MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF PB0173.1 Sox21_2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 17 nsites= 100 E= 0 0.290000 0.290000 0.260000 0.160000 0.310000 0.260000 0.310000 0.120000 0.089109 0.326733 0.158416 0.425743 0.160000 0.420000 0.240000 0.180000 0.460000 0.150000 0.030000 0.360000 0.871287 0.019802 0.039604 0.069307 0.010000 0.050000 0.020000 0.920000 0.030000 0.020000 0.020000 0.930000 0.020202 0.101010 0.858586 0.020202 0.080000 0.020000 0.020000 0.880000 0.039604 0.188119 0.138614 0.633663 0.029703 0.613861 0.198020 0.158416 0.240000 0.350000 0.230000 0.180000 0.220000 0.220000 0.290000 0.270000 0.260000 0.310000 0.160000 0.270000 0.232323 0.202020 0.252525 0.313131 0.350000 0.200000 0.280000 0.170000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PB0173.1 MOTIF MA0514.1 Sox3 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 2067 E= 0 0.000000 0.719400 0.159652 0.120948 0.000000 0.750847 0.000000 0.249153 0.126754 0.000000 0.000000 0.873246 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.069666 0.930334 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.337687 0.122883 0.539429 0.009192 0.412675 0.010643 0.567489 0.020319 0.316401 0.184809 0.478471 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0514.1 MOTIF PB0070.1 Sox30_1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 16 nsites= 99 E= 0 0.373737 0.101010 0.323232 0.202020 0.330000 0.180000 0.160000 0.330000 0.292929 0.080808 0.292929 0.333333 0.160000 0.230000 0.440000 0.170000 0.720000 0.050000 0.200000 0.030000 0.960000 0.000000 0.000000 0.040000 0.000000 0.868687 0.010101 0.121212 0.980000 0.010000 0.000000 0.010000 0.980000 0.000000 0.020000 0.000000 0.070000 0.000000 0.010000 0.920000 0.158416 0.108911 0.465347 0.267327 0.333333 0.090909 0.515152 0.060606 0.460000 0.180000 0.150000 0.210000 0.390000 0.240000 0.150000 0.220000 0.188119 0.267327 0.178218 0.366337 0.180000 0.240000 0.170000 0.410000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PB0070.1 MOTIF PB0174.1 Sox30_2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 16 nsites= 100 E= 0 0.170000 0.210000 0.100000 0.520000 0.455446 0.267327 0.118812 0.158416 0.350000 0.190000 0.200000 0.260000 0.150000 0.220000 0.400000 0.230000 0.770000 0.110000 0.030000 0.090000 0.080000 0.040000 0.040000 0.840000 0.029703 0.059406 0.039604 0.871287 0.840000 0.060000 0.050000 0.050000 0.050000 0.050000 0.060000 0.840000 0.871287 0.039604 0.059406 0.029703 0.840000 0.040000 0.040000 0.080000 0.090000 0.030000 0.110000 0.770000 0.470000 0.290000 0.130000 0.110000 0.200000 0.410000 0.200000 0.190000 0.230000 0.230000 0.460000 0.080000 0.212121 0.252525 0.383838 0.151515 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PB0174.1 MOTIF PB0071.1 Sox4_1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 17 nsites= 100 E= 0 0.430000 0.230000 0.120000 0.220000 0.200000 0.240000 0.300000 0.260000 0.300000 0.160000 0.290000 0.250000 0.430000 0.150000 0.200000 0.220000 0.257426 0.079208 0.475248 0.188119 0.840000 0.050000 0.100000 0.010000 0.989899 0.000000 0.000000 0.010101 0.000000 0.980000 0.010000 0.010000 0.990000 0.000000 0.000000 0.010000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.777778 0.000000 0.000000 0.222222 0.240000 0.000000 0.760000 0.000000 0.370000 0.090000 0.530000 0.010000 0.480000 0.200000 0.240000 0.080000 0.188119 0.356436 0.217822 0.237624 0.250000 0.230000 0.160000 0.360000 0.404040 0.181818 0.161616 0.252525 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PB0071.1 MOTIF PB0175.1 Sox4_2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 17 nsites= 101 E= 0 0.217822 0.247525 0.405941 0.128713 0.267327 0.237624 0.297030 0.198020 0.470000 0.160000 0.120000 0.250000 0.410000 0.110000 0.240000 0.240000 0.430000 0.100000 0.290000 0.180000 0.782178 0.009901 0.168317 0.039604 0.930000 0.010000 0.040000 0.020000 0.010101 0.020202 0.010101 0.959596 0.020000 0.010000 0.010000 0.960000 0.120000 0.030000 0.840000 0.010000 0.100000 0.010000 0.010000 0.880000 0.130000 0.240000 0.090000 0.540000 0.343434 0.202020 0.242424 0.212121 0.230000 0.270000 0.290000 0.210000 0.290000 0.100000 0.420000 0.190000 0.310000 0.180000 0.280000 0.230000 0.445545 0.158416 0.207921 0.188119 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PB0175.1 MOTIF MA0087.1 Sox5 letter-probability matrix: alength= 4 w= 7 nsites= 23 E= 0 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.043478 0.956522 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.043478 0.000000 0.956522 0.000000 0.000000 0.043478 0.000000 0.956522 0.043478 0.043478 0.000000 0.913043 0.347826 0.130435 0.173913 0.347826 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0087.1 MOTIF PB0072.1 Sox5_1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 16 nsites= 100 E= 0 0.310000 0.130000 0.170000 0.390000 0.257426 0.198020 0.148515 0.396040 0.260000 0.120000 0.260000 0.360000 0.450000 0.090000 0.290000 0.170000 0.150000 0.090000 0.630000 0.130000 0.821782 0.029703 0.128713 0.019802 0.980000 0.000000 0.010000 0.010000 0.009901 0.930693 0.009901 0.049505 0.970000 0.000000 0.010000 0.020000 0.979798 0.000000 0.010101 0.010101 0.030303 0.010101 0.000000 0.959596 0.485149 0.019802 0.089109 0.405941 0.454545 0.101010 0.242424 0.202020 0.434343 0.111111 0.222222 0.232323 0.333333 0.252525 0.090909 0.323232 0.333333 0.111111 0.181818 0.373737 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PB0072.1 MOTIF PB0176.1 Sox5_2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 100 E= 0 0.250000 0.230000 0.240000 0.280000 0.350000 0.220000 0.160000 0.270000 0.247525 0.128713 0.217822 0.405941 0.009901 0.732673 0.089109 0.168317 0.570000 0.060000 0.190000 0.180000 0.151515 0.020202 0.161616 0.666667 0.540000 0.280000 0.130000 0.050000 0.752475 0.099010 0.039604 0.108911 0.170000 0.100000 0.090000 0.640000 0.099010 0.227723 0.069307 0.603960 0.350000 0.170000 0.180000 0.300000 0.606061 0.202020 0.111111 0.080808 0.141414 0.303030 0.454545 0.101010 0.250000 0.240000 0.260000 0.250000 0.290000 0.210000 0.250000 0.250000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PB0176.1 MOTIF MA0515.1 Sox6 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 249 E= 0 0.016064 0.558233 0.200803 0.224900 0.000000 0.887550 0.000000 0.112450 0.646586 0.000000 0.000000 0.353414 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.461847 0.020080 0.518072 0.016064 0.449799 0.000000 0.534137 0.056225 0.305221 0.124498 0.514056 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0515.1