MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF PB0206.1 Zic2_2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 100 E= 0 0.200000 0.340000 0.180000 0.280000 0.240000 0.350000 0.170000 0.240000 0.350000 0.030000 0.310000 0.310000 0.100000 0.870000 0.020000 0.010000 0.310000 0.260000 0.280000 0.150000 0.000000 0.979798 0.000000 0.020202 0.891089 0.029703 0.019802 0.059406 0.049505 0.009901 0.930693 0.009901 0.000000 0.860000 0.010000 0.130000 0.770000 0.000000 0.190000 0.040000 0.010000 0.020000 0.590000 0.380000 0.000000 0.010000 0.960000 0.030000 0.370000 0.230000 0.200000 0.200000 0.270000 0.190000 0.430000 0.110000 0.444444 0.101010 0.212121 0.242424 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PB0206.1 MOTIF PB0103.1 Zic3_1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 99 E= 0 0.131313 0.373737 0.252525 0.242424 0.310000 0.450000 0.090000 0.150000 0.130000 0.720000 0.030000 0.120000 0.130000 0.750000 0.050000 0.070000 0.118812 0.801980 0.039604 0.039604 0.049505 0.811881 0.079208 0.059406 0.050000 0.790000 0.140000 0.020000 0.059406 0.089109 0.663366 0.188119 0.059406 0.079208 0.811881 0.049505 0.039604 0.039604 0.801980 0.118812 0.070000 0.050000 0.750000 0.130000 0.120000 0.030000 0.720000 0.130000 0.100000 0.070000 0.640000 0.190000 0.070000 0.200000 0.580000 0.150000 0.148515 0.237624 0.227723 0.386139 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PB0103.1 MOTIF PB0207.1 Zic3_2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 100 E= 0 0.230000 0.220000 0.280000 0.270000 0.330000 0.180000 0.210000 0.280000 0.306931 0.019802 0.386139 0.287129 0.100000 0.870000 0.020000 0.010000 0.540000 0.090000 0.240000 0.130000 0.000000 0.979798 0.000000 0.020202 0.900000 0.020000 0.020000 0.060000 0.039604 0.009901 0.940594 0.009901 0.000000 0.830000 0.010000 0.160000 0.727273 0.000000 0.222222 0.050505 0.010101 0.020202 0.565657 0.404040 0.000000 0.010101 0.949495 0.040404 0.480000 0.270000 0.110000 0.140000 0.227723 0.297030 0.257426 0.217822 0.366337 0.188119 0.198020 0.247525 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PB0207.1 MOTIF MA0116.1 Znf423 letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 33 E= 0 0.212121 0.121212 0.666667 0.000000 0.000000 0.484848 0.515152 0.000000 0.484848 0.515152 0.000000 0.000000 0.515152 0.484848 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.030303 0.515152 0.000000 0.454545 0.727273 0.000000 0.000000 0.272727 0.393939 0.000000 0.484848 0.121212 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.515152 0.484848 0.000000 0.000000 0.484848 0.515152 0.000000 0.242424 0.484848 0.272727 0.333333 0.666667 0.000000 0.000000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0116.1 MOTIF PB0104.1 Zscan4_1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 17 nsites= 100 E= 0 0.200000 0.160000 0.310000 0.330000 0.356436 0.267327 0.148515 0.227723 0.250000 0.300000 0.240000 0.210000 0.490000 0.120000 0.210000 0.180000 0.120000 0.050000 0.060000 0.770000 0.020000 0.010000 0.970000 0.000000 0.009901 0.029703 0.009901 0.950495 0.030000 0.000000 0.970000 0.000000 0.000000 0.970000 0.000000 0.030000 0.950495 0.009901 0.029703 0.009901 0.000000 0.970000 0.010000 0.020000 0.770000 0.060000 0.050000 0.120000 0.040404 0.383838 0.040404 0.535354 0.750000 0.050000 0.040000 0.160000 0.360000 0.230000 0.090000 0.320000 0.440000 0.110000 0.220000 0.230000 0.300000 0.290000 0.200000 0.210000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PB0104.1 MOTIF PB0208.1 Zscan4_2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 16 nsites= 100 E= 0 0.280000 0.390000 0.110000 0.220000 0.270000 0.330000 0.360000 0.040000 0.444444 0.232323 0.020202 0.303030 0.410000 0.140000 0.390000 0.060000 0.040000 0.010000 0.940000 0.010000 0.070000 0.910000 0.020000 0.000000 0.960000 0.010000 0.010000 0.020000 0.040000 0.940000 0.010000 0.010000 0.960396 0.009901 0.019802 0.009901 0.070000 0.640000 0.040000 0.250000 0.800000 0.070000 0.010000 0.120000 0.770000 0.120000 0.020000 0.090000 0.320000 0.240000 0.210000 0.230000 0.370000 0.190000 0.130000 0.310000 0.297030 0.247525 0.099010 0.356436 0.330000 0.240000 0.250000 0.180000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PB0208.1 MOTIF MA0206.1 abd-A letter-probability matrix: alength= 4 w= 7 nsites= 18 E= 0 0.055556 0.166667 0.000000 0.777778 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.888889 0.000000 0.000000 0.111111 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.055556 0.000000 0.000000 0.944444 0.000000 0.000000 0.333333 0.666667 0.833333 0.055556 0.111111 0.000000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0206.1 MOTIF MA0123.1 abi4 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 49 E= 0 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.244898 0.000000 0.755102 0.000000 0.000000 0.408163 0.591837 0.000000 0.000000 0.469388 0.020408 0.510204 0.020408 0.061224 0.918367 0.000000 0.000000 0.918367 0.081633 0.000000 0.102041 0.571429 0.122449 0.204082 0.061224 0.510204 0.224490 0.204082 0.061224 0.632653 0.102041 0.204082 0.081633 0.530612 0.142857 0.244898 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0123.1 MOTIF MA0207.1 achi letter-probability matrix: alength= 4 w= 6 nsites= 23 E= 0 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.956522 0.000000 0.043478 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.176471 0.000000 0.705882 0.117647 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0207.1 MOTIF MA0208.1 al letter-probability matrix: alength= 4 w= 7 nsites= 20 E= 0 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.850000 0.000000 0.150000 0.000000 0.900000 0.000000 0.100000 0.000000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0208.1