MEME version 4

ALPHABET= ACGT

strands: + -

Background letter frequencies
A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25

MOTIF PB0165.1 Sox11_2
letter-probability matrix: alength= 4 w= 14 nsites= 100 E= 0
 0.450000  0.140000  0.200000  0.210000
 0.380000  0.120000  0.260000  0.240000
 0.828283  0.000000  0.141414  0.030303
 0.940000  0.010000  0.040000  0.010000
 0.010000  0.020000  0.020000  0.950000
 0.020000  0.020000  0.010000  0.950000
 0.171717  0.020202  0.797980  0.010101
 0.080808  0.010101  0.010101  0.898990
 0.110000  0.270000  0.100000  0.520000
 0.380000  0.190000  0.140000  0.290000
 0.227723  0.178218  0.267327  0.326733
 0.250000  0.150000  0.460000  0.140000
 0.350000  0.110000  0.300000  0.240000
 0.350000  0.170000  0.200000  0.280000
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PB0165.1

MOTIF PB0062.1 Sox12_1
letter-probability matrix: alength= 4 w= 14 nsites= 99 E= 0
 0.121212  0.232323  0.111111  0.535354
 0.415842  0.237624  0.029703  0.316832
 0.848485  0.000000  0.010101  0.141414
 0.010000  0.010000  0.010000  0.970000
 0.020000  0.000000  0.010000  0.970000
 0.050000  0.010000  0.930000  0.010000
 0.020000  0.000000  0.010000  0.970000
 0.040000  0.060000  0.020000  0.880000
 0.230000  0.420000  0.180000  0.170000
 0.160000  0.110000  0.070000  0.660000
 0.290000  0.260000  0.200000  0.250000
 0.564356  0.108911  0.108911  0.217822
 0.420000  0.150000  0.090000  0.340000
 0.270000  0.280000  0.200000  0.250000
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PB0062.1

MOTIF PB0166.1 Sox12_2
letter-probability matrix: alength= 4 w= 16 nsites= 101 E= 0
 0.376238  0.316832  0.207921  0.099010
 0.353535  0.323232  0.222222  0.101010
 0.323232  0.181818  0.212121  0.282828
 0.138614  0.326733  0.207921  0.326733
 0.660000  0.060000  0.150000  0.130000
 0.050000  0.290000  0.540000  0.120000
 0.881188  0.039604  0.039604  0.039604
 0.040404  0.696970  0.090909  0.171717
 0.880000  0.040000  0.020000  0.060000
 0.860000  0.040000  0.070000  0.030000
 0.790000  0.050000  0.040000  0.120000
 0.090000  0.140000  0.710000  0.060000
 0.297030  0.128713  0.485149  0.089109
 0.656566  0.131313  0.111111  0.101010
 0.350000  0.130000  0.220000  0.300000
 0.200000  0.200000  0.100000  0.500000
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PB0166.1

MOTIF PB0063.1 Sox13_1
letter-probability matrix: alength= 4 w= 16 nsites= 100 E= 0
 0.270000  0.120000  0.170000  0.440000
 0.188119  0.237624  0.178218  0.396040
 0.370000  0.140000  0.160000  0.330000
 0.500000  0.110000  0.280000  0.110000
 0.130000  0.090000  0.620000  0.160000
 0.821782  0.019802  0.128713  0.029703
 0.960000  0.010000  0.010000  0.020000
 0.020000  0.900000  0.010000  0.070000
 0.940000  0.010000  0.010000  0.040000
 0.950000  0.010000  0.030000  0.010000
 0.039604  0.029703  0.009901  0.920792
 0.465347  0.019802  0.079208  0.435644
 0.415842  0.089109  0.118812  0.376238
 0.360000  0.100000  0.180000  0.360000
 0.210000  0.200000  0.120000  0.470000
 0.303030  0.161616  0.070707  0.464646
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PB0063.1

MOTIF PB0167.1 Sox13_2
letter-probability matrix: alength= 4 w= 17 nsites= 101 E= 0
 0.257426  0.118812  0.405941  0.217822
 0.247525  0.138614  0.148515  0.465347
 0.340000  0.150000  0.310000  0.200000
 0.242424  0.262626  0.111111  0.383838
 0.120000  0.240000  0.120000  0.520000
 0.050000  0.040000  0.780000  0.130000
 0.079208  0.049505  0.782178  0.089109
 0.220000  0.040000  0.660000  0.080000
 0.247525  0.158416  0.019802  0.574257
 0.050000  0.080000  0.790000  0.080000
 0.070000  0.040000  0.770000  0.120000
 0.121212  0.030303  0.717172  0.131313
 0.292929  0.181818  0.181818  0.343434
 0.514851  0.128713  0.118812  0.237624
 0.350000  0.190000  0.110000  0.350000
 0.310000  0.200000  0.150000  0.340000
 0.190000  0.130000  0.240000  0.440000
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PB0167.1

MOTIF PB0064.1 Sox14_1
letter-probability matrix: alength= 4 w= 16 nsites= 99 E= 0
 0.191919  0.141414  0.363636  0.303030
 0.270000  0.310000  0.120000  0.300000
 0.217822  0.217822  0.188119  0.376238
 0.580000  0.100000  0.090000  0.230000
 0.909091  0.030303  0.010101  0.050505
 0.090000  0.020000  0.030000  0.860000
 0.190000  0.020000  0.020000  0.770000
 0.790000  0.010000  0.180000  0.020000
 0.020000  0.180000  0.010000  0.790000
 0.770000  0.020000  0.020000  0.190000
 0.860000  0.030000  0.020000  0.090000
 0.050505  0.010101  0.030303  0.909091
 0.370000  0.100000  0.130000  0.400000
 0.444444  0.111111  0.151515  0.292929
 0.260000  0.080000  0.320000  0.340000
 0.270000  0.290000  0.210000  0.230000
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PB0064.1

MOTIF PB0168.1 Sox14_2
letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 100 E= 0
 0.190000  0.350000  0.210000  0.250000
 0.108911  0.128713  0.336634  0.425743
 0.130000  0.330000  0.230000  0.310000
 0.640000  0.110000  0.200000  0.050000
 0.151515  0.535354  0.272727  0.040404
 0.930000  0.010000  0.020000  0.040000
 0.010000  0.930000  0.040000  0.020000
 0.960000  0.020000  0.010000  0.010000
 0.960000  0.020000  0.010000  0.010000
 0.227723  0.019802  0.009901  0.742574
 0.270000  0.030000  0.520000  0.180000
 0.200000  0.110000  0.590000  0.100000
 0.252525  0.262626  0.242424  0.242424
 0.170000  0.200000  0.350000  0.280000
 0.180000  0.340000  0.300000  0.180000
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PB0168.1

MOTIF PB0065.1 Sox15_1
letter-probability matrix: alength= 4 w= 17 nsites= 100 E= 0
 0.290000  0.140000  0.120000  0.450000
 0.280000  0.210000  0.280000  0.230000
 0.200000  0.170000  0.340000  0.290000
 0.340000  0.090000  0.200000  0.370000
 0.217822  0.069307  0.485149  0.227723
 0.792079  0.049505  0.089109  0.069307
 0.930000  0.010000  0.010000  0.050000
 0.020000  0.890000  0.010000  0.080000
 0.960000  0.010000  0.010000  0.020000
 0.960396  0.009901  0.009901  0.019802
 0.089109  0.019802  0.009901  0.881188
 0.480000  0.010000  0.100000  0.410000
 0.303030  0.101010  0.464646  0.131313
 0.455446  0.118812  0.306931  0.118812
 0.210000  0.240000  0.220000  0.330000
 0.326733  0.178218  0.118812  0.376238
 0.190000  0.190000  0.190000  0.430000
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PB0065.1

MOTIF PB0169.1 Sox15_2
letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 100 E= 0
 0.110000  0.250000  0.290000  0.350000
 0.161616  0.181818  0.191919  0.464646
 0.290000  0.200000  0.330000  0.180000
 0.613861  0.089109  0.168317  0.128713
 0.524752  0.257426  0.059406  0.158416
 0.080000  0.100000  0.080000  0.740000
 0.050000  0.100000  0.690000  0.160000
 0.410000  0.120000  0.160000  0.310000
 0.520000  0.310000  0.070000  0.100000
 0.710000  0.050000  0.140000  0.100000
 0.099010  0.059406  0.158416  0.683168
 0.128713  0.148515  0.079208  0.643564
 0.171717  0.424242  0.151515  0.252525
 0.220000  0.320000  0.380000  0.080000
 0.530000  0.170000  0.260000  0.040000
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PB0169.1

MOTIF MA0078.1 Sox17
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 31 E= 0
 0.225806  0.290323  0.193548  0.290323
 0.258065  0.258065  0.129032  0.354839
 0.096774  0.580645  0.032258  0.290323
 0.967742  0.000000  0.000000  0.032258
 0.000000  0.032258  0.000000  0.967742
 0.000000  0.000000  0.000000  1.000000
 0.000000  0.000000  1.000000  0.000000
 0.000000  0.000000  0.064516  0.935484
 0.000000  0.548387  0.322581  0.129032
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0078.1

