MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF MA0209.1 ap letter-probability matrix: alength= 4 w= 7 nsites= 19 E= 0 0.105263 0.526316 0.000000 0.368421 0.052632 0.000000 0.000000 0.947368 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.315789 0.684211 0.842105 0.000000 0.157895 0.000000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0209.1 MOTIF MA0210.1 ara letter-probability matrix: alength= 4 w= 5 nsites= 34 E= 0 0.411765 0.000000 0.147059 0.441176 0.676471 0.000000 0.000000 0.323529 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0210.1 MOTIF SA0001.1 at_AC_acceptor letter-probability matrix: alength= 4 w= 20 nsites= 70794 E= 0 0.149179 0.267763 0.138105 0.444953 0.136876 0.267071 0.134927 0.461127 0.126819 0.277057 0.128203 0.467921 0.115306 0.274698 0.122680 0.487315 0.105517 0.271859 0.117171 0.505452 0.095149 0.272636 0.105291 0.526923 0.087832 0.256208 0.102791 0.553168 0.088722 0.275730 0.108328 0.527220 0.101548 0.288683 0.113894 0.495875 0.110758 0.318516 0.104260 0.466466 0.116846 0.328940 0.091095 0.463118 0.087931 0.336399 0.064271 0.511399 0.091293 0.288767 0.063056 0.556883 0.240783 0.268737 0.200342 0.290138 0.059821 0.632864 0.002034 0.305280 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.260785 0.141580 0.484490 0.113145 0.246334 0.188406 0.191598 0.373662 0.266110 0.229356 0.230994 0.273540 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/SA0001.1 MOTIF SA0002.1 at_AC_acceptor letter-probability matrix: alength= 4 w= 20 nsites= 548 E= 0 0.144161 0.248175 0.131387 0.476277 0.147810 0.255474 0.153285 0.443431 0.124088 0.251825 0.124088 0.500000 0.144161 0.281022 0.127737 0.447080 0.131387 0.253650 0.116788 0.498175 0.093066 0.270073 0.104015 0.532847 0.080292 0.233577 0.104015 0.582117 0.094891 0.264599 0.109489 0.531022 0.087591 0.277372 0.120438 0.514599 0.136861 0.333942 0.116788 0.412409 0.122263 0.335766 0.080292 0.461679 0.094891 0.339416 0.067518 0.498175 0.096715 0.264599 0.058394 0.580292 0.239051 0.240876 0.208029 0.312044 0.036496 0.644161 0.005474 0.313869 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.290146 0.111314 0.516423 0.082117 0.271898 0.184307 0.166058 0.377737 0.273723 0.215328 0.228102 0.282847 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/SA0002.1 MOTIF SA0003.1 at_AC_acceptor letter-probability matrix: alength= 4 w= 20 nsites= 59 E= 0 0.067797 0.457627 0.067797 0.406780 0.033898 0.491525 0.050847 0.423729 0.152542 0.271186 0.016949 0.559322 0.186441 0.169492 0.050847 0.593220 0.305085 0.169492 0.135593 0.389831 0.457627 0.203390 0.050847 0.288136 0.237288 0.406780 0.033898 0.322034 0.254237 0.338983 0.101695 0.305085 0.186441 0.305085 0.203390 0.305085 0.203390 0.305085 0.084746 0.406780 0.237288 0.203390 0.169492 0.389831 0.237288 0.406780 0.101695 0.254237 0.067797 0.288136 0.135593 0.508475 0.152542 0.237288 0.169492 0.440678 0.101695 0.508475 0.000000 0.389831 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.220339 0.322034 0.203390 0.254237 0.050847 0.186441 0.152542 0.610169 0.288136 0.101695 0.169492 0.440678 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/SA0003.1 MOTIF SD0001.1 at_AC_acceptor letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 70794 E= 0 0.348278 0.349154 0.182459 0.120109 0.645196 0.103144 0.108060 0.143600 0.104938 0.028265 0.794954 0.071842 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.627016 0.025030 0.318318 0.029635 0.695539 0.072294 0.110758 0.121409 0.091717 0.054835 0.771167 0.082281 0.183631 0.142032 0.182049 0.492287 0.309419 0.185835 0.277594 0.227152 0.233367 0.238537 0.225174 0.302921 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/SD0001.1 MOTIF SD0002.1 at_AC_acceptor letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 548 E= 0 0.406934 0.359489 0.173358 0.060219 0.841241 0.031022 0.036496 0.091241 0.027372 0.001825 0.956204 0.014599 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.919708 0.020073 0.041971 0.018248 0.819343 0.029197 0.087591 0.063869 0.016423 0.016423 0.958029 0.009124 0.071168 0.074818 0.078467 0.775547 0.341241 0.135036 0.357664 0.166058 0.197080 0.250000 0.217153 0.335766 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/SD0002.1 MOTIF SD0003.1 at_AC_acceptor letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 59 E= 0 0.338983 0.220339 0.203390 0.237288 0.440678 0.186441 0.118644 0.254237 0.254237 0.237288 0.389831 0.118644 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.949153 0.000000 0.050847 0.000000 0.118644 0.016949 0.016949 0.847458 0.000000 0.830508 0.152542 0.016949 0.016949 0.830508 0.000000 0.152542 0.118644 0.033898 0.016949 0.830508 0.016949 0.067797 0.033898 0.881356 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/SD0003.1 MOTIF MF0007.1 bHLH(zip) class letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 0 0.613500 0.121200 0.229700 0.035600 0.217822 0.350635 0.265527 0.166017 0.037404 0.909591 0.014801 0.038204 0.838684 0.011601 0.086409 0.063306 0.040296 0.651535 0.210679 0.097490 0.058100 0.257300 0.677900 0.006700 0.050600 0.041300 0.001800 0.906300 0.028500 0.000000 0.949600 0.021900 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MF0007.1 MOTIF MA1358.1 bHLH130 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 185 E= 0 0.351351 0.075676 0.291892 0.281081 0.167568 0.178378 0.367568 0.286486 0.000000 0.994595 0.005405 0.000000 0.529730 0.470270 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.005405 0.994595 0.000000 0.000000 0.005405 0.000000 0.000000 0.994595 0.021622 0.000000 0.000000 0.978378 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.097297 0.567568 0.091892 0.243243 0.427027 0.281081 0.102703 0.189189 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1358.1