MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF PF0141.1 TTCNRGNNNNTTC letter-probability matrix: alength= 4 w= 13 nsites= 588 E= 0 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.103741 0.493197 0.011905 0.391156 0.583333 0.000000 0.416667 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.426871 0.263605 0.168367 0.141156 0.474490 0.112245 0.129252 0.284014 0.226190 0.261905 0.267007 0.244898 0.129252 0.367347 0.197279 0.306122 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PF0141.1 MOTIF PF0040.1 TTCYNRGAA letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 1048 E= 0 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.628817 0.000000 0.371183 0.237595 0.234733 0.235687 0.291985 0.458015 0.000000 0.541985 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PF0040.1 MOTIF PF0072.1 TTCYRGAA letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 1044 E= 0 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.438697 0.000000 0.561303 0.518199 0.000000 0.481801 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PF0072.1 MOTIF PF0172.1 TTGCWCAAY letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 148 E= 0 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.533784 0.000000 0.000000 0.466216 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.493243 0.000000 0.506757 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PF0172.1 MOTIF PF0060.1 TTGTTT letter-probability matrix: alength= 4 w= 6 nsites= 7452 E= 0 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PF0060.1 MOTIF PF0169.1 TTTNNANAGCYR letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 456 E= 0 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.089912 0.070175 0.081140 0.758772 0.276316 0.491228 0.111842 0.120614 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.232456 0.122807 0.570175 0.074561 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.719298 0.000000 0.280702 0.706140 0.000000 0.293860 0.000000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PF0169.1 MOTIF MA1123.1 TWIST1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 13 nsites= 18139 E= 0 0.297481 0.214565 0.247919 0.240035 0.284360 0.211864 0.211202 0.292574 0.281824 0.155190 0.203594 0.359391 0.145653 0.730139 0.093886 0.030321 0.011577 0.975963 0.005513 0.006946 0.978499 0.004466 0.007994 0.009041 0.013066 0.050389 0.889906 0.046640 0.904129 0.058052 0.029991 0.007828 0.009758 0.015050 0.009152 0.966040 0.012570 0.013286 0.955510 0.018634 0.056729 0.099123 0.138707 0.705441 0.142731 0.258173 0.285628 0.313468 0.238271 0.260544 0.231215 0.269971 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1123.1 MOTIF MA0409.1 TYE7 letter-probability matrix: alength= 4 w= 7 nsites= 102 E= 0 0.029412 0.911765 0.029412 0.029412 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.100000 0.900000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.764706 0.078431 0.078431 0.078431 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0409.1 MOTIF MA0140.1 Tal1::Gata1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 18 nsites= 2942 E= 0 0.135962 0.451734 0.210061 0.202243 0.088715 0.150918 0.176751 0.583617 0.044497 0.061821 0.652514 0.241168 0.089983 0.253311 0.416978 0.239728 0.227165 0.215620 0.263158 0.294058 0.238031 0.233277 0.306621 0.222071 0.225390 0.252885 0.318398 0.203327 0.241941 0.237190 0.302341 0.218527 0.248898 0.224483 0.292302 0.234317 0.338086 0.138153 0.319077 0.204684 0.178947 0.397963 0.305942 0.117148 0.664744 0.010519 0.012555 0.312182 0.001018 0.002376 0.996606 0.000000 0.993553 0.002375 0.000679 0.003393 0.005433 0.008829 0.010187 0.975552 0.941216 0.002039 0.007815 0.048930 0.809378 0.017329 0.127761 0.045532 0.186054 0.187075 0.544558 0.082313 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0140.1 MOTIF PB0080.1 Tbp_1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 16 nsites= 100 E= 0 0.220000 0.270000 0.220000 0.290000 0.121212 0.404040 0.121212 0.353535 0.292929 0.232323 0.121212 0.353535 0.380000 0.100000 0.110000 0.410000 0.270000 0.040000 0.020000 0.670000 0.643564 0.009901 0.009901 0.336634 0.080000 0.010000 0.000000 0.910000 0.770000 0.000000 0.000000 0.230000 0.230000 0.000000 0.000000 0.770000 0.910000 0.000000 0.010000 0.080000 0.336634 0.009901 0.009901 0.643564 0.670000 0.020000 0.040000 0.270000 0.470000 0.110000 0.100000 0.320000 0.370000 0.290000 0.100000 0.240000 0.200000 0.130000 0.220000 0.450000 0.350000 0.220000 0.230000 0.200000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PB0080.1