MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF PF0100.1 CRGAARNNNNCGA letter-probability matrix: alength= 4 w= 13 nsites= 268 E= 0 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.149254 0.000000 0.850746 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.664179 0.000000 0.335821 0.000000 0.111940 0.305970 0.261194 0.320896 0.350746 0.119403 0.216418 0.313433 0.171642 0.179104 0.608209 0.041045 0.067164 0.735075 0.141791 0.055970 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PF0100.1 MOTIF MA0285.1 CRZ1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 0 0.200000 0.480000 0.180000 0.140000 0.282828 0.222222 0.171717 0.323232 0.370000 0.300000 0.220000 0.110000 0.623762 0.356436 0.009901 0.009901 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.420000 0.300000 0.070000 0.210000 0.070707 0.767677 0.080808 0.080808 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0285.1 MOTIF MA0286.1 CST6 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 101 E= 0 0.465347 0.108911 0.316832 0.108911 0.010101 0.010101 0.010101 0.969697 0.010000 0.010000 0.910000 0.070000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.050000 0.000000 0.950000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.454545 0.282828 0.080808 0.181818 0.460000 0.140000 0.200000 0.200000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0286.1 MOTIF PF0028.1 CTAWWWATA letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 1356 E= 0 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.446165 0.000000 0.000000 0.553835 0.660767 0.000000 0.000000 0.339233 0.649705 0.000000 0.000000 0.350295 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PF0028.1 MOTIF MA0139.1 CTCF letter-probability matrix: alength= 4 w= 19 nsites= 913 E= 0 0.095290 0.318729 0.083242 0.502738 0.182913 0.158817 0.453450 0.204819 0.307777 0.053669 0.491785 0.146769 0.061336 0.876232 0.023001 0.039430 0.008762 0.989047 0.000000 0.002191 0.814896 0.014239 0.071194 0.099671 0.043812 0.578313 0.365827 0.012048 0.117325 0.474781 0.052632 0.355263 0.933114 0.012061 0.035088 0.019737 0.005488 0.000000 0.991218 0.003293 0.365532 0.003293 0.621295 0.009879 0.059276 0.013172 0.553238 0.374314 0.013187 0.000000 0.978022 0.008791 0.061538 0.008791 0.851648 0.078022 0.114411 0.806381 0.005501 0.073707 0.409241 0.014301 0.557756 0.018702 0.090308 0.530837 0.338106 0.040749 0.128855 0.354626 0.080396 0.436123 0.442731 0.199339 0.292952 0.064978 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0139.1 MOTIF MA0531.1 CTCF letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 1902 E= 0 0.160883 0.460568 0.211882 0.166667 0.164564 0.603049 0.115142 0.117245 0.240273 0.201367 0.434280 0.124080 0.355415 0.412198 0.184017 0.048370 0.135121 0.375394 0.045741 0.443743 0.806519 0.000526 0.100946 0.092008 0.106204 0.000000 0.893796 0.000000 0.518927 0.000000 0.479495 0.001577 0.001052 0.002103 0.163512 0.833333 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.001052 0.000000 0.868559 0.130389 0.065195 0.864879 0.001577 0.068349 0.000526 0.000000 0.950053 0.049422 0.041535 0.796004 0.004206 0.158254 0.121451 0.406414 0.075710 0.396425 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0531.1 MOTIF MA1102.1 CTCFL letter-probability matrix: alength= 4 w= 14 nsites= 8825 E= 0 0.071048 0.783569 0.097450 0.047932 0.378924 0.168499 0.285552 0.167025 0.103003 0.526912 0.328385 0.041700 0.056544 0.759547 0.060623 0.123286 0.954334 0.018810 0.017224 0.009632 0.008612 0.010538 0.974051 0.006799 0.064363 0.016431 0.910482 0.008725 0.030142 0.036827 0.874334 0.058697 0.013938 0.020283 0.957167 0.008612 0.014391 0.015411 0.949575 0.020623 0.013258 0.977337 0.004193 0.005212 0.455751 0.082720 0.419490 0.042040 0.080907 0.427422 0.390708 0.100963 0.150595 0.384363 0.205099 0.259943 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1102.1 MOTIF PF0171.1 CTCNANGTGNY letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 368 E= 0 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.116848 0.728261 0.054348 0.100543 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.187500 0.339674 0.320652 0.152174 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.203804 0.312500 0.301630 0.182065 0.000000 0.684783 0.000000 0.315217 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PF0171.1 MOTIF PF0101.1 CTGCAGY letter-probability matrix: alength= 4 w= 7 nsites= 4132 E= 0 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.664811 0.000000 0.335189 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PF0101.1 MOTIF PF0153.1 CTGRYYYNATT letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 184 E= 0 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.619565 0.000000 0.380435 0.000000 0.000000 0.510870 0.000000 0.489130 0.000000 0.581522 0.000000 0.418478 0.000000 0.260870 0.000000 0.739130 0.244565 0.364130 0.190217 0.201087 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PF0153.1