MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF MA0545.1 hlh-1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 381 E= 0 0.186352 0.364829 0.388451 0.060367 0.803150 0.057743 0.139108 0.000000 0.758530 0.039370 0.188976 0.013123 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.178478 0.034121 0.779528 0.007874 0.060367 0.692913 0.031496 0.215223 0.000000 0.007874 0.000000 0.992126 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.254593 0.196850 0.202100 0.346457 0.000000 0.685039 0.057743 0.257218 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0545.1 MOTIF PL0001.1 hlh-11 letter-probability matrix: alength= 4 w= 16 nsites= 99 E= 0 0.323232 0.151515 0.181818 0.343434 0.252525 0.313131 0.121212 0.313131 0.224490 0.275510 0.193878 0.306122 0.244898 0.142857 0.408163 0.204082 0.744898 0.071429 0.163265 0.020408 0.204082 0.071429 0.010204 0.714286 0.020408 0.959184 0.010204 0.010204 0.959184 0.010204 0.010204 0.020408 0.010204 0.040816 0.918367 0.030612 0.040816 0.897959 0.051020 0.010204 0.020408 0.061224 0.010204 0.908163 0.010101 0.010101 0.939394 0.040404 0.612245 0.020408 0.122449 0.244898 0.142857 0.204082 0.204082 0.448980 0.183673 0.418367 0.265306 0.132653 0.212121 0.161616 0.343434 0.282828 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PL0001.1 MOTIF PL0018.1 hlh-25 letter-probability matrix: alength= 4 w= 16 nsites= 98 E= 0 0.387755 0.183673 0.255102 0.173469 0.329897 0.185567 0.319588 0.164948 0.132653 0.173469 0.489796 0.204082 0.397959 0.040816 0.540816 0.020408 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.212121 0.010101 0.757576 0.020202 0.000000 0.897959 0.000000 0.102041 0.151515 0.000000 0.848485 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.101010 0.898990 0.000000 0.959184 0.000000 0.040816 0.010204 0.857143 0.010204 0.122449 0.102041 0.530612 0.081633 0.285714 0.316327 0.234694 0.163265 0.285714 0.226804 0.144330 0.319588 0.309278 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PL0018.1 MOTIF PL0009.1 hlh-26 letter-probability matrix: alength= 4 w= 17 nsites= 99 E= 0 0.232323 0.232323 0.242424 0.292929 0.418367 0.142857 0.224490 0.214286 0.295918 0.204082 0.193878 0.306122 0.183673 0.071429 0.540816 0.204082 0.428571 0.010204 0.561224 0.000000 0.000000 0.979381 0.000000 0.020619 0.836735 0.010204 0.112245 0.040816 0.000000 0.989796 0.000000 0.010204 0.020619 0.000000 0.979381 0.000000 0.010204 0.030612 0.000000 0.959184 0.000000 0.000000 0.989796 0.010204 0.010309 0.195876 0.020619 0.773196 0.051020 0.683673 0.030612 0.234694 0.247423 0.319588 0.175258 0.257732 0.326531 0.183673 0.173469 0.316327 0.350515 0.226804 0.216495 0.206186 0.306122 0.091837 0.204082 0.397959 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PL0009.1 MOTIF PL0004.1 hlh-27 letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 98 E= 0 0.438776 0.142857 0.255102 0.163265 0.132653 0.173469 0.306122 0.387755 0.340206 0.092784 0.525773 0.041237 0.010309 0.969072 0.010309 0.010309 0.234694 0.051020 0.663265 0.051020 0.000000 0.928571 0.000000 0.071429 0.161616 0.000000 0.838384 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.051020 0.948980 0.000000 0.959184 0.000000 0.040816 0.000000 0.886598 0.010309 0.103093 0.070707 0.616162 0.121212 0.191919 0.397959 0.193878 0.142857 0.265306 0.265306 0.173469 0.285714 0.275510 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PL0004.1 MOTIF PL0008.1 hlh-29 letter-probability matrix: alength= 4 w= 17 nsites= 98 E= 0 0.224490 0.295918 0.234694 0.244898 0.288660 0.154639 0.185567 0.371134 0.336735 0.102041 0.387755 0.173469 0.265306 0.316327 0.102041 0.316327 0.050505 0.545455 0.131313 0.272727 0.836735 0.000000 0.153061 0.010204 0.020408 0.938776 0.000000 0.040816 0.030612 0.000000 0.969388 0.000000 0.000000 0.867347 0.000000 0.132653 0.469388 0.000000 0.530612 0.000000 0.010101 0.010101 0.000000 0.979798 0.030612 0.010204 0.948980 0.010204 0.020408 0.010204 0.500000 0.469388 0.051546 0.484536 0.041237 0.422680 0.303030 0.323232 0.111111 0.262626 0.306122 0.234694 0.173469 0.285714 0.422680 0.103093 0.237113 0.237113 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PL0008.1 MOTIF PL0003.1 hlh-2::cnd-1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 16 nsites= 98 E= 0 0.336735 0.326531 0.122449 0.214286 0.163265 0.265306 0.387755 0.183673 0.234694 0.122449 0.346939 0.295918 0.673469 0.183673 0.071429 0.071429 0.734694 0.183673 0.051020 0.030612 0.061224 0.887755 0.020408 0.030612 0.959184 0.010204 0.010204 0.020408 0.010204 0.030612 0.612245 0.346939 0.195876 0.773196 0.020619 0.010309 0.040816 0.000000 0.010204 0.948980 0.030612 0.010204 0.918367 0.040816 0.020202 0.090909 0.111111 0.777778 0.071429 0.500000 0.183673 0.244898 0.224490 0.295918 0.112245 0.367347 0.363636 0.212121 0.181818 0.242424 0.408163 0.163265 0.193878 0.234694 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PL0003.1 MOTIF PL0017.1 hlh-2::hlh-10 letter-probability matrix: alength= 4 w= 17 nsites= 99 E= 0 0.212121 0.323232 0.232323 0.232323 0.247423 0.309278 0.164948 0.278351 0.204082 0.153061 0.397959 0.244898 0.163265 0.244898 0.306122 0.285714 0.755102 0.132653 0.091837 0.020408 0.826531 0.081633 0.091837 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.010101 0.151515 0.838384 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.010101 0.232323 0.383838 0.373737 0.112245 0.193878 0.244898 0.448980 0.214286 0.357143 0.255102 0.173469 0.163265 0.244898 0.295918 0.295918 0.336735 0.183673 0.285714 0.193878 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PL0017.1 MOTIF PL0015.1 hlh-2::hlh-14 letter-probability matrix: alength= 4 w= 16 nsites= 98 E= 0 0.234694 0.255102 0.244898 0.265306 0.204082 0.193878 0.255102 0.346939 0.571429 0.112245 0.173469 0.142857 0.636364 0.151515 0.191919 0.020202 0.010309 0.989691 0.000000 0.000000 0.989796 0.000000 0.000000 0.010204 0.000000 0.418367 0.326531 0.255102 0.020408 0.969388 0.010204 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.989796 0.010204 0.000000 0.142857 0.081633 0.775510 0.020408 0.734694 0.020408 0.224490 0.346939 0.275510 0.275510 0.102041 0.346939 0.255102 0.214286 0.183673 0.285714 0.153061 0.275510 0.285714 0.494949 0.161616 0.131313 0.212121 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PL0015.1 MOTIF PL0013.1 hlh-2::hlh-15 letter-probability matrix: alength= 4 w= 16 nsites= 98 E= 0 0.326531 0.153061 0.357143 0.163265 0.255102 0.224490 0.336735 0.183673 0.469388 0.408163 0.061224 0.061224 0.214286 0.387755 0.346939 0.051020 0.010309 0.979381 0.000000 0.010309 0.959184 0.000000 0.000000 0.040816 0.000000 0.387755 0.551020 0.061224 0.051546 0.804124 0.134021 0.010309 0.010101 0.010101 0.010101 0.969697 0.000000 0.010204 0.969388 0.020408 0.051020 0.265306 0.428571 0.255102 0.091837 0.030612 0.724490 0.153061 0.132653 0.408163 0.244898 0.214286 0.163265 0.561224 0.122449 0.153061 0.298969 0.515464 0.123711 0.061856 0.071429 0.122449 0.193878 0.612245 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PL0013.1