MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF MA0461.2 Atoh1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 1194 E= 0 0.548576 0.090452 0.311558 0.049414 0.509250 0.325219 0.145083 0.020448 0.038997 0.953575 0.007428 0.000000 0.950046 0.018501 0.031452 0.000000 0.014286 0.008403 0.114286 0.863025 0.932788 0.067212 0.000000 0.000000 0.020794 0.003781 0.004726 0.970699 0.001885 0.000943 0.967955 0.029218 0.033074 0.227626 0.365759 0.373541 0.099922 0.385636 0.098361 0.416081 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0461.2 MOTIF MA0167.1 Awh letter-probability matrix: alength= 4 w= 7 nsites= 40 E= 0 0.075000 0.400000 0.000000 0.525000 0.025000 0.000000 0.000000 0.975000 0.825000 0.000000 0.175000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.025000 0.975000 0.000000 0.000000 0.200000 0.800000 0.850000 0.000000 0.100000 0.050000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0167.1 MOTIF MA0168.1 B-H1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 7 nsites= 21 E= 0 0.190476 0.190476 0.000000 0.619048 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.380952 0.000000 0.000000 0.619048 0.047619 0.333333 0.000000 0.619048 0.047619 0.000000 0.952381 0.000000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0168.1 MOTIF MA0169.1 B-H2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 7 nsites= 21 E= 0 0.285714 0.095238 0.047619 0.571429 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.238095 0.000000 0.000000 0.761905 0.142857 0.047619 0.095238 0.714286 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0169.1 MOTIF MA1101.1 BACH2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 14 nsites= 1895 E= 0 0.190501 0.259631 0.359894 0.189974 0.449604 0.273879 0.223219 0.053298 0.005805 0.010026 0.005277 0.978892 0.011609 0.007388 0.943008 0.037995 0.971504 0.010026 0.007916 0.010554 0.038522 0.760422 0.153562 0.047493 0.058047 0.007916 0.015831 0.918206 0.032190 0.949340 0.007388 0.011082 0.957256 0.006860 0.016359 0.019525 0.023747 0.025330 0.864908 0.086016 0.041689 0.886544 0.045383 0.026385 0.703958 0.084433 0.090237 0.121372 0.270185 0.213193 0.264380 0.252243 0.279683 0.194723 0.155145 0.370449 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1101.1 MOTIF MA0635.1 BARHL2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 12855 E= 0 0.258110 0.268378 0.340257 0.133256 0.258888 0.317231 0.136601 0.287281 0.047637 0.000000 0.000000 0.952363 0.867175 0.000000 0.000000 0.132825 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.710653 0.006413 0.060036 0.222898 0.020915 0.606912 0.005996 0.366177 0.099619 0.000000 0.815673 0.084708 0.280513 0.170362 0.379385 0.169739 0.168884 0.233139 0.099261 0.498716 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0635.1 MOTIF MA0875.1 BARX1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 6806 E= 0 0.275051 0.267558 0.328534 0.128857 0.077215 0.672425 0.032195 0.218165 0.490741 0.292769 0.203704 0.012787 0.944614 0.028734 0.026652 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.281705 0.204409 0.355621 0.158266 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0875.1 MOTIF MA0278.1 BAS1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 21 nsites= 998 E= 0 0.064128 0.217435 0.425852 0.292585 0.104208 0.553106 0.150301 0.192385 0.485456 0.111334 0.114343 0.288867 0.078156 0.401804 0.186373 0.333667 0.455912 0.051102 0.370741 0.122244 0.248497 0.034068 0.671343 0.046092 0.098196 0.725451 0.143287 0.033066 0.052156 0.920762 0.007021 0.020060 0.348697 0.346693 0.280561 0.024048 0.012024 0.003006 0.978958 0.006012 0.967936 0.005010 0.023046 0.004008 0.026052 0.006012 0.963928 0.004008 0.009018 0.010020 0.004008 0.976954 0.047047 0.930931 0.007007 0.015015 0.892893 0.042042 0.016016 0.049049 0.487976 0.123246 0.320641 0.068136 0.288288 0.140140 0.317317 0.254254 0.373747 0.110220 0.081162 0.434870 0.178536 0.368104 0.184554 0.268806 0.403210 0.140421 0.342026 0.114343 0.435435 0.229229 0.241241 0.094094 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0278.1 MOTIF MA0835.1 BATF3 letter-probability matrix: alength= 4 w= 14 nsites= 793 E= 0 0.050441 0.123581 0.037831 0.788146 0.027778 0.013285 0.938406 0.020531 0.925234 0.025701 0.046729 0.002336 0.001364 0.000000 0.000000 0.998636 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.002008 0.997992 0.000000 0.000000 0.010610 0.000000 0.989390 0.000000 0.000000 0.000000 0.002882 0.997118 0.011450 0.979008 0.003817 0.005725 0.995261 0.000000 0.000000 0.004739 0.006623 0.051656 0.035762 0.905960 0.032086 0.926916 0.012478 0.028520 0.618718 0.041594 0.254766 0.084922 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0835.1 MOTIF MA0462.1 BATF::JUN letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 10522 E= 0 0.292910 0.045714 0.488120 0.173256 0.454476 0.052557 0.274568 0.218400 0.429481 0.016157 0.210891 0.343471 0.784832 0.140468 0.000000 0.074701 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.985934 0.014066 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.055693 0.477666 0.466641 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.122695 0.816385 0.060920 0.000000 0.975480 0.000000 0.000000 0.024520 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0462.1