MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF PF0092.1 TGCTGAY letter-probability matrix: alength= 4 w= 7 nsites= 1684 E= 0 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.592637 0.000000 0.407363 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PF0092.1 MOTIF PF0055.1 TGGAAA letter-probability matrix: alength= 4 w= 6 nsites= 6612 E= 0 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PF0055.1 MOTIF PF0027.1 TGGNNNNNNKCCAR letter-probability matrix: alength= 4 w= 14 nsites= 1640 E= 0 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.266463 0.414024 0.215244 0.104268 0.214024 0.283537 0.236585 0.265854 0.235976 0.275000 0.277439 0.211585 0.181707 0.320732 0.333537 0.164024 0.232317 0.255488 0.297561 0.214634 0.268902 0.201220 0.303659 0.226220 0.000000 0.000000 0.592073 0.407927 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.285976 0.000000 0.714024 0.000000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PF0027.1 MOTIF MA0796.1 TGIF1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 13280 E= 0 0.002937 0.001431 0.000075 0.995557 0.000666 0.000592 0.998447 0.000296 0.997401 0.000339 0.002260 0.000000 0.000075 0.999024 0.000375 0.000526 0.996514 0.000562 0.002474 0.000450 0.001024 0.001463 0.927067 0.070446 0.033368 0.779714 0.186033 0.000886 0.000078 0.004826 0.000623 0.994473 0.000827 0.000978 0.997518 0.000677 0.003536 0.001886 0.000236 0.994343 0.002657 0.995130 0.000959 0.001255 0.991005 0.001865 0.003510 0.003620 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0796.1 MOTIF MA0797.1 TGIF2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 12852 E= 0 0.037115 0.032758 0.011905 0.918223 0.008085 0.004001 0.983581 0.004334 0.952769 0.002745 0.031972 0.012514 0.010466 0.972476 0.004203 0.012855 0.972316 0.002060 0.022246 0.003378 0.021490 0.017377 0.782715 0.178417 0.112082 0.556974 0.324149 0.006795 0.005754 0.033228 0.004619 0.956398 0.012385 0.006358 0.974403 0.006853 0.045717 0.047239 0.009356 0.897688 0.005776 0.973680 0.011221 0.009323 0.922818 0.013450 0.030888 0.032843 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0797.1 MOTIF PF0083.1 TGTTTGY letter-probability matrix: alength= 4 w= 7 nsites= 2448 E= 0 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.466503 0.000000 0.533497 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PF0083.1 MOTIF PF0117.1 TGTYNNNNNRGCARM letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 256 E= 0 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.390625 0.000000 0.609375 0.214844 0.101562 0.277344 0.406250 0.089844 0.425781 0.136719 0.347656 0.128906 0.468750 0.234375 0.167969 0.457031 0.210938 0.207031 0.125000 0.246094 0.238281 0.132812 0.382812 0.531250 0.000000 0.468750 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.542969 0.000000 0.457031 0.000000 0.312500 0.687500 0.000000 0.000000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PF0117.1 MOTIF MA0597.1 THAP1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 199 E= 0 0.090452 0.467337 0.135678 0.306533 0.075377 0.236181 0.060302 0.628141 0.100503 0.000000 0.688442 0.211055 0.035176 0.914573 0.000000 0.050251 0.015075 0.979899 0.000000 0.005025 0.291457 0.683417 0.005025 0.020101 0.236181 0.085427 0.386935 0.291457 0.150754 0.356784 0.206030 0.286432 0.582915 0.170854 0.085427 0.160804 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0597.1 MOTIF MA0407.1 THI2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 1265 E= 0 0.081423 0.000000 0.918577 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.517504 0.436073 0.000000 0.046423 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.809486 0.000000 0.190514 0.000000 0.402819 0.000000 0.597181 0.053343 0.450038 0.429001 0.067618 0.346519 0.000000 0.000000 0.653481 0.728063 0.000000 0.000000 0.271937 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.643196 0.000000 0.356804 0.000000 0.100311 0.830482 0.069207 0.000000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0407.1 MOTIF MA1220.1 TINY letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 596 E= 0 0.244966 0.379195 0.110738 0.265101 0.248322 0.164430 0.236577 0.350671 0.092282 0.536913 0.088926 0.281879 0.068792 0.724832 0.038591 0.167785 0.684564 0.000000 0.312081 0.003356 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.895973 0.055369 0.000000 0.048658 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.813758 0.003356 0.159396 0.023490 0.355705 0.317114 0.137584 0.189597 0.340604 0.213087 0.107383 0.338926 0.327181 0.110738 0.276846 0.285235 0.258389 0.290268 0.159396 0.291946 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1220.1