MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF PL0010.1 hlh-2::hlh-19 letter-probability matrix: alength= 4 w= 16 nsites= 97 E= 0 0.216495 0.123711 0.319588 0.340206 0.237113 0.237113 0.247423 0.278351 0.175258 0.103093 0.237113 0.484536 0.540816 0.122449 0.255102 0.081633 0.565657 0.323232 0.080808 0.030303 0.030612 0.948980 0.010204 0.010204 0.959184 0.010204 0.020408 0.010204 0.010204 0.091837 0.642857 0.255102 0.103093 0.525773 0.371134 0.000000 0.030928 0.020619 0.000000 0.948454 0.020202 0.010101 0.929293 0.040404 0.020408 0.061224 0.336735 0.581633 0.080808 0.383838 0.141414 0.393939 0.408163 0.397959 0.071429 0.122449 0.255102 0.326531 0.173469 0.244898 0.265306 0.255102 0.234694 0.244898 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PL0010.1 MOTIF PL0002.1 hlh-2::hlh-3 letter-probability matrix: alength= 4 w= 17 nsites= 98 E= 0 0.326531 0.285714 0.234694 0.153061 0.326531 0.132653 0.367347 0.173469 0.173469 0.183673 0.244898 0.397959 0.500000 0.061224 0.295918 0.142857 0.453608 0.422680 0.123711 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.857143 0.020408 0.122449 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.857143 0.030612 0.112245 0.051546 0.247423 0.072165 0.628866 0.357143 0.224490 0.193878 0.224490 0.428571 0.214286 0.214286 0.142857 0.216495 0.257732 0.123711 0.402062 0.224490 0.336735 0.142857 0.295918 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PL0002.1 MOTIF PL0011.1 hlh-2::hlh-4 letter-probability matrix: alength= 4 w= 17 nsites= 98 E= 0 0.448980 0.234694 0.183673 0.132653 0.540816 0.081633 0.265306 0.112245 0.285714 0.091837 0.071429 0.551020 0.546392 0.000000 0.010309 0.443299 0.226804 0.298969 0.185567 0.288660 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.929293 0.050505 0.020202 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.704082 0.040816 0.255102 0.081633 0.173469 0.061224 0.683673 0.252525 0.282828 0.191919 0.272727 0.367347 0.183673 0.234694 0.214286 0.244898 0.234694 0.183673 0.336735 0.163265 0.306122 0.214286 0.316327 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PL0011.1 MOTIF PL0012.1 hlh-2::hlh-8 letter-probability matrix: alength= 4 w= 16 nsites= 98 E= 0 0.336735 0.214286 0.224490 0.224490 0.142857 0.306122 0.224490 0.326531 0.402062 0.288660 0.175258 0.134021 0.642857 0.163265 0.112245 0.081633 0.785714 0.163265 0.040816 0.010204 0.020408 0.969388 0.000000 0.010204 0.969697 0.010101 0.010101 0.010101 0.000000 0.061224 0.051020 0.887755 0.357143 0.581633 0.061224 0.000000 0.010309 0.010309 0.000000 0.979381 0.000000 0.010204 0.969388 0.020408 0.010204 0.020408 0.785714 0.183673 0.132653 0.214286 0.081633 0.571429 0.285714 0.193878 0.234694 0.285714 0.142857 0.183673 0.255102 0.418367 0.285714 0.397959 0.132653 0.183673 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PL0012.1 MOTIF PL0006.1 hlh-2::lin-32 letter-probability matrix: alength= 4 w= 16 nsites= 99 E= 0 0.282828 0.282828 0.171717 0.262626 0.397959 0.295918 0.183673 0.122449 0.247423 0.154639 0.360825 0.237113 0.474747 0.232323 0.222222 0.070707 0.653061 0.285714 0.061224 0.000000 0.010101 0.989899 0.000000 0.000000 0.989796 0.000000 0.010204 0.000000 0.000000 0.163265 0.642857 0.193878 0.193878 0.642857 0.163265 0.000000 0.000000 0.010204 0.000000 0.989796 0.000000 0.000000 0.989899 0.010101 0.000000 0.061224 0.285714 0.653061 0.051020 0.387755 0.071429 0.489796 0.244898 0.357143 0.173469 0.224490 0.224490 0.244898 0.153061 0.377551 0.216495 0.340206 0.247423 0.195876 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PL0006.1 MOTIF PL0005.1 hlh-30 letter-probability matrix: alength= 4 w= 17 nsites= 98 E= 0 0.387755 0.183673 0.163265 0.265306 0.216495 0.247423 0.309278 0.226804 0.367347 0.112245 0.204082 0.316327 0.622449 0.040816 0.234694 0.102041 0.051020 0.061224 0.040816 0.846939 0.000000 0.989691 0.000000 0.010309 0.959184 0.010204 0.010204 0.020408 0.000000 0.867347 0.000000 0.132653 0.132653 0.000000 0.867347 0.000000 0.020408 0.010204 0.010204 0.959184 0.010309 0.000000 0.989691 0.000000 0.846939 0.040816 0.061224 0.051020 0.000000 0.649485 0.000000 0.350515 0.371134 0.216495 0.144330 0.268041 0.387755 0.193878 0.183673 0.234694 0.282828 0.101010 0.222222 0.393939 0.212121 0.252525 0.242424 0.292929 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PL0005.1 MOTIF MA0227.1 hth letter-probability matrix: alength= 4 w= 6 nsites= 17 E= 0 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.823529 0.000000 0.176471 0.000000 0.000000 0.000000 0.666667 0.333333 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0227.1 MOTIF MA0120.1 id1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 24 E= 0 0.041667 0.041667 0.083333 0.833333 0.125000 0.125000 0.166667 0.583333 0.041667 0.083333 0.375000 0.500000 0.000000 0.375000 0.125000 0.500000 0.000000 0.541667 0.166667 0.291667 0.083333 0.458333 0.166667 0.291667 0.125000 0.333333 0.083333 0.458333 0.041667 0.041667 0.041667 0.875000 0.333333 0.208333 0.041667 0.416667 0.000000 0.250000 0.291667 0.458333 0.000000 0.708333 0.000000 0.291667 0.083333 0.000000 0.750000 0.166667 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0120.1 MOTIF MA0228.1 ind letter-probability matrix: alength= 4 w= 7 nsites= 21 E= 0 0.000000 0.571429 0.000000 0.428571 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.047619 0.952381 0.000000 0.000000 0.380952 0.619048 0.904762 0.000000 0.095238 0.000000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0228.1 MOTIF MA0229.1 inv letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 16 E= 0 0.250000 0.000000 0.187500 0.562500 0.062500 0.562500 0.000000 0.375000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.687500 0.000000 0.312500 0.000000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0229.1