MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF PH0007.1 Barx1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 16 nsites= 99 E= 0 0.505051 0.262626 0.090909 0.141414 0.485149 0.237624 0.118812 0.158416 0.524752 0.059406 0.386139 0.029703 0.180000 0.300000 0.440000 0.080000 0.010000 0.460000 0.000000 0.530000 0.930000 0.050000 0.020000 0.000000 0.989899 0.010101 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.010101 0.989899 0.000000 0.020000 0.050000 0.930000 0.530000 0.000000 0.460000 0.010000 0.060000 0.390000 0.400000 0.150000 0.029703 0.386139 0.059406 0.524752 0.247525 0.207921 0.297030 0.247525 0.380000 0.230000 0.160000 0.230000 0.560000 0.080000 0.150000 0.210000 0.313131 0.141414 0.080808 0.464646 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PH0007.1 MOTIF PH0008.1 Barx2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 16 nsites= 100 E= 0 0.190000 0.150000 0.150000 0.510000 0.510000 0.170000 0.120000 0.200000 0.636364 0.111111 0.232323 0.020202 0.108911 0.198020 0.386139 0.306931 0.010000 0.270000 0.000000 0.720000 0.960000 0.030000 0.000000 0.010000 0.980000 0.010000 0.000000 0.010000 0.010000 0.000000 0.010000 0.980000 0.010000 0.000000 0.030000 0.960000 0.720000 0.000000 0.270000 0.010000 0.270000 0.230000 0.350000 0.150000 0.020202 0.232323 0.111111 0.636364 0.100000 0.100000 0.380000 0.420000 0.340000 0.100000 0.320000 0.240000 0.178218 0.198020 0.108911 0.514851 0.383838 0.111111 0.333333 0.171717 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PH0008.1 MOTIF PB0005.1 Bbx_1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 99 E= 0 0.242424 0.191919 0.121212 0.444444 0.603960 0.158416 0.059406 0.178218 0.460000 0.140000 0.220000 0.180000 0.131313 0.030303 0.050505 0.787879 0.090000 0.020000 0.020000 0.870000 0.140000 0.750000 0.060000 0.050000 0.910891 0.029703 0.019802 0.039604 0.454545 0.080808 0.121212 0.343434 0.039604 0.019802 0.029703 0.910891 0.050000 0.060000 0.750000 0.140000 0.870000 0.020000 0.020000 0.090000 0.787879 0.050505 0.030303 0.131313 0.121212 0.282828 0.353535 0.242424 0.290000 0.130000 0.120000 0.460000 0.330000 0.060000 0.350000 0.260000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PB0005.1 MOTIF PB0109.1 Bbx_2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 17 nsites= 101 E= 0 0.198020 0.227723 0.178218 0.396040 0.303030 0.272727 0.343434 0.080808 0.485149 0.148515 0.059406 0.306931 0.220000 0.270000 0.210000 0.300000 0.161616 0.262626 0.262626 0.313131 0.070707 0.040404 0.818182 0.070707 0.060606 0.030303 0.090909 0.818182 0.050000 0.100000 0.050000 0.800000 0.820000 0.050000 0.090000 0.040000 0.742574 0.178218 0.029703 0.049505 0.160000 0.690000 0.040000 0.110000 0.640000 0.140000 0.160000 0.060000 0.140000 0.270000 0.420000 0.170000 0.280000 0.230000 0.160000 0.330000 0.170000 0.230000 0.290000 0.310000 0.297030 0.128713 0.386139 0.188119 0.280000 0.210000 0.370000 0.140000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PB0109.1 MOTIF MA0463.1 Bcl6 letter-probability matrix: alength= 4 w= 14 nsites= 956 E= 0 0.199791 0.178870 0.256276 0.365063 0.036611 0.023013 0.029289 0.911088 0.005230 0.083682 0.031381 0.879707 0.031381 0.916318 0.025105 0.027197 0.000000 0.856695 0.000000 0.143305 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.466527 0.089958 0.422594 0.020921 0.148536 0.000000 0.851464 0.000000 0.984310 0.000000 0.011506 0.004184 0.671548 0.105649 0.183054 0.039749 0.643305 0.007322 0.222803 0.126569 0.105649 0.096234 0.658996 0.139121 0.197699 0.516736 0.121339 0.164226 0.385983 0.196653 0.173640 0.243724 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0463.1 MOTIF PB0006.1 Bcl6b_1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 16 nsites= 100 E= 0 0.350000 0.080000 0.200000 0.370000 0.170000 0.600000 0.050000 0.180000 0.089109 0.108911 0.059406 0.742574 0.130000 0.080000 0.080000 0.710000 0.030000 0.010000 0.020000 0.940000 0.010000 0.870000 0.010000 0.110000 0.020000 0.100000 0.450000 0.430000 0.800000 0.010000 0.020000 0.170000 0.140000 0.060000 0.760000 0.040000 0.070707 0.020202 0.818182 0.090909 0.880000 0.020000 0.040000 0.060000 0.880000 0.030000 0.010000 0.080000 0.210000 0.210000 0.040000 0.540000 0.240000 0.230000 0.170000 0.360000 0.210000 0.300000 0.150000 0.340000 0.202020 0.292929 0.333333 0.171717 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PB0006.1 MOTIF PB0110.1 Bcl6b_2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 16 nsites= 100 E= 0 0.320000 0.280000 0.150000 0.250000 0.168317 0.257426 0.257426 0.316832 0.178218 0.326733 0.257426 0.237624 0.168317 0.386139 0.237624 0.207921 0.070000 0.780000 0.070000 0.080000 0.050000 0.800000 0.030000 0.120000 0.222222 0.060606 0.555556 0.161616 0.070707 0.828283 0.030303 0.070707 0.070000 0.850000 0.060000 0.020000 0.030000 0.860000 0.060000 0.050000 0.060000 0.800000 0.070000 0.070000 0.350000 0.030000 0.200000 0.420000 0.306931 0.257426 0.178218 0.257426 0.460000 0.290000 0.090000 0.160000 0.320000 0.230000 0.170000 0.280000 0.370000 0.270000 0.200000 0.160000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PB0110.1 MOTIF MA0242.1 Bgb::run letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 29 E= 0 0.413793 0.068966 0.000000 0.517241 0.931034 0.000000 0.034483 0.034483 0.965517 0.000000 0.034483 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.965517 0.034483 0.000000 0.172414 0.034483 0.793103 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.965517 0.000000 0.000000 0.034483 0.689655 0.000000 0.310345 0.000000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0242.1 MOTIF MA0607.1 Bhlha15 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 1001 E= 0 0.142857 0.570430 0.285714 0.000999 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.200200 0.799800 0.799800 0.200200 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.001000 0.231000 0.154000 0.614000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0607.1 MOTIF PB0007.1 Bhlhb2_1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 22 nsites= 100 E= 0 0.350000 0.110000 0.400000 0.140000 0.300000 0.180000 0.320000 0.200000 0.424242 0.222222 0.111111 0.242424 0.390000 0.130000 0.160000 0.320000 0.202020 0.242424 0.303030 0.252525 0.346535 0.188119 0.277228 0.188119 0.230000 0.140000 0.410000 0.220000 0.040000 0.010000 0.230000 0.720000 0.060000 0.940000 0.000000 0.000000 0.970000 0.000000 0.020000 0.010000 0.000000 0.960000 0.010000 0.030000 0.030000 0.010000 0.960000 0.000000 0.010000 0.020000 0.000000 0.970000 0.000000 0.000000 0.940000 0.060000 0.720000 0.230000 0.010000 0.040000 0.019802 0.465347 0.316832 0.198020 0.170000 0.360000 0.210000 0.260000 0.410000 0.260000 0.130000 0.200000 0.350000 0.210000 0.260000 0.180000 0.210000 0.280000 0.200000 0.310000 0.434343 0.111111 0.181818 0.272727 0.212121 0.363636 0.171717 0.252525 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PB0007.1