MEME version 4

ALPHABET= ACGT

strands: + -

Background letter frequencies
A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25

MOTIF PF0059.1 WCTCNATGGY
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 328 E= 0
 0.128049  0.000000  0.000000  0.871951
 0.000000  1.000000  0.000000  0.000000
 0.000000  0.000000  0.000000  1.000000
 0.000000  1.000000  0.000000  0.000000
 0.012195  0.390244  0.103659  0.493902
 1.000000  0.000000  0.000000  0.000000
 0.000000  0.000000  0.000000  1.000000
 0.000000  0.000000  1.000000  0.000000
 0.000000  0.000000  1.000000  0.000000
 0.000000  0.378049  0.000000  0.621951
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PF0059.1

MOTIF PF0079.1 WGGAATGY
letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 1148 E= 0
 0.580139  0.000000  0.000000  0.419861
 0.000000  0.000000  1.000000  0.000000
 0.000000  0.000000  1.000000  0.000000
 1.000000  0.000000  0.000000  0.000000
 1.000000  0.000000  0.000000  0.000000
 0.000000  0.000000  0.000000  1.000000
 0.000000  0.000000  1.000000  0.000000
 0.000000  0.425958  0.000000  0.574042
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PF0079.1

MOTIF PF0155.1 WGTTNNNNNAAA
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 1580 E= 0
 0.533544  0.000000  0.000000  0.466456
 0.000000  0.000000  1.000000  0.000000
 0.000000  0.000000  0.000000  1.000000
 0.000000  0.000000  0.000000  1.000000
 0.167722  0.179114  0.227215  0.425949
 0.267722  0.233544  0.228481  0.270253
 0.259494  0.234810  0.160759  0.344937
 0.309494  0.119620  0.291139  0.279747
 0.293038  0.211392  0.256962  0.238608
 1.000000  0.000000  0.000000  0.000000
 1.000000  0.000000  0.000000  0.000000
 1.000000  0.000000  0.000000  0.000000
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PF0155.1

MOTIF MA1306.1 WRKY11
letter-probability matrix: alength= 4 w= 14 nsites= 597 E= 0
 0.380235  0.112228  0.289782  0.217755
 0.249581  0.182580  0.298157  0.269682
 0.179229  0.599665  0.140704  0.080402
 0.018425  0.000000  0.857621  0.123953
 0.000000  0.001675  0.000000  0.998325
 0.001675  0.000000  0.000000  0.998325
 0.000000  0.000000  1.000000  0.000000
 0.996650  0.000000  0.003350  0.000000
 0.000000  1.000000  0.000000  0.000000
 0.026801  0.078727  0.000000  0.894472
 0.098827  0.033501  0.013400  0.854271
 0.093802  0.070352  0.061977  0.773869
 0.170854  0.117253  0.155779  0.556114
 0.241206  0.142379  0.232831  0.383585
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1306.1

MOTIF MA1075.1 WRKY12
letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 1001 E= 0
 0.171828  0.706294  0.075924  0.045954
 0.070000  0.033000  0.819000  0.078000
 0.020000  0.062000  0.005000  0.913000
 0.010000  0.015000  0.029000  0.946000
 0.007992  0.005994  0.953047  0.032967
 0.970030  0.005994  0.009990  0.013986
 0.029029  0.949950  0.005005  0.016016
 0.025025  0.722723  0.101101  0.151151
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1075.1

MOTIF MA1314.1 WRKY14
letter-probability matrix: alength= 4 w= 13 nsites= 598 E= 0
 0.478261  0.214047  0.130435  0.177258
 0.712375  0.063545  0.085284  0.138796
 0.759197  0.036789  0.040134  0.163880
 0.851171  0.001672  0.140468  0.006689
 0.000000  0.000000  1.000000  0.000000
 0.000000  0.000000  0.000000  1.000000
 0.000000  1.000000  0.000000  0.000000
 1.000000  0.000000  0.000000  0.000000
 1.000000  0.000000  0.000000  0.000000
 0.060201  0.918060  0.000000  0.021739
 0.088629  0.090301  0.663880  0.157191
 0.280936  0.275920  0.237458  0.205686
 0.240803  0.262542  0.127090  0.369565
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1314.1

MOTIF MA1076.1 WRKY15
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 1000 E= 0
 0.309000  0.197000  0.248000  0.246000
 0.368368  0.096096  0.464464  0.071071
 0.004000  0.008000  0.949000  0.039000
 0.009000  0.003000  0.004000  0.984000
 0.030000  0.965000  0.002000  0.003000
 0.807000  0.104000  0.026000  0.063000
 0.746000  0.035000  0.154000  0.065000
 0.253000  0.525000  0.089000  0.133000
 0.188811  0.237762  0.395604  0.177822
 0.214000  0.292000  0.275000  0.219000
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1076.1

MOTIF MA1299.1 WRKY17
letter-probability matrix: alength= 4 w= 14 nsites= 127 E= 0
 0.448819  0.196850  0.181102  0.173228
 0.527559  0.188976  0.110236  0.173228
 0.740157  0.070866  0.141732  0.047244
 0.921260  0.000000  0.047244  0.031496
 0.984252  0.000000  0.007874  0.007874
 0.000000  0.000000  1.000000  0.000000
 0.000000  0.039370  0.007874  0.952756
 0.000000  1.000000  0.000000  0.000000
 0.984252  0.000000  0.015748  0.000000
 1.000000  0.000000  0.000000  0.000000
 0.157480  0.763780  0.062992  0.015748
 0.228346  0.070866  0.614173  0.086614
 0.251969  0.299213  0.251969  0.196850
 0.220472  0.330709  0.125984  0.322835
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1299.1

MOTIF MA1077.1 WRKY18
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 1000 E= 0
 0.290000  0.262000  0.204000  0.244000
 0.257742  0.278721  0.151848  0.311688
 0.391608  0.015984  0.584416  0.007992
 0.000999  0.000999  0.987013  0.010989
 0.000000  0.000000  0.002002  0.997998
 0.001000  0.997000  0.000000  0.002000
 0.985000  0.008000  0.002000  0.005000
 0.963037  0.009990  0.010989  0.015984
 0.186000  0.372000  0.289000  0.153000
 0.212212  0.254254  0.398398  0.135135
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1077.1

MOTIF MA1078.1 WRKY2
letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 1000 E= 0
 0.115000  0.393000  0.246000  0.246000
 0.276723  0.010989  0.712288  0.000000
 0.000000  0.000000  1.000000  0.000000
 0.000000  0.000000  0.000000  1.000000
 0.000000  1.000000  0.000000  0.000000
 0.961962  0.019019  0.019019  0.000000
 0.806000  0.000000  0.163000  0.031000
 0.271000  0.528000  0.072000  0.129000
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1078.1

