MEME version 4

ALPHABET= ACGT

strands: + -

Background letter frequencies
A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25

MOTIF PF0160.1 CAGNYGKNAAA
letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 228 E= 0
 0.000000  1.000000  0.000000  0.000000
 1.000000  0.000000  0.000000  0.000000
 0.000000  0.000000  1.000000  0.000000
 0.228070  0.557018  0.131579  0.083333
 0.000000  0.153509  0.000000  0.846491
 0.000000  0.000000  1.000000  0.000000
 0.000000  0.000000  0.535088  0.464912
 0.162281  0.394737  0.333333  0.109649
 1.000000  0.000000  0.000000  0.000000
 1.000000  0.000000  0.000000  0.000000
 1.000000  0.000000  0.000000  0.000000
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PF0160.1

MOTIF MA1197.1 CAMTA1
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 598 E= 0
 0.503344  0.093645  0.195652  0.207358
 0.719064  0.076923  0.075251  0.128763
 0.677258  0.010033  0.220736  0.091973
 0.287625  0.234114  0.476589  0.001672
 0.000000  1.000000  0.000000  0.000000
 0.000000  0.000000  1.000000  0.000000
 0.000000  0.966555  0.000000  0.033445
 0.000000  0.000000  1.000000  0.000000
 0.000000  0.000000  0.005017  0.994983
 0.105351  0.096990  0.545151  0.252508
 0.392977  0.055184  0.260870  0.290970
 0.396321  0.096990  0.284281  0.222408
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1197.1

MOTIF MA0280.1 CAT8
letter-probability matrix: alength= 4 w= 6 nsites= 100 E= 0
 0.000000  1.000000  0.000000  0.000000
 0.000000  1.000000  0.000000  0.000000
 0.000000  0.000000  1.000000  0.000000
 0.000000  0.000000  1.000000  0.000000
 0.660000  0.130000  0.210000  0.000000
 0.320000  0.180000  0.280000  0.220000
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0280.1

MOTIF PF0134.1 CATRRAGC
letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 492 E= 0
 0.000000  1.000000  0.000000  0.000000
 1.000000  0.000000  0.000000  0.000000
 0.000000  0.000000  0.000000  1.000000
 0.327236  0.000000  0.672764  0.000000
 0.487805  0.000000  0.512195  0.000000
 1.000000  0.000000  0.000000  0.000000
 0.000000  0.000000  1.000000  0.000000
 0.000000  1.000000  0.000000  0.000000
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PF0134.1

MOTIF PF0049.1 CATTGTYY
letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 1404 E= 0
 0.000000  1.000000  0.000000  0.000000
 1.000000  0.000000  0.000000  0.000000
 0.000000  0.000000  0.000000  1.000000
 0.000000  0.000000  0.000000  1.000000
 0.000000  0.000000  1.000000  0.000000
 0.000000  0.000000  0.000000  1.000000
 0.000000  0.412393  0.000000  0.587607
 0.000000  0.504986  0.000000  0.495014
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PF0049.1

MOTIF MA0281.1 CBF1
letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 99 E= 0
 0.191919  0.080808  0.535354  0.191919
 0.029703  0.910891  0.029703  0.029703
 1.000000  0.000000  0.000000  0.000000
 0.000000  1.000000  0.000000  0.000000
 0.000000  0.000000  1.000000  0.000000
 0.000000  0.000000  0.000000  1.000000
 0.000000  0.000000  1.000000  0.000000
 0.712871  0.168317  0.059406  0.059406
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0281.1

MOTIF MA1224.1 CBF1
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 600 E= 0
 0.246667  0.106667  0.295000  0.351667
 0.131667  0.320000  0.113333  0.435000
 0.118333  0.480000  0.143333  0.258333
 0.435000  0.000000  0.561667  0.003333
 0.000000  0.993333  0.000000  0.006667
 0.000000  1.000000  0.000000  0.000000
 0.000000  0.000000  1.000000  0.000000
 0.993333  0.000000  0.000000  0.006667
 0.000000  1.000000  0.000000  0.000000
 0.641667  0.063333  0.191667  0.103333
 0.213333  0.166667  0.046667  0.573333
 0.293333  0.340000  0.188333  0.178333
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1224.1

MOTIF MA1217.1 CBF2
letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 595 E= 0
 0.268908  0.290756  0.139496  0.300840
 0.230252  0.339496  0.141176  0.289076
 0.240336  0.193277  0.226891  0.339496
 0.152941  0.285714  0.095798  0.465546
 0.085714  0.374790  0.163025  0.376471
 0.494118  0.000000  0.505882  0.000000
 0.000000  0.978151  0.000000  0.021849
 0.000000  1.000000  0.000000  0.000000
 0.000000  0.000000  1.000000  0.000000
 1.000000  0.000000  0.000000  0.000000
 0.000000  1.000000  0.000000  0.000000
 0.821849  0.040336  0.082353  0.055462
 0.089076  0.077311  0.008403  0.825210
 0.305882  0.319328  0.220168  0.154622
 0.347899  0.152941  0.297479  0.201681
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1217.1

MOTIF MA1218.1 CBF4
letter-probability matrix: alength= 4 w= 13 nsites= 597 E= 0
 0.189280  0.271357  0.130653  0.408710
 0.172529  0.217755  0.318258  0.291457
 0.686767  0.028476  0.120603  0.164154
 0.056951  0.182580  0.087102  0.673367
 0.000000  0.000000  1.000000  0.000000
 0.000000  0.000000  0.000000  1.000000
 0.000000  1.000000  0.000000  0.000000
 0.000000  0.000000  1.000000  0.000000
 0.035176  0.000000  0.964824  0.000000
 0.000000  0.520938  0.000000  0.479062
 0.335008  0.159129  0.410385  0.095477
 0.458961  0.108878  0.276382  0.155779
 0.358459  0.254606  0.147404  0.239531
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1218.1

MOTIF MA0972.1 CCA1
letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 999 E= 0
 0.934935  0.001001  0.010010  0.054054
 0.960000  0.001000  0.037000  0.002000
 0.985000  0.004000  0.010000  0.001000
 0.035000  0.000000  0.005000  0.960000
 0.992000  0.005000  0.001000  0.002000
 0.001000  0.012000  0.001000  0.986000
 0.005000  0.991000  0.000000  0.004000
 0.021000  0.091000  0.014000  0.874000
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0972.1

