MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF POL004.1 CCAAT-box letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 175 E= 0 0.320000 0.314286 0.068571 0.297143 0.182857 0.297143 0.245714 0.274286 0.142857 0.268571 0.137143 0.451429 0.582857 0.005714 0.400000 0.011429 0.291429 0.034286 0.565714 0.108571 0.000000 0.988571 0.005714 0.005714 0.000000 0.994286 0.000000 0.005714 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.680000 0.045714 0.120000 0.154286 0.097143 0.000000 0.085714 0.817143 0.131429 0.514286 0.337143 0.017143 0.662857 0.034286 0.297143 0.005714 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/POL004.1 MOTIF PF0104.1 CCAATNNSNNNGCG letter-probability matrix: alength= 4 w= 14 nsites= 236 E= 0 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.088983 0.483051 0.398305 0.029661 0.317797 0.127119 0.500000 0.055085 0.000000 0.334746 0.665254 0.000000 0.266949 0.394068 0.266949 0.072034 0.199153 0.084746 0.597458 0.118644 0.224576 0.334746 0.343220 0.097458 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PF0104.1 MOTIF PF0045.1 CCANNAGRKGGC letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 284 E= 0 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.028169 0.489437 0.443662 0.038732 0.154930 0.538732 0.105634 0.200704 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.507042 0.000000 0.492958 0.000000 0.000000 0.000000 0.563380 0.436620 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PF0045.1 MOTIF PF0165.1 CCAWNWWNNNGGC letter-probability matrix: alength= 4 w= 13 nsites= 328 E= 0 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.609756 0.000000 0.000000 0.390244 0.121951 0.271341 0.338415 0.268293 0.585366 0.000000 0.000000 0.414634 0.262195 0.000000 0.000000 0.737805 0.246951 0.192073 0.484756 0.076220 0.137195 0.182927 0.539634 0.140244 0.271341 0.426829 0.155488 0.146341 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PF0165.1 MOTIF PF0121.1 CCAWWNAAGG letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 268 E= 0 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.514925 0.000000 0.000000 0.485075 0.776119 0.000000 0.000000 0.223881 0.402985 0.167910 0.104478 0.324627 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PF0121.1 MOTIF PF0124.1 CCAWYNNGAAR letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 572 E= 0 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.734266 0.000000 0.000000 0.265734 0.000000 0.220280 0.000000 0.779720 0.190559 0.291958 0.260490 0.256993 0.431818 0.001748 0.363636 0.202797 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.489510 0.000000 0.510490 0.000000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PF0124.1 MOTIF PF0130.1 CCCNNGGGAR letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 1236 E= 0 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.200647 0.381068 0.202265 0.216019 0.232201 0.172330 0.415858 0.179612 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.390777 0.000000 0.609223 0.000000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PF0130.1 MOTIF PF0158.1 CCCNNNNNNAAGWT letter-probability matrix: alength= 4 w= 14 nsites= 480 E= 0 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.310417 0.164583 0.216667 0.308333 0.216667 0.352083 0.256250 0.175000 0.358333 0.260417 0.150000 0.231250 0.225000 0.252083 0.206250 0.316667 0.133333 0.458333 0.200000 0.208333 0.327083 0.420833 0.135417 0.116667 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.666667 0.000000 0.000000 0.333333 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PF0158.1 MOTIF PF0106.1 CCGNMNNTNACG letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 372 E= 0 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.069892 0.118280 0.790323 0.021505 0.752688 0.247312 0.000000 0.000000 0.663978 0.193548 0.086022 0.056452 0.137097 0.091398 0.739247 0.032258 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.075269 0.115591 0.768817 0.040323 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PF0106.1 MOTIF PF0167.1 CCTNTMAGA letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 528 E= 0 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.043561 0.111742 0.185606 0.659091 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.725379 0.274621 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PF0167.1