MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF MA0724.1 VENTX letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 23923 E= 0 0.724993 0.041090 0.080843 0.153074 0.271400 0.379106 0.188737 0.160757 0.019755 0.840908 0.000000 0.139337 0.258121 0.187092 0.534057 0.020729 0.988554 0.008388 0.000000 0.003058 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.328884 0.026326 0.563167 0.081624 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0724.1 MOTIF MA0725.1 VSX1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 14889 E= 0 0.050776 0.567735 0.037679 0.343811 0.096070 0.163832 0.029930 0.710167 0.886769 0.040902 0.036132 0.036197 0.970260 0.011009 0.012296 0.006434 0.012245 0.014168 0.007333 0.966254 0.055381 0.046932 0.060685 0.837003 0.722030 0.027451 0.177528 0.072990 0.193501 0.261956 0.269545 0.274998 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0725.1 MOTIF MA0726.1 VSX2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 14681 E= 0 0.029085 0.650773 0.030311 0.289830 0.060077 0.151583 0.020192 0.768148 0.923617 0.026553 0.022942 0.026888 0.978044 0.008782 0.008712 0.004462 0.008307 0.013094 0.006477 0.972122 0.040520 0.036701 0.028934 0.893844 0.800383 0.018605 0.122240 0.058772 0.209356 0.234847 0.310522 0.245275 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0726.1 MOTIF PH0174.1 Vax1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 16 nsites= 100 E= 0 0.500000 0.240000 0.180000 0.080000 0.191919 0.343434 0.333333 0.131313 0.220000 0.130000 0.530000 0.120000 0.160000 0.150000 0.150000 0.540000 0.010000 0.120000 0.000000 0.870000 0.890000 0.100000 0.000000 0.010000 0.969697 0.010101 0.000000 0.020202 0.020202 0.000000 0.010101 0.969697 0.010000 0.000000 0.100000 0.890000 0.870000 0.000000 0.120000 0.010000 0.350000 0.250000 0.340000 0.060000 0.120000 0.530000 0.130000 0.220000 0.190000 0.370000 0.090000 0.350000 0.227723 0.396040 0.118812 0.257426 0.643564 0.079208 0.128713 0.148515 0.200000 0.100000 0.510000 0.190000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PH0174.1 MOTIF PH0175.1 Vax2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 16 nsites= 101 E= 0 0.158416 0.237624 0.306931 0.297030 0.320000 0.160000 0.190000 0.330000 0.260000 0.260000 0.270000 0.210000 0.171717 0.434343 0.212121 0.181818 0.530000 0.130000 0.260000 0.080000 0.060606 0.565657 0.121212 0.252525 0.010000 0.110000 0.000000 0.880000 0.888889 0.111111 0.000000 0.000000 0.989899 0.000000 0.000000 0.010101 0.010000 0.000000 0.000000 0.990000 0.000000 0.000000 0.020000 0.980000 0.939394 0.000000 0.030303 0.030303 0.500000 0.190000 0.250000 0.060000 0.080000 0.230000 0.410000 0.280000 0.343434 0.212121 0.313131 0.131313 0.168317 0.574257 0.168317 0.089109 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PH0175.1 MOTIF MA0693.1 Vdr letter-probability matrix: alength= 4 w= 16 nsites= 31267 E= 0 0.182685 0.047046 0.764736 0.005533 0.621105 0.000331 0.378534 0.000030 0.000282 0.000176 0.999153 0.000388 0.000150 0.000389 0.115783 0.883678 0.008410 0.014332 0.028947 0.948312 0.000897 0.979369 0.001293 0.018441 0.899443 0.003277 0.091986 0.005294 0.108200 0.260626 0.048650 0.582524 0.171072 0.360522 0.074511 0.393895 0.187325 0.069370 0.728580 0.014725 0.621060 0.000420 0.378429 0.000090 0.000211 0.000070 0.999542 0.000176 0.000063 0.000221 0.079208 0.920508 0.008522 0.012670 0.040214 0.938594 0.000147 0.963162 0.001536 0.035155 0.897135 0.003258 0.096065 0.003543 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0693.1 MOTIF MA0181.1 Vsx1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 7 nsites= 22 E= 0 0.045455 0.363636 0.045455 0.545455 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.090909 0.000000 0.136364 0.772727 0.681818 0.000000 0.272727 0.045455 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0181.1 MOTIF PH0176.1 Vsx1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 17 nsites= 101 E= 0 0.227723 0.524752 0.108911 0.138614 0.151515 0.333333 0.383838 0.131313 0.500000 0.230000 0.090000 0.180000 0.370000 0.060000 0.490000 0.080000 0.060606 0.292929 0.010101 0.636364 0.009901 0.099010 0.000000 0.891089 0.989899 0.010101 0.000000 0.000000 0.980000 0.000000 0.010000 0.010000 0.010000 0.010000 0.000000 0.980000 0.000000 0.000000 0.010101 0.989899 0.891089 0.000000 0.099010 0.009901 0.636364 0.010101 0.292929 0.060606 0.140000 0.280000 0.120000 0.460000 0.326733 0.188119 0.257426 0.227723 0.554455 0.237624 0.138614 0.069307 0.237624 0.227723 0.178218 0.356436 0.150000 0.190000 0.170000 0.490000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PH0176.1 MOTIF MA0180.1 Vsx2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 13 E= 0 0.076923 0.076923 0.384615 0.461538 0.153846 0.153846 0.000000 0.692308 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.769231 0.000000 0.230769 0.000000 0.076923 0.153846 0.769231 0.000000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0180.1 MOTIF PF0152.1 WCAANNNYCAG letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 900 E= 0 0.723333 0.000000 0.000000 0.276667 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.346667 0.310000 0.174444 0.168889 0.158889 0.108889 0.198889 0.533333 0.098889 0.615556 0.116667 0.168889 0.000000 0.767778 0.000000 0.232222 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PF0152.1