MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF MA0544.1 snpc-4 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 310 E= 0 0.290323 0.022581 0.564516 0.122581 0.009677 0.109677 0.009677 0.870968 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.006452 0.006452 0.000000 0.987097 0.009677 0.983871 0.000000 0.006452 0.025806 0.038710 0.896774 0.038710 0.012903 0.006452 0.964516 0.016129 0.038710 0.825806 0.048387 0.087097 0.000000 0.577419 0.096774 0.325806 0.032258 0.000000 0.954839 0.012903 0.000000 0.945161 0.003226 0.051613 0.125806 0.209677 0.119355 0.545161 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0544.1 MOTIF MA0246.1 so letter-probability matrix: alength= 4 w= 6 nsites= 27 E= 0 0.000000 0.000000 0.037037 0.962963 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.037037 0.962963 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.769231 0.000000 0.230769 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0246.1 MOTIF MA0082.1 squamosa letter-probability matrix: alength= 4 w= 14 nsites= 30 E= 0 0.366667 0.466667 0.033333 0.133333 0.000000 0.733333 0.000000 0.266667 0.800000 0.000000 0.133333 0.066667 0.533333 0.066667 0.033333 0.366667 0.766667 0.000000 0.000000 0.233333 0.566667 0.000000 0.000000 0.433333 0.800000 0.033333 0.000000 0.166667 0.266667 0.000000 0.033333 0.700000 0.466667 0.033333 0.500000 0.000000 0.033333 0.033333 0.933333 0.000000 0.466667 0.166667 0.033333 0.333333 0.833333 0.166667 0.000000 0.000000 0.700000 0.066667 0.100000 0.133333 0.233333 0.166667 0.266667 0.333333 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0082.1 MOTIF MA0533.1 su(Hw) letter-probability matrix: alength= 4 w= 21 nsites= 4737 E= 0 0.070931 0.239181 0.592780 0.097108 0.051298 0.868904 0.007389 0.072409 0.164239 0.633523 0.048765 0.153473 0.180494 0.312434 0.206249 0.300823 0.584125 0.123707 0.195271 0.096897 0.725776 0.043910 0.111674 0.118640 0.890226 0.019633 0.062276 0.027866 0.824150 0.004011 0.066709 0.105130 0.086553 0.049609 0.793540 0.070298 0.003589 0.093097 0.020266 0.883048 0.902681 0.004433 0.020055 0.072831 0.001478 0.002322 0.240659 0.755541 0.042010 0.001056 0.955457 0.001478 0.024488 0.969812 0.001267 0.004433 0.595525 0.086764 0.001689 0.316023 0.716065 0.062487 0.150517 0.070931 0.110407 0.512983 0.040321 0.336289 0.535149 0.074731 0.297446 0.092675 0.383154 0.271058 0.162550 0.183238 0.470973 0.094364 0.072831 0.361832 0.421364 0.080008 0.074098 0.424530 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0533.1 MOTIF MA0247.1 tin letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 16 E= 0 0.000000 0.562500 0.187500 0.250000 0.062500 0.000000 0.000000 0.937500 0.000000 0.687500 0.062500 0.250000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.187500 0.000000 0.812500 0.000000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0247.1 MOTIF MA0247.2 tin letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 515 E= 0 0.264078 0.104854 0.155340 0.475728 0.000000 0.365049 0.266019 0.368932 0.000000 0.099029 0.000000 0.900971 0.000000 0.825243 0.066019 0.108738 0.633010 0.000000 0.366990 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.025243 0.304854 0.584466 0.085437 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0247.2 MOTIF MA0459.1 tll letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 33 E= 0 0.606061 0.121212 0.121212 0.151515 0.878788 0.000000 0.121212 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.939394 0.030303 0.030303 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.060606 0.000000 0.939394 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.939394 0.000000 0.030303 0.030303 0.515152 0.303030 0.060606 0.121212 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0459.1 MOTIF MA0460.1 ttk letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 22 E= 0 0.454545 0.363636 0.136364 0.045455 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.227273 0.000000 0.772727 0.954545 0.000000 0.000000 0.045455 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.045455 0.227273 0.136364 0.590909 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0460.1 MOTIF MA0248.1 tup letter-probability matrix: alength= 4 w= 7 nsites= 16 E= 0 0.250000 0.125000 0.062500 0.562500 0.062500 0.000000 0.000000 0.937500 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.125000 0.875000 0.062500 0.000000 0.437500 0.500000 0.125000 0.000000 0.812500 0.062500 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0248.1 MOTIF MA0249.1 twi letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 15 E= 0 0.066667 0.266667 0.200000 0.466667 0.200000 0.466667 0.200000 0.133333 0.066667 0.200000 0.666667 0.066667 0.000000 0.933333 0.066667 0.000000 0.733333 0.200000 0.066667 0.000000 0.000000 0.266667 0.066667 0.666667 0.466667 0.066667 0.333333 0.133333 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.800000 0.200000 0.066667 0.000000 0.133333 0.800000 0.066667 0.133333 0.133333 0.666667 0.133333 0.200000 0.533333 0.133333 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0249.1