MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF MA1287.1 At5g08330 letter-probability matrix: alength= 4 w= 14 nsites= 598 E= 0 0.314381 0.128763 0.165552 0.391304 0.058528 0.008361 0.933110 0.000000 0.000000 0.033445 0.000000 0.966555 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.090301 0.001672 0.869565 0.038462 0.257525 0.483278 0.055184 0.204013 0.000000 0.998328 0.000000 0.001672 0.025084 0.973244 0.000000 0.001672 0.103679 0.693980 0.023411 0.178930 0.709030 0.061873 0.147157 0.081940 0.096990 0.565217 0.108696 0.229097 0.255853 0.250836 0.197324 0.295987 0.269231 0.173913 0.160535 0.396321 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1287.1 MOTIF MA1399.1 At5g08520 letter-probability matrix: alength= 4 w= 13 nsites= 598 E= 0 0.324415 0.115385 0.277592 0.282609 0.488294 0.038462 0.120401 0.352843 0.414716 0.028428 0.025084 0.531773 0.349498 0.070234 0.301003 0.279264 0.369565 0.098662 0.050167 0.481605 0.329431 0.003344 0.628763 0.038462 0.000000 0.000000 0.996656 0.003344 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.986622 0.000000 0.013378 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.008361 0.088629 0.827759 0.075251 0.341137 0.066890 0.521739 0.070234 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1399.1 MOTIF MA1398.1 At5g47390 letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 599 E= 0 0.375626 0.198664 0.086811 0.338898 0.317195 0.203673 0.111853 0.367279 0.462437 0.121870 0.105175 0.310518 0.484140 0.075125 0.153589 0.287145 0.126878 0.475793 0.080134 0.317195 0.227045 0.500835 0.095159 0.176962 0.018364 0.073456 0.000000 0.908180 0.018364 0.010017 0.025042 0.946578 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.879800 0.000000 0.120200 0.736227 0.006678 0.123539 0.133556 0.357262 0.210351 0.046745 0.385643 0.509182 0.026711 0.015025 0.449082 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1398.1 MOTIF MA1183.1 At5g52660 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 596 E= 0 0.874161 0.003356 0.073826 0.048658 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.971477 0.001678 0.000000 0.026846 0.000000 0.003356 0.000000 0.996644 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.067114 0.000000 0.001678 0.931208 0.189597 0.060403 0.033557 0.716443 0.151007 0.182886 0.154362 0.511745 0.224832 0.152685 0.236577 0.385906 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1183.1 MOTIF MA1192.1 At5g58900 letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 580 E= 0 0.424138 0.046552 0.043103 0.486207 0.322414 0.112069 0.244828 0.320690 0.375862 0.081034 0.098276 0.444828 0.394828 0.012069 0.539655 0.053448 0.000000 0.000000 0.991379 0.008621 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.998276 0.000000 0.000000 0.001724 0.996552 0.000000 0.001724 0.001724 0.043103 0.091379 0.763793 0.101724 0.389655 0.062069 0.446552 0.101724 0.268966 0.106897 0.070690 0.553448 0.263793 0.094828 0.112069 0.529310 0.400000 0.091379 0.186207 0.322414 0.324138 0.108621 0.225862 0.341379 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1192.1 MOTIF MA0604.1 Atf1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 1000 E= 0 0.462000 0.086000 0.387000 0.065000 0.024000 0.016000 0.000000 0.960000 0.000000 0.022000 0.803000 0.175000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.007000 0.000000 0.993000 0.000000 0.090000 0.198000 0.000000 0.712000 0.599401 0.137862 0.162837 0.099900 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0604.1 MOTIF PB0004.1 Atf1_1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 16 nsites= 100 E= 0 0.380000 0.140000 0.240000 0.240000 0.138614 0.415842 0.198020 0.247525 0.160000 0.100000 0.410000 0.330000 0.470000 0.100000 0.390000 0.040000 0.009901 0.029703 0.009901 0.950495 0.010101 0.010101 0.868687 0.111111 0.969697 0.000000 0.010101 0.020202 0.000000 0.959596 0.000000 0.040404 0.040404 0.000000 0.959596 0.000000 0.020202 0.010101 0.000000 0.969697 0.111111 0.868687 0.010101 0.010101 0.950495 0.009901 0.029703 0.009901 0.050000 0.360000 0.140000 0.450000 0.230000 0.450000 0.140000 0.180000 0.262626 0.101010 0.494949 0.141414 0.350000 0.180000 0.240000 0.230000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PB0004.1 MOTIF PB0108.1 Atf1_2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 14 nsites= 100 E= 0 0.190000 0.210000 0.420000 0.180000 0.320000 0.110000 0.290000 0.280000 0.650000 0.110000 0.200000 0.040000 0.040000 0.050000 0.050000 0.860000 0.080000 0.050000 0.810000 0.060000 0.821782 0.039604 0.069307 0.069307 0.040000 0.860000 0.050000 0.050000 0.160000 0.030000 0.780000 0.030000 0.565657 0.232323 0.080808 0.121212 0.400000 0.020000 0.350000 0.230000 0.020000 0.260000 0.210000 0.510000 0.690000 0.070000 0.100000 0.140000 0.455446 0.108911 0.178218 0.257426 0.260000 0.300000 0.200000 0.240000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PB0108.1 MOTIF MA0605.1 Atf3 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 1000 E= 0 0.087000 0.131000 0.695000 0.087000 0.828000 0.000000 0.172000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.952000 0.048000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.108108 0.000000 0.810811 0.081081 0.096903 0.193806 0.032967 0.676324 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0605.1 MOTIF MA0461.1 Atoh1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 7714 E= 0 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.550817 0.449183 0.000000 0.000000 0.201841 0.000000 0.000000 0.798159 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.619653 0.000000 0.380347 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0461.1