MEME version 4

ALPHABET= ACGT

strands: + -

Background letter frequencies
A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25

MOTIF PF0085.1 STTTCRNTTT
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 632 E= 0
 0.000000  0.625000  0.375000  0.000000
 0.000000  0.000000  0.000000  1.000000
 0.000000  0.000000  0.000000  1.000000
 0.000000  0.000000  0.000000  1.000000
 0.000000  1.000000  0.000000  0.000000
 0.632911  0.000000  0.367089  0.000000
 0.099684  0.360759  0.283228  0.256329
 0.000000  0.000000  0.000000  1.000000
 0.000000  0.000000  0.000000  1.000000
 0.000000  0.000000  0.000000  1.000000
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PF0085.1

MOTIF MA1372.1 STZ
letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 600 E= 0
 0.038333  0.670000  0.023333  0.268333
 0.718333  0.000000  0.025000  0.256667
 0.056667  0.541667  0.261667  0.140000
 0.220000  0.170000  0.000000  0.610000
 0.263333  0.258333  0.213333  0.265000
 0.268333  0.255000  0.001667  0.475000
 0.000000  0.810000  0.000000  0.190000
 1.000000  0.000000  0.000000  0.000000
 0.000000  0.740000  0.260000  0.000000
 0.050000  0.021667  0.000000  0.928333
 0.288333  0.263333  0.221667  0.226667
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1372.1

MOTIF MA0398.1 SUM1
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 0
 0.500000  0.140000  0.140000  0.220000
 0.520000  0.080000  0.080000  0.320000
 0.620000  0.020000  0.020000  0.340000
 1.000000  0.000000  0.000000  0.000000
 0.000000  0.000000  0.000000  1.000000
 0.080000  0.000000  0.000000  0.920000
 0.240000  0.000000  0.000000  0.760000
 0.282828  0.050505  0.050505  0.616162
 0.150000  0.150000  0.110000  0.590000
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0398.1

MOTIF MA0399.1 SUT1
letter-probability matrix: alength= 4 w= 7 nsites= 230 E= 0
 0.100000  0.617391  0.156522  0.126087
 0.201681  0.021008  0.777311  0.000000
 0.000000  1.000000  0.000000  0.000000
 0.031008  0.236434  0.728682  0.003876
 0.000000  0.169118  0.830882  0.000000
 0.208511  0.148936  0.642553  0.000000
 0.189655  0.060345  0.732759  0.017241
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0399.1

MOTIF MA0400.1 SUT2
letter-probability matrix: alength= 4 w= 20 nsites= 998 E= 0
 0.333667  0.232465  0.112224  0.321643
 0.225451  0.206413  0.264529  0.303607
 0.269809  0.218656  0.277834  0.233701
 0.354354  0.200200  0.100100  0.345345
 0.248497  0.216433  0.153307  0.381764
 0.523046  0.085170  0.287575  0.104208
 0.941884  0.006012  0.012024  0.040080
 0.972946  0.000000  0.011022  0.016032
 0.000000  0.710421  0.287575  0.002004
 0.001002  0.016032  0.000000  0.982966
 0.002006  0.994985  0.001003  0.002006
 0.001002  0.985972  0.012024  0.001002
 0.002004  0.001002  0.994990  0.002004
 0.791374  0.016048  0.168506  0.024072
 0.524574  0.080241  0.257773  0.137412
 0.375752  0.252505  0.154309  0.217435
 0.338338  0.214214  0.168168  0.279279
 0.279559  0.204409  0.209419  0.306613
 0.163327  0.253507  0.252505  0.330661
 0.281281  0.136136  0.244244  0.338338
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0400.1

MOTIF MA0555.1 SVP
letter-probability matrix: alength= 4 w= 20 nsites= 92 E= 0
 0.304348  0.260870  0.228261  0.206522
 0.304348  0.119565  0.086957  0.489130
 0.304348  0.010870  0.108696  0.576087
 0.358696  0.173913  0.119565  0.347826
 0.076087  0.923913  0.000000  0.000000
 0.032609  0.858696  0.010870  0.097826
 0.630435  0.173913  0.076087  0.119565
 0.728261  0.054348  0.086957  0.130435
 0.934783  0.000000  0.000000  0.065217
 0.836957  0.010870  0.021739  0.130435
 0.847826  0.086957  0.032609  0.032609
 0.369565  0.108696  0.152174  0.369565
 0.173913  0.000000  0.804348  0.021739
 0.000000  0.000000  1.000000  0.000000
 0.771739  0.108696  0.000000  0.119565
 0.913043  0.021739  0.021739  0.043478
 0.836957  0.076087  0.021739  0.065217
 0.369565  0.086957  0.423913  0.119565
 0.543478  0.173913  0.054348  0.228261
 0.413043  0.228261  0.032609  0.326087
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0555.1

MOTIF MA0401.1 SWI4
letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 0
 0.620000  0.080000  0.150000  0.150000
 0.000000  1.000000  0.000000  0.000000
 0.150000  0.000000  0.850000  0.000000
 0.000000  1.000000  0.000000  0.000000
 0.000000  0.000000  1.000000  0.000000
 1.000000  0.000000  0.000000  0.000000
 0.940000  0.020000  0.020000  0.020000
 0.613861  0.079208  0.079208  0.227723
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0401.1

MOTIF MA0402.1 SWI5
letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 101 E= 0
 0.079208  0.079208  0.227723  0.613861
 0.000000  0.000000  1.000000  0.000000
 0.000000  1.000000  0.000000  0.000000
 0.000000  0.000000  0.000000  1.000000
 0.000000  0.000000  1.000000  0.000000
 0.000000  0.000000  1.000000  0.000000
 0.040000  0.040000  0.270000  0.650000
 0.250000  0.250000  0.100000  0.400000
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0402.1

MOTIF PF0071.1 SYATTGTG
letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 1008 E= 0
 0.000000  0.598214  0.401786  0.000000
 0.000000  0.672619  0.000000  0.327381
 1.000000  0.000000  0.000000  0.000000
 0.000000  0.000000  0.000000  1.000000
 0.000000  0.000000  0.000000  1.000000
 0.000000  0.000000  1.000000  0.000000
 0.000000  0.000000  0.000000  1.000000
 0.000000  0.000000  1.000000  0.000000
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PF0071.1

MOTIF MA0203.1 Scr
letter-probability matrix: alength= 4 w= 7 nsites= 25 E= 0
 0.120000  0.280000  0.000000  0.600000
 0.000000  0.000000  0.000000  1.000000
 1.000000  0.000000  0.000000  0.000000
 1.000000  0.000000  0.000000  0.000000
 0.000000  0.000000  0.000000  1.000000
 0.000000  0.000000  0.720000  0.280000
 0.920000  0.000000  0.080000  0.000000
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0203.1

