MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF MA0205.1 Trl letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 71 E= 0 0.056338 0.309859 0.126761 0.507042 0.084507 0.323944 0.154930 0.436620 0.169014 0.084507 0.422535 0.323944 0.000000 0.901408 0.042254 0.056338 0.042254 0.000000 0.197183 0.760563 0.014085 0.985915 0.000000 0.000000 0.183099 0.000000 0.028169 0.788732 0.070423 0.760563 0.098592 0.070423 0.098592 0.183099 0.154930 0.563380 0.126761 0.464789 0.140845 0.267606 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0205.1 MOTIF MA0633.1 Twist2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 1000 E= 0 0.302000 0.200000 0.298000 0.200000 0.282000 0.580000 0.069000 0.069000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.217000 0.000000 0.783000 0.789000 0.000000 0.211000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.050000 0.050000 0.155000 0.745000 0.181181 0.181181 0.272272 0.365365 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0633.1 MOTIF MA0410.1 UGA3 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 0 0.100000 0.440000 0.270000 0.190000 0.040404 0.282828 0.636364 0.040404 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.020000 0.270000 0.690000 0.020000 0.858586 0.020202 0.020202 0.101010 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0410.1 MOTIF MA1413.1 UIF1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100000 E= 0 0.423700 0.152800 0.206060 0.217440 0.556050 0.088410 0.195010 0.160530 0.860790 0.010190 0.052630 0.076390 0.003100 0.001880 0.861150 0.133870 0.891611 0.002010 0.105879 0.000500 0.212298 0.000960 0.001720 0.785022 0.112600 0.086100 0.053610 0.747690 0.004600 0.988260 0.000930 0.006210 0.190802 0.314673 0.200872 0.293653 0.306420 0.181650 0.329990 0.181940 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1413.1 MOTIF MA0412.1 UME6 letter-probability matrix: alength= 4 w= 13 nsites= 18 E= 0 0.111111 0.000000 0.000000 0.888889 0.000000 0.555556 0.277778 0.166667 0.111111 0.000000 0.888889 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.944444 0.000000 0.055556 0.055556 0.000000 0.000000 0.944444 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.555556 0.055556 0.000000 0.388889 0.388889 0.111111 0.055556 0.444444 0.111111 0.000000 0.055556 0.833333 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0412.1 MOTIF MA0721.1 UNCX letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 36925 E= 0 0.134868 0.361896 0.154665 0.348571 0.092470 0.390816 0.048526 0.468188 0.791096 0.054417 0.098164 0.056323 0.933937 0.032930 0.010623 0.022510 0.012549 0.021028 0.003052 0.963371 0.067960 0.086463 0.038928 0.806650 0.843965 0.050534 0.016707 0.088794 0.374018 0.211910 0.283811 0.130261 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0721.1 MOTIF MA1074.1 UNE10 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 999 E= 0 0.214214 0.499499 0.072072 0.214214 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.266733 0.532468 0.066933 0.133866 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1074.1 MOTIF MA0411.1 UPC2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 7 nsites= 100 E= 0 0.160000 0.250000 0.190000 0.400000 0.595960 0.030303 0.282828 0.090909 0.380000 0.000000 0.000000 0.620000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.010000 0.000000 0.990000 0.000000 0.821782 0.049505 0.089109 0.039604 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0411.1 MOTIF MA0422.1 URC2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 101 E= 0 0.247525 0.376238 0.108911 0.267327 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.740000 0.090000 0.170000 0.000000 0.230000 0.170000 0.460000 0.140000 0.565657 0.000000 0.000000 0.434343 0.141414 0.000000 0.000000 0.858586 0.940000 0.060000 0.000000 0.000000 0.360000 0.170000 0.150000 0.320000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0422.1 MOTIF MA0093.1 USF1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 7 nsites= 30 E= 0 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.933333 0.000000 0.066667 0.033333 0.000000 0.966667 0.000000 0.000000 0.033333 0.033333 0.933333 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.300000 0.066667 0.466667 0.166667 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0093.1