MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF PF0136.1 TAAYNRNNTCC letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 532 E= 0 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.328947 0.000000 0.671053 0.281955 0.172932 0.156015 0.389098 0.578947 0.000000 0.421053 0.000000 0.201128 0.359023 0.225564 0.214286 0.231203 0.266917 0.157895 0.343985 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PF0136.1 MOTIF MA0091.1 TAL1::TCF3 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 44 E= 0 0.295455 0.318182 0.181818 0.204545 0.204545 0.227273 0.454545 0.113636 0.886364 0.000000 0.068182 0.045455 0.454545 0.545455 0.000000 0.000000 0.000000 0.977273 0.022727 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.022727 0.250000 0.727273 0.272727 0.727273 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.977273 0.022727 0.000000 0.068182 0.454545 0.477273 0.090909 0.090909 0.045455 0.772727 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0091.1 MOTIF POL012.1 TATA-Box letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 389 E= 0 0.156812 0.372751 0.390746 0.079692 0.041131 0.118252 0.046272 0.794344 0.904884 0.000000 0.005141 0.089974 0.007712 0.025707 0.005141 0.961440 0.910026 0.000000 0.012853 0.077121 0.688946 0.000000 0.000000 0.311054 0.949868 0.007916 0.026385 0.015831 0.570694 0.005141 0.113111 0.311054 0.398458 0.113111 0.403599 0.084833 0.143959 0.347044 0.385604 0.123393 0.213368 0.377892 0.329049 0.079692 0.210797 0.326478 0.329049 0.133676 0.210797 0.303342 0.329049 0.156812 0.174807 0.275064 0.357326 0.192802 0.197943 0.259640 0.359897 0.182519 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/POL012.1 MOTIF PF0051.1 TATAAA letter-probability matrix: alength= 4 w= 6 nsites= 4688 E= 0 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PF0051.1 MOTIF MA0403.1 TBF1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 0 0.610000 0.110000 0.120000 0.160000 0.460000 0.110000 0.350000 0.080000 0.148515 0.831683 0.009901 0.009901 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.010000 0.000000 0.990000 0.757576 0.080808 0.111111 0.050505 0.376238 0.188119 0.267327 0.168317 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0403.1 MOTIF MA0108.1 TBP letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 389 E= 0 0.156812 0.372751 0.390746 0.079692 0.041131 0.118252 0.046272 0.794344 0.904884 0.000000 0.005141 0.089974 0.007712 0.025707 0.005141 0.961440 0.910026 0.000000 0.012853 0.077121 0.688946 0.000000 0.000000 0.311054 0.949868 0.007916 0.026385 0.015831 0.570694 0.005141 0.113111 0.311054 0.398458 0.113111 0.403599 0.084833 0.143959 0.347044 0.385604 0.123393 0.213368 0.377892 0.329049 0.079692 0.210797 0.326478 0.329049 0.133676 0.210797 0.303342 0.329049 0.156812 0.174807 0.275064 0.357326 0.192802 0.197943 0.259640 0.359897 0.182519 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0108.1 MOTIF MA0108.2 TBP letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 389 E= 0 0.156812 0.372751 0.390746 0.079692 0.041131 0.118252 0.046272 0.794344 0.904884 0.000000 0.005141 0.089974 0.007712 0.025707 0.005141 0.961440 0.910026 0.000000 0.012853 0.077121 0.688946 0.000000 0.000000 0.311054 0.925450 0.007712 0.051414 0.015424 0.570694 0.005141 0.113111 0.311054 0.398458 0.113111 0.403599 0.084833 0.143959 0.347044 0.385604 0.123393 0.213368 0.377892 0.329049 0.079692 0.210797 0.326478 0.329049 0.133676 0.210797 0.303342 0.329049 0.156812 0.174807 0.275064 0.357326 0.192802 0.197943 0.259640 0.359897 0.182519 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0108.2 MOTIF MA1355.1 TBP3 letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 598 E= 0 0.459866 0.152174 0.115385 0.272575 0.413043 0.204013 0.083612 0.299331 0.306020 0.244147 0.083612 0.366221 0.200669 0.142140 0.155518 0.501672 0.535117 0.013378 0.150502 0.301003 0.667224 0.005017 0.001672 0.326087 0.590301 0.000000 0.409699 0.000000 0.075251 0.924749 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.844482 0.000000 0.152174 0.003344 0.329431 0.153846 0.018395 0.498328 0.153846 0.202341 0.046823 0.596990 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1355.1 MOTIF MA0802.1 TBR1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 39630 E= 0 0.870780 0.009059 0.084002 0.036159 0.140054 0.066261 0.702488 0.091198 0.001997 0.007248 0.984677 0.006078 0.001072 0.048331 0.002418 0.948180 0.000000 0.000174 0.999710 0.000116 0.057090 0.113461 0.003757 0.825693 0.025975 0.056393 0.762866 0.154766 0.975161 0.002543 0.016503 0.005793 0.749652 0.074620 0.043120 0.132607 0.536295 0.162827 0.131473 0.169405 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0802.1 MOTIF MA0404.1 TBS1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 0 0.120000 0.780000 0.050000 0.050000 0.030303 0.030303 0.909091 0.030303 0.019802 0.019802 0.940594 0.019802 0.757576 0.080808 0.080808 0.080808 0.202020 0.131313 0.131313 0.535354 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.080808 0.080808 0.757576 0.080808 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0404.1