0.050000 0.570000 0.150000 0.050000 0.230000 0.171717 0.262626 0.121212 0.444444 0.140000 0.110000 0.260000 0.490000 0.220000 0.300000 0.130000 0.350000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PH0013.1 MOTIF MA0102.1 Cebpa letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 18 E= 0 0.166667 0.000000 0.000000 0.833333 0.055556 0.055556 0.222222 0.666667 0.222222 0.055556 0.333333 0.388889 0.111111 0.500000 0.111111 0.277778 0.222222 0.111111 0.555556 0.111111 0.111111 0.833333 0.000000 0.055556 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.333333 0.111111 0.555556 0.277778 0.333333 0.277778 0.111111 0.111111 0.277778 0.166667 0.444444 0.055556 0.333333 0.277778 0.333333 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0102.1 MOTIF MA0015.1 Cf2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 80 E= 0 0.312500 0.162500 0.500000 0.025000 0.012500 0.025000 0.012500 0.950000 0.925000 0.025000 0.050000 0.000000 0.000000 0.112500 0.050000 0.837500 0.975000 0.025000 0.000000 0.000000 0.012500 0.050000 0.012500 0.925000 0.512500 0.025000 0.450000 0.012500 0.025000 0.112500 0.012500 0.850000 0.662500 0.037500 0.250000 0.050000 0.150000 0.362500 0.187500 0.300000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0015.1 MOTIF PH0014.1 Cphx letter-probability matrix: alength= 4 w= 14 nsites= 100 E= 0 0.340000 0.180000 0.260000 0.220000 0.030303 0.000000 0.000000 0.969697 0.040000 0.020000 0.930000 0.010000 0.970297 0.009901 0.009901 0.009901 0.040000 0.000000 0.060000 0.900000 0.100000 0.370000 0.290000 0.240000 0.220000 0.280000 0.350000 0.150000 0.540000 0.340000 0.080000 0.040000 0.950000 0.030000 0.010000 0.010000 0.009901 0.009901 0.000000 0.980198 0.000000 0.979798 0.000000 0.020202 0.950000 0.010000 0.010000 0.030000 0.610000 0.140000 0.150000 0.100000 0.360000 0.210000 0.100000 0.330000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PH0014.1 MOTIF MA0608.1 Creb3l2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 999 E= 0 0.002002 0.002002 0.745746 0.250250 0.250000 0.623000 0.001000 0.126000 0.001000 0.872000 0.126000 0.001000 0.996997 0.001001 0.001001 0.001001 0.001001 0.996997 0.001001 0.001001 0.001001 0.001001 0.996997 0.001001 0.001001 0.001001 0.001001 0.996997 0.001001 0.143143 0.854855 0.001001 0.250000 0.002000 0.250000 0.498000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0608.1 MOTIF MA0840.1 Creb5 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 3703 E= 0 0.324602 0.199838 0.287875 0.187686 0.876272 0.053702 0.060563 0.009463 0.001610 0.004294 0.000000 0.994096 0.002801 0.001293 0.798104 0.197802 0.997039 0.000000 0.000269 0.002692 0.000000 0.984844 0.000000 0.015156 0.039170 0.000000 0.960830 0.000000 0.004828 0.001609 0.000000 0.993562 0.198270 0.800865 0.000000 0.000865 0.999460 0.000000 0.000000 0.000540 0.006569 0.488965 0.020231 0.484235 0.199784 0.395788 0.100432 0.303996 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0840.1 MOTIF MA0609.1 Crem letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 1000 E= 0 0.183000 0.183000 0.271000 0.363000 0.645646 0.087087 0.180180 0.087087 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.725000 0.275000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.548000 0.318000 0.067000 0.067000 0.511000 0.163000 0.163000 0.163000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0609.1 MOTIF PH0015.1 Crx letter-probability matrix: alength= 4 w= 16 nsites= 100 E= 0 0.090000 0.470000 0.130000 0.310000 0.099010 0.217822 0.376238 0.306931 0.326733 0.099010 0.138614 0.435644 0.260000 0.120000 0.170000 0.450000 0.090000 0.110000 0.730000 0.070000 0.089109 0.267327 0.594059 0.049505 0.040404 0.000000 0.959596 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.960000 0.040000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.020000 0.000000 0.000000 0.980000 0.980000 0.000000 0.000000 0.020000 0.370000 0.030000 0.400000 0.200000 0.090909 0.686869 0.101010 0.121212 0.101010 0.525253 0.232323 0.141414 0.190000 0.160000 0.250000 0.400000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PH0015.1 MOTIF MA0467.1 Crx letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 2097 E= 0 0.575584 0.141631 0.218407 0.064378 0.693371 0.020505 0.198856 0.087268 0.165474 0.026228 0.701001 0.107296 0.449690 0.105866 0.392465 0.051979 0.245589 0.000000 0.750596 0.003815 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.778255 0.221745 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.013829 0.000000 0.986171 0.951359 0.000000 0.000000 0.048641 0.259418 0.024797 0.632332 0.083453 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0467.1 MOTIF PH0016.1 Cux1_1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 17 nsites= 99 E= 0 0.595960 0.060606 0.272727 0.070707 0.108911 0.534653 0.217822 0.138614 0.160000 0.510000 0.120000 0.210000 0.232323 0.151515 0.525253 0.090909 0.287129 0.188119 0.415842 0.108911 0.130000 0.160000 0.090000 0.620000 0.080808 0.070707 0.010101 0.838384 0.292929 0.010101 0.676768 0.020202 0.960000 0.010000 0.020000 0.010000 0.019802 0.009901 0.009901 0.960396 0.059406 0.603960 0.019802 0.316832 0.792079 0.059406 0.009901 0.138614 0.310000 0.350000 0.110000 0.230000 0.128713 0.475248 0.297030 0.099010 0.353535 0.080808 0.151515 0.414141 0.128713 0.287129 0.306931 0.277228 0.410000 0.100000 0.300000 0.190000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PH0016.1