MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF PB0066.1 Sox17_1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 99 E= 0 0.383838 0.282828 0.181818 0.151515 0.310000 0.150000 0.180000 0.360000 0.480000 0.060000 0.240000 0.220000 0.762376 0.079208 0.079208 0.079208 0.720000 0.020000 0.020000 0.240000 0.019802 0.851485 0.039604 0.089109 0.950000 0.010000 0.010000 0.030000 0.970000 0.000000 0.010000 0.020000 0.020000 0.010000 0.010000 0.960000 0.180000 0.020000 0.080000 0.720000 0.390000 0.170000 0.350000 0.090000 0.683168 0.089109 0.079208 0.148515 0.420000 0.100000 0.060000 0.420000 0.270000 0.310000 0.120000 0.300000 0.390000 0.120000 0.180000 0.310000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PB0066.1 MOTIF PB0170.1 Sox17_2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 17 nsites= 100 E= 0 0.220000 0.230000 0.400000 0.150000 0.320000 0.230000 0.140000 0.310000 0.170000 0.320000 0.210000 0.300000 0.190000 0.500000 0.150000 0.160000 0.420000 0.220000 0.170000 0.190000 0.070000 0.580000 0.130000 0.220000 0.760000 0.090000 0.030000 0.120000 0.040000 0.110000 0.040000 0.810000 0.150000 0.050000 0.060000 0.740000 0.079208 0.821782 0.059406 0.039604 0.760000 0.060000 0.120000 0.060000 0.130000 0.180000 0.150000 0.540000 0.400000 0.150000 0.360000 0.090000 0.190000 0.350000 0.180000 0.280000 0.475248 0.148515 0.257426 0.118812 0.474747 0.151515 0.171717 0.202020 0.220000 0.190000 0.210000 0.380000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PB0170.1 MOTIF PB0067.1 Sox18_1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 16 nsites= 100 E= 0 0.170000 0.240000 0.190000 0.400000 0.366337 0.128713 0.118812 0.386139 0.151515 0.333333 0.212121 0.303030 0.410000 0.290000 0.020000 0.280000 0.920792 0.009901 0.009901 0.059406 0.020000 0.010000 0.010000 0.960000 0.020000 0.000000 0.010000 0.970000 0.110000 0.030000 0.840000 0.020000 0.050000 0.010000 0.020000 0.920000 0.110000 0.080000 0.050000 0.760000 0.210000 0.280000 0.250000 0.260000 0.230000 0.140000 0.080000 0.550000 0.370000 0.280000 0.170000 0.180000 0.475248 0.099010 0.178218 0.247525 0.376238 0.277228 0.138614 0.207921 0.350000 0.240000 0.150000 0.260000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PB0067.1 MOTIF PB0171.1 Sox18_2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 16 nsites= 100 E= 0 0.230000 0.140000 0.450000 0.180000 0.160000 0.200000 0.360000 0.280000 0.370000 0.170000 0.290000 0.170000 0.110000 0.390000 0.310000 0.190000 0.040000 0.260000 0.150000 0.550000 0.360000 0.040000 0.450000 0.150000 0.646465 0.181818 0.070707 0.101010 0.850000 0.020000 0.070000 0.060000 0.060000 0.070000 0.020000 0.850000 0.101010 0.070707 0.181818 0.646465 0.150000 0.450000 0.040000 0.360000 0.550000 0.150000 0.260000 0.040000 0.257426 0.168317 0.198020 0.376238 0.287129 0.118812 0.336634 0.257426 0.280000 0.340000 0.130000 0.250000 0.290000 0.310000 0.220000 0.180000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PB0171.1 MOTIF PB0068.1 Sox1_1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 16 nsites= 100 E= 0 0.340000 0.230000 0.090000 0.340000 0.376238 0.158416 0.178218 0.287129 0.210000 0.180000 0.230000 0.380000 0.140000 0.460000 0.110000 0.290000 0.670000 0.100000 0.030000 0.200000 0.891089 0.029703 0.019802 0.059406 0.060000 0.030000 0.020000 0.890000 0.130000 0.020000 0.030000 0.820000 0.060000 0.670000 0.240000 0.030000 0.900000 0.030000 0.020000 0.050000 0.590000 0.070000 0.050000 0.290000 0.160000 0.070000 0.050000 0.720000 0.495050 0.118812 0.148515 0.237624 0.356436 0.267327 0.168317 0.207921 0.300000 0.110000 0.280000 0.310000 0.140000 0.160000 0.320000 0.380000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PB0068.1 MOTIF PB0172.1 Sox1_2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 100 E= 0 0.310000 0.320000 0.170000 0.200000 0.170000 0.250000 0.170000 0.410000 0.460000 0.140000 0.240000 0.160000 0.070707 0.141414 0.050505 0.737374 0.564356 0.148515 0.099010 0.188119 0.717172 0.040404 0.151515 0.090909 0.050000 0.060000 0.030000 0.860000 0.050000 0.060000 0.050000 0.840000 0.060000 0.090000 0.830000 0.020000 0.020000 0.030000 0.040000 0.910000 0.030000 0.120000 0.160000 0.690000 0.590000 0.200000 0.160000 0.050000 0.140000 0.140000 0.360000 0.360000 0.100000 0.390000 0.200000 0.310000 0.222222 0.262626 0.363636 0.151515 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PB0172.1 MOTIF MA0143.1 Sox2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 667 E= 0 0.040480 0.665667 0.133433 0.160420 0.029895 0.677130 0.032885 0.260090 0.488789 0.010463 0.005979 0.494768 0.002990 0.014948 0.010463 0.971599 0.020927 0.001495 0.008969 0.968610 0.056801 0.124066 0.790732 0.028401 0.127246 0.005988 0.013473 0.853293 0.095808 0.290419 0.115269 0.498503 0.612613 0.186186 0.057057 0.144144 0.039039 0.058559 0.039039 0.863363 0.040602 0.115789 0.667669 0.175940 0.048120 0.634586 0.126316 0.190977 0.641566 0.061747 0.054217 0.242470 0.551205 0.100904 0.236446 0.111446 0.730422 0.090361 0.091867 0.087349 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0143.1 MOTIF MA0143.2 Sox2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 669 E= 0 0.040359 0.666667 0.133034 0.159940 0.029895 0.678625 0.032885 0.258595 0.491779 0.008969 0.004484 0.494768 0.002990 0.014948 0.008969 0.973094 0.020927 0.000000 0.008969 0.970105 0.053812 0.124066 0.793722 0.028401 0.127246 0.005988 0.011976 0.854790 0.094311 0.291916 0.113772 0.500000 0.611111 0.187688 0.057057 0.144144 0.039039 0.055556 0.039039 0.866366 0.039098 0.115789 0.669173 0.175940 0.046617 0.636090 0.126316 0.190977 0.641566 0.063253 0.055723 0.239458 0.552711 0.100904 0.234940 0.111446 0.732628 0.090634 0.089124 0.087613 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0143.2 MOTIF MA0143.3 Sox2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 1476 E= 0 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.453252 0.000000 0.000000 0.546748 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.283875 0.201220 0.514905 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0143.3 MOTIF PB0069.1 Sox21_1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 16 nsites= 100 E= 0 0.250000 0.250000 0.140000 0.360000 0.340000 0.200000 0.110000 0.350000 0.210000 0.210000 0.180000 0.400000 0.383838 0.181818 0.161616 0.272727 0.858586 0.020202 0.020202 0.101010 0.120000 0.030000 0.030000 0.820000 0.237624 0.019802 0.019802 0.722772 0.820000 0.020000 0.120000 0.040000 0.040000 0.120000 0.020000 0.820000 0.722772 0.019802 0.019802 0.237624 0.820000 0.030000 0.030000 0.120000 0.101010 0.020202 0.020202 0.858586 0.363636 0.080808 0.121212 0.434343 0.400000 0.070000 0.260000 0.270000 0.393939 0.080808 0.212121 0.313131 0.237624 0.148515 0.326733 0.287129 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PB0069.1