MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF MA0922.1 ces-2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 999 E= 0 0.990991 0.003003 0.003003 0.003003 0.001998 0.001998 0.001998 0.994006 0.167000 0.002000 0.002000 0.829000 0.994006 0.001998 0.001998 0.001998 0.001998 0.663337 0.001998 0.332667 0.498000 0.002000 0.498000 0.002000 0.002000 0.167000 0.002000 0.829000 0.994006 0.001998 0.001998 0.001998 0.990991 0.003003 0.003003 0.003003 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0922.1 MOTIF MA0260.1 che-1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 6 nsites= 37 E= 0 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.513514 0.000000 0.486486 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.702703 0.297297 0.000000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0260.1 MOTIF MA0530.1 cnc::maf-S letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 474 E= 0 0.299578 0.238397 0.335443 0.126582 0.717300 0.042194 0.240506 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.858650 0.097046 0.044304 0.000000 0.000000 0.616034 0.168776 0.215190 0.168776 0.000000 0.356540 0.474684 0.164557 0.453586 0.189873 0.191983 0.286920 0.069620 0.343882 0.299578 0.050633 0.000000 0.890295 0.059072 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.776371 0.000000 0.223629 0.000000 0.280591 0.270042 0.208861 0.240506 0.466245 0.132911 0.000000 0.400844 0.451477 0.025316 0.000000 0.523207 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0530.1 MOTIF MA0218.1 ct letter-probability matrix: alength= 4 w= 6 nsites= 20 E= 0 0.000000 0.300000 0.000000 0.700000 0.050000 0.100000 0.000000 0.850000 0.450000 0.000000 0.550000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.850000 0.000000 0.050000 0.100000 0.000000 0.950000 0.050000 0.000000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0218.1 MOTIF MA0538.1 daf-12 letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 156 E= 0 0.141026 0.128205 0.724359 0.006410 0.455128 0.000000 0.083333 0.461538 0.211538 0.000000 0.788462 0.000000 0.147436 0.333333 0.038462 0.480769 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.333333 0.000000 0.666667 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.096154 0.160256 0.089744 0.653846 0.000000 0.128205 0.621795 0.250000 0.006410 0.000000 0.000000 0.993590 0.000000 0.006410 0.987179 0.006410 0.000000 0.506410 0.102564 0.391026 0.205128 0.000000 0.538462 0.256410 0.108974 0.128205 0.179487 0.583333 0.108974 0.275641 0.358974 0.256410 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0538.1 MOTIF MA0022.1 dl letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 13 E= 0 0.000000 0.384615 0.461538 0.153846 0.000000 0.000000 0.923077 0.076923 0.000000 0.076923 0.846154 0.076923 0.000000 0.000000 0.769231 0.230769 0.076923 0.076923 0.230769 0.615385 0.076923 0.000000 0.153846 0.769231 0.076923 0.000000 0.000000 0.923077 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.230769 0.000000 0.769231 0.076923 0.692308 0.000000 0.230769 0.076923 0.692308 0.076923 0.153846 0.230769 0.384615 0.384615 0.000000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0022.1 MOTIF MA0023.1 dl(var.2) letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 9 E= 0 0.000000 0.111111 0.777778 0.111111 0.000000 0.000000 0.777778 0.222222 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.888889 0.111111 0.444444 0.111111 0.000000 0.444444 0.222222 0.111111 0.000000 0.666667 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.111111 0.000000 0.888889 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.111111 0.888889 0.000000 0.000000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0023.1 MOTIF MA1273.1 dof4.2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 19 nsites= 598 E= 0 0.481605 0.117057 0.177258 0.224080 0.469900 0.163880 0.160535 0.205686 0.506689 0.122074 0.180602 0.190635 0.394649 0.125418 0.242475 0.237458 0.357860 0.183946 0.277592 0.180602 0.797659 0.063545 0.080268 0.058528 0.969900 0.000000 0.000000 0.030100 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.187291 0.000000 0.774247 0.038462 0.148829 0.423077 0.046823 0.381271 0.578595 0.100334 0.117057 0.204013 0.652174 0.063545 0.120401 0.163880 0.590301 0.110368 0.083612 0.215719 0.506689 0.073579 0.175585 0.244147 0.476589 0.125418 0.198997 0.198997 0.443144 0.157191 0.200669 0.198997 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1273.1 MOTIF MA1269.1 dof4.5 letter-probability matrix: alength= 4 w= 14 nsites= 600 E= 0 0.303333 0.180000 0.323333 0.193333 0.670000 0.120000 0.078333 0.131667 0.581667 0.011667 0.045000 0.361667 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.173333 0.208333 0.095000 0.523333 0.470000 0.025000 0.225000 0.280000 0.391667 0.090000 0.388333 0.130000 0.231667 0.601667 0.075000 0.091667 0.151667 0.080000 0.055000 0.713333 0.111667 0.051667 0.075000 0.761667 0.108333 0.085000 0.040000 0.766667 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1269.1 MOTIF MA0540.1 dpy-27 letter-probability matrix: alength= 4 w= 16 nsites= 22 E= 0 0.000000 0.272727 0.136364 0.590909 0.090909 0.363636 0.363636 0.181818 0.045455 0.000000 0.136364 0.818182 0.045455 0.863636 0.000000 0.090909 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.636364 0.363636 0.045455 0.863636 0.045455 0.045455 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.954545 0.000000 0.045455 0.136364 0.136364 0.590909 0.136364 0.727273 0.000000 0.000000 0.272727 0.363636 0.000000 0.136364 0.500000 0.409091 0.000000 0.272727 0.318182 0.545455 0.045455 0.409091 0.000000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0540.1