MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF MA0093.2 USF1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 16842 E= 0 0.287733 0.223489 0.425246 0.063532 0.087401 0.442228 0.177117 0.293255 0.002553 0.997447 0.000000 0.000000 0.984028 0.000000 0.000000 0.015972 0.011163 0.610319 0.055338 0.323180 0.095297 0.035328 0.869374 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.876499 0.000000 0.081641 0.041860 0.000000 0.781736 0.000000 0.218264 0.108123 0.589360 0.066085 0.236433 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0093.2 MOTIF MA0526.1 USF2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 13819 E= 0 0.287720 0.150011 0.515594 0.046675 0.108184 0.324915 0.138143 0.428758 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.351907 0.099139 0.548954 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.756422 0.053911 0.185831 0.003835 0.000000 0.718504 0.052753 0.228743 0.158043 0.479991 0.032926 0.329040 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0526.1 MOTIF MA0526.2 USF2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 16 nsites= 6730 E= 0 0.202526 0.295394 0.274889 0.227192 0.206984 0.278603 0.282021 0.232392 0.258247 0.203418 0.284844 0.253492 0.227340 0.079643 0.546805 0.146211 0.125111 0.037593 0.830609 0.006686 0.028232 0.072808 0.026746 0.872214 0.001932 0.989896 0.006389 0.001783 0.985884 0.005052 0.006538 0.002526 0.001634 0.961516 0.009510 0.027340 0.071768 0.004309 0.922140 0.001783 0.009361 0.010104 0.008470 0.972065 0.002080 0.002823 0.991976 0.003120 0.399851 0.068648 0.444577 0.086924 0.047400 0.448143 0.182021 0.322437 0.177117 0.388856 0.189302 0.244725 0.266270 0.281724 0.231055 0.220951 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0526.2 MOTIF MA0413.1 USV1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 20 nsites= 997 E= 0 0.269809 0.223671 0.250752 0.255767 0.306613 0.182365 0.216433 0.294589 0.342342 0.168168 0.206206 0.283283 0.131263 0.193387 0.146293 0.529058 0.133400 0.055165 0.157472 0.653962 0.318637 0.552104 0.101202 0.028056 0.001003 0.969910 0.026078 0.003009 0.000000 0.979940 0.000000 0.020060 0.003006 0.994990 0.001002 0.001002 0.001002 0.982966 0.000000 0.016032 0.000000 0.006012 0.003006 0.990982 0.000000 0.002006 0.871615 0.126379 0.958877 0.000000 0.036108 0.005015 0.851703 0.092184 0.021042 0.035070 0.174349 0.257515 0.162325 0.405812 0.233233 0.235235 0.093093 0.438438 0.212212 0.191191 0.197197 0.399399 0.181363 0.185371 0.321643 0.311623 0.205411 0.100200 0.265531 0.428858 0.219659 0.297894 0.366098 0.116349 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0413.1 MOTIF MA0094.1 Ubx letter-probability matrix: alength= 4 w= 4 nsites= 88 E= 0 0.034091 0.000000 0.000000 0.965909 0.818182 0.045455 0.034091 0.102273 0.897727 0.011364 0.068182 0.022727 0.011364 0.056818 0.045455 0.886364 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0094.1 MOTIF MA0094.2 Ubx letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 20 E= 0 0.150000 0.250000 0.150000 0.450000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.850000 0.000000 0.000000 0.150000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.300000 0.700000 0.700000 0.000000 0.300000 0.000000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0094.2 MOTIF PH0173.1 Uncx letter-probability matrix: alength= 4 w= 17 nsites= 99 E= 0 0.303030 0.313131 0.272727 0.111111 0.350000 0.210000 0.230000 0.210000 0.230000 0.170000 0.130000 0.470000 0.480000 0.160000 0.200000 0.160000 0.630000 0.170000 0.110000 0.090000 0.010000 0.150000 0.010000 0.830000 0.010000 0.060000 0.000000 0.930000 0.980000 0.010000 0.010000 0.000000 0.980000 0.000000 0.010000 0.010000 0.010000 0.010000 0.000000 0.980000 0.000000 0.010000 0.010000 0.980000 0.930000 0.000000 0.060000 0.010000 0.830000 0.010000 0.150000 0.010000 0.150000 0.360000 0.220000 0.270000 0.180000 0.180000 0.470000 0.170000 0.168317 0.366337 0.306931 0.158416 0.128713 0.148515 0.554455 0.168317 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PH0173.1 MOTIF MA0722.1 VAX1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 6156 E= 0 0.072612 0.450780 0.073912 0.402697 0.096614 0.141577 0.014371 0.747439 0.795066 0.130619 0.028606 0.045709 0.940555 0.027395 0.008236 0.023814 0.050778 0.014703 0.036416 0.898102 0.063239 0.039960 0.242873 0.653928 0.742999 0.012306 0.188402 0.056294 0.185954 0.363723 0.177579 0.272745 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0722.1 MOTIF MA0723.1 VAX2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 16603 E= 0 0.055472 0.470758 0.083358 0.390411 0.075196 0.150552 0.011786 0.762466 0.791771 0.154012 0.022927 0.031290 0.964580 0.014371 0.006342 0.014708 0.036928 0.010322 0.036158 0.916592 0.060140 0.044264 0.254417 0.641179 0.758220 0.009493 0.202482 0.029805 0.189620 0.395048 0.200671 0.214660 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0723.1 MOTIF MA0693.2 VDR letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 1000 E= 0 0.222000 0.280000 0.043000 0.455000 0.356000 0.045000 0.567000 0.032000 0.555556 0.024024 0.386386 0.034034 0.024000 0.025000 0.919000 0.032000 0.017000 0.023000 0.070000 0.890000 0.060939 0.030969 0.081918 0.826174 0.055000 0.743000 0.028000 0.174000 0.886000 0.019000 0.076000 0.019000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0693.2