MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF MA0080.3 Spi1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 63715 E= 0 0.391697 0.164326 0.275555 0.168422 0.424876 0.123597 0.345617 0.105909 0.611567 0.051966 0.216370 0.120097 0.663125 0.048701 0.188841 0.099333 0.607110 0.008381 0.180224 0.204285 0.197395 0.127443 0.675163 0.000000 0.711857 0.050365 0.230448 0.007330 0.075351 0.000000 0.924649 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.999215 0.000000 0.000785 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.053928 0.159225 0.786848 0.000000 0.129483 0.050585 0.053127 0.766805 0.061100 0.188935 0.714133 0.035831 0.343891 0.188778 0.329640 0.137691 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0080.3 MOTIF MA0111.1 Spz1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 12 E= 0 0.750000 0.000000 0.250000 0.000000 0.000000 0.166667 0.750000 0.083333 0.166667 0.000000 0.833333 0.000000 0.000000 0.000000 0.916667 0.083333 0.083333 0.000000 0.083333 0.833333 0.666667 0.000000 0.000000 0.333333 0.500000 0.000000 0.166667 0.333333 0.083333 0.750000 0.166667 0.000000 0.833333 0.000000 0.166667 0.000000 0.000000 0.083333 0.750000 0.166667 0.166667 0.666667 0.166667 0.000000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0111.1 MOTIF MA0829.1 Srebf1(var.2) letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 1875 E= 0 0.633600 0.071467 0.286400 0.008533 0.101355 0.026091 0.007025 0.865529 0.003466 0.996534 0.000000 0.000000 0.979001 0.000000 0.015323 0.005675 0.000000 0.959399 0.030033 0.010567 0.005084 0.117946 0.876970 0.000000 0.008767 0.043288 0.002740 0.945205 0.000577 0.004039 0.995384 0.000000 0.939031 0.011976 0.004355 0.044638 0.010532 0.488914 0.033259 0.467295 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0829.1 MOTIF PB0078.1 Srf_1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 14 nsites= 100 E= 0 0.280000 0.170000 0.140000 0.410000 0.310000 0.160000 0.160000 0.370000 0.049505 0.900990 0.019802 0.029703 0.010101 0.818182 0.010101 0.161616 0.584158 0.049505 0.049505 0.316832 0.310000 0.010000 0.010000 0.670000 0.727273 0.010101 0.030303 0.232323 0.232323 0.030303 0.010101 0.727273 0.670000 0.010000 0.010000 0.310000 0.350000 0.030000 0.020000 0.600000 0.161616 0.010101 0.818182 0.010101 0.029703 0.019802 0.900990 0.049505 0.320000 0.190000 0.170000 0.320000 0.633663 0.148515 0.099010 0.118812 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PB0078.1 MOTIF PB0182.1 Srf_2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 17 nsites= 99 E= 0 0.161616 0.282828 0.444444 0.111111 0.150000 0.200000 0.210000 0.440000 0.270000 0.080000 0.190000 0.460000 0.330000 0.180000 0.200000 0.290000 0.510000 0.100000 0.240000 0.150000 0.670000 0.080000 0.150000 0.100000 0.740000 0.110000 0.100000 0.050000 0.660000 0.140000 0.130000 0.070000 0.770000 0.090000 0.070000 0.070000 0.760000 0.090000 0.040000 0.110000 0.742574 0.138614 0.049505 0.069307 0.660000 0.180000 0.030000 0.130000 0.550000 0.280000 0.040000 0.130000 0.393939 0.313131 0.212121 0.080808 0.200000 0.240000 0.240000 0.320000 0.280000 0.210000 0.190000 0.320000 0.290000 0.280000 0.140000 0.290000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PB0182.1 MOTIF PB0079.1 Sry_1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 16 nsites= 99 E= 0 0.171717 0.242424 0.252525 0.333333 0.316832 0.257426 0.118812 0.306931 0.240000 0.180000 0.250000 0.330000 0.430000 0.160000 0.140000 0.270000 0.960000 0.010000 0.010000 0.020000 0.050000 0.010000 0.010000 0.930000 0.070000 0.010000 0.010000 0.910000 0.920000 0.000000 0.070000 0.010000 0.010000 0.070000 0.000000 0.920000 0.910000 0.010000 0.010000 0.070000 0.930000 0.010000 0.010000 0.050000 0.020000 0.010000 0.010000 0.960000 0.415842 0.138614 0.267327 0.178218 0.340000 0.120000 0.180000 0.360000 0.247525 0.099010 0.247525 0.405941 0.250000 0.320000 0.220000 0.210000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PB0079.1 MOTIF PB0183.1 Sry_2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 17 nsites= 100 E= 0 0.220000 0.290000 0.120000 0.370000 0.240000 0.280000 0.210000 0.270000 0.330000 0.130000 0.260000 0.280000 0.262626 0.303030 0.212121 0.222222 0.260000 0.180000 0.290000 0.270000 0.320000 0.180000 0.440000 0.060000 0.570000 0.200000 0.180000 0.050000 0.888889 0.020202 0.030303 0.060606 0.030000 0.860000 0.050000 0.060000 0.920000 0.020000 0.040000 0.020000 0.910000 0.030000 0.030000 0.030000 0.130000 0.040000 0.030000 0.800000 0.410000 0.070000 0.280000 0.240000 0.250000 0.180000 0.390000 0.180000 0.282828 0.232323 0.323232 0.161616 0.178218 0.326733 0.158416 0.336634 0.171717 0.212121 0.454545 0.161616 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PB0183.1 MOTIF MA1410.1 StBRC1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100001 E= 0 0.114979 0.236828 0.365976 0.282217 0.024370 0.020820 0.930150 0.024660 0.004190 0.004470 0.985000 0.006340 0.044020 0.147680 0.750890 0.057410 0.046020 0.597100 0.317420 0.039460 0.009250 0.976600 0.009620 0.004530 0.065709 0.916931 0.010310 0.007050 0.306340 0.528300 0.113780 0.051580 0.165898 0.520865 0.097649 0.215588 0.140720 0.487450 0.179720 0.192110 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1410.1 MOTIF MA0144.1 Stat3 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 613 E= 0 0.032626 0.030995 0.040783 0.895595 0.021207 0.016313 0.210440 0.752039 0.061990 0.900489 0.014682 0.022838 0.009788 0.882545 0.001631 0.106036 0.523654 0.034258 0.241436 0.200653 0.013051 0.000000 0.986949 0.000000 0.009788 0.003263 0.965742 0.021207 0.954323 0.034258 0.011419 0.000000 0.988581 0.001631 0.008157 0.001631 0.311582 0.024470 0.641109 0.022838 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0144.1 MOTIF MA0518.1 Stat4 letter-probability matrix: alength= 4 w= 14 nsites= 2873 E= 0 0.073442 0.354682 0.168465 0.403411 0.004177 0.000696 0.000000 0.995127 0.009050 0.000000 0.184128 0.806822 0.219979 0.775844 0.004177 0.000000 0.106857 0.518970 0.025061 0.349112 0.504699 0.009746 0.425687 0.059868 0.255134 0.000000 0.742778 0.002088 0.015663 0.000000 0.984337 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.547511 0.097111 0.289941 0.065437 0.169161 0.273234 0.238427 0.319179 0.219979 0.250957 0.357814 0.171250 0.309433 0.154194 0.388792 0.147581 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0518.1