MEME version 4

ALPHABET= ACGT

strands: + -

Background letter frequencies
A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25

MOTIF PF0105.1 ACTWSNACTNY
letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 396 E= 0
 1.000000  0.000000  0.000000  0.000000
 0.000000  1.000000  0.000000  0.000000
 0.000000  0.000000  0.000000  1.000000
 0.805556  0.000000  0.000000  0.194444
 0.000000  0.944444  0.055556  0.000000
 0.737374  0.118687  0.111111  0.032828
 1.000000  0.000000  0.000000  0.000000
 0.000000  1.000000  0.000000  0.000000
 0.000000  0.000000  0.000000  1.000000
 0.035354  0.818182  0.015152  0.131313
 0.000000  0.952020  0.000000  0.047980
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PF0105.1

MOTIF MA0268.1 ADR1
letter-probability matrix: alength= 4 w= 7 nsites= 100 E= 0
 0.410000  0.240000  0.130000  0.220000
 0.000000  1.000000  0.000000  0.000000
 0.000000  0.850000  0.000000  0.150000
 0.000000  1.000000  0.000000  0.000000
 0.000000  1.000000  0.000000  0.000000
 0.640000  0.060000  0.200000  0.100000
 0.340000  0.510000  0.060000  0.090000
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0268.1

MOTIF MA0269.1 AFT1
letter-probability matrix: alength= 4 w= 21 nsites= 998 E= 0
 0.106212  0.205411  0.231463  0.456914
 0.155311  0.249499  0.220441  0.374749
 0.362725  0.197395  0.221443  0.218437
 0.179539  0.397192  0.222668  0.200602
 0.426854  0.231463  0.154309  0.187375
 0.136409  0.078235  0.142427  0.642929
 0.717435  0.025050  0.031062  0.226453
 0.145145  0.031031  0.288288  0.535536
 0.034068  0.047094  0.039078  0.879760
 0.160321  0.010020  0.813627  0.016032
 0.010030  0.968907  0.011033  0.010030
 0.961962  0.009009  0.015015  0.014014
 0.008008  0.972973  0.009009  0.010010
 0.025050  0.956914  0.002004  0.016032
 0.019057  0.742227  0.013039  0.225677
 0.181545  0.257773  0.495486  0.065196
 0.265531  0.252505  0.241483  0.240481
 0.287575  0.155311  0.183367  0.373747
 0.276553  0.180361  0.068136  0.474950
 0.123370  0.225677  0.358074  0.292879
 0.154309  0.236473  0.458918  0.150301
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0269.1

MOTIF MA0270.1 AFT2
letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 0
 0.080000  0.450000  0.270000  0.200000
 0.700000  0.000000  0.300000  0.000000
 0.000000  1.000000  0.000000  0.000000
 1.000000  0.000000  0.000000  0.000000
 0.000000  1.000000  0.000000  0.000000
 0.000000  1.000000  0.000000  0.000000
 0.000000  1.000000  0.000000  0.000000
 0.090909  0.424242  0.272727  0.212121
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0270.1

MOTIF MA0005.1 AG
letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 90 E= 0
 0.000000  0.966667  0.022222  0.011111
 0.022222  0.955556  0.000000  0.022222
 0.422222  0.100000  0.077778  0.400000
 0.677778  0.055556  0.022222  0.244444
 0.811111  0.011111  0.011111  0.166667
 0.344444  0.033333  0.044444  0.577778
 0.255556  0.177778  0.188889  0.377778
 0.222222  0.144444  0.288889  0.344444
 0.244444  0.000000  0.711111  0.044444
 0.011111  0.000000  0.911111  0.077778
 0.300000  0.277778  0.100000  0.322222
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0005.1

MOTIF MA0005.2 AG
letter-probability matrix: alength= 4 w= 18 nsites= 66 E= 0
 0.318182  0.303030  0.090909  0.287879
 0.136364  0.045455  0.045455  0.772727
 0.151515  0.000000  0.015152  0.833333
 0.439394  0.121212  0.121212  0.318182
 0.000000  1.000000  0.000000  0.000000
 0.000000  0.984848  0.000000  0.015152
 0.469697  0.045455  0.090909  0.393939
 0.712121  0.030303  0.000000  0.257576
 0.787879  0.000000  0.015152  0.196970
 0.378788  0.000000  0.015152  0.606061
 0.257576  0.227273  0.166667  0.348485
 0.287879  0.121212  0.303030  0.287879
 0.106061  0.000000  0.863636  0.030303
 0.030303  0.000000  0.818182  0.151515
 0.333333  0.257576  0.075758  0.333333
 0.681818  0.060606  0.075758  0.181818
 0.606061  0.090909  0.136364  0.166667
 0.227273  0.151515  0.242424  0.378788
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0005.2

MOTIF PF0135.1 AGCYRWTTC
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 388 E= 0
 1.000000  0.000000  0.000000  0.000000
 0.000000  0.000000  1.000000  0.000000
 0.000000  1.000000  0.000000  0.000000
 0.000000  0.548969  0.000000  0.451031
 0.463918  0.000000  0.536082  0.000000
 0.311856  0.000000  0.000000  0.688144
 0.000000  0.000000  0.000000  1.000000
 0.000000  0.000000  0.000000  1.000000
 0.000000  1.000000  0.000000  0.000000
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PF0135.1

MOTIF MA0585.1 AGL1
letter-probability matrix: alength= 4 w= 18 nsites= 65 E= 0
 0.323077  0.169231  0.230769  0.276923
 0.184615  0.092308  0.138462  0.584615
 0.061538  0.015385  0.138462  0.784615
 0.323077  0.076923  0.338462  0.261538
 0.000000  1.000000  0.000000  0.000000
 0.015385  0.969231  0.015385  0.000000
 0.461538  0.092308  0.107692  0.338462
 0.476923  0.061538  0.123077  0.338462
 0.646154  0.015385  0.015385  0.323077
 0.400000  0.046154  0.030769  0.523077
 0.215385  0.215385  0.138462  0.430769
 0.230769  0.123077  0.430769  0.215385
 0.107692  0.000000  0.861538  0.030769
 0.061538  0.000000  0.861538  0.076923
 0.400000  0.092308  0.076923  0.430769
 0.738462  0.153846  0.061538  0.046154
 0.600000  0.138462  0.123077  0.138462
 0.276923  0.230769  0.292308  0.200000
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0585.1

MOTIF MA1204.1 AGL13
letter-probability matrix: alength= 4 w= 18 nsites= 219 E= 0
 0.269406  0.013699  0.000000  0.716895
 0.041096  0.000000  0.009132  0.949772
 0.561644  0.009132  0.114155  0.315068
 0.009132  0.990868  0.000000  0.000000
 0.000000  0.735160  0.000000  0.264840
 0.643836  0.164384  0.031963  0.159817
 0.771689  0.009132  0.031963  0.187215
 1.000000  0.000000  0.000000  0.000000
 0.794521  0.000000  0.000000  0.205479
 0.794521  0.036530  0.027397  0.141553
 0.369863  0.054795  0.068493  0.506849
 0.337900  0.000000  0.662100  0.000000
 0.000000  0.000000  0.990868  0.009132
 0.547945  0.068493  0.022831  0.360731
 0.954338  0.013699  0.000000  0.031963
 0.872146  0.000000  0.018265  0.109589
 0.575342  0.063927  0.187215  0.173516
 0.410959  0.086758  0.091324  0.410959
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1204.1

MOTIF MA0548.1 AGL15
letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 150 E= 0
 0.060000  0.033333  0.020000  0.886667
 0.026667  0.066667  0.040000  0.866667
 0.120000  0.000000  0.073333  0.806667
 0.000000  0.960000  0.013333  0.026667
 0.026667  0.660000  0.006667  0.306667
 0.420000  0.133333  0.120000  0.326667
 0.100000  0.153333  0.106667  0.640000
 0.220000  0.026667  0.020000  0.733333
 0.020000  0.000000  0.000000  0.980000
 0.100000  0.060000  0.053333  0.786667
 0.093333  0.093333  0.180000  0.633333
 0.120000  0.000000  0.826667  0.053333
 0.013333  0.000000  0.733333  0.253333
 0.360000  0.200000  0.200000  0.240000
 0.533333  0.066667  0.073333  0.326667
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0548.1

