MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF PH0001.1 Alx3 letter-probability matrix: alength= 4 w= 17 nsites= 100 E= 0 0.300000 0.030000 0.130000 0.540000 0.370000 0.200000 0.240000 0.190000 0.410000 0.180000 0.160000 0.250000 0.535354 0.151515 0.232323 0.080808 0.040000 0.480000 0.010000 0.470000 0.000000 0.080808 0.000000 0.919192 0.990000 0.010000 0.000000 0.000000 0.990000 0.000000 0.010000 0.000000 0.000000 0.010000 0.000000 0.990000 0.000000 0.000000 0.010000 0.990000 0.919192 0.000000 0.080808 0.000000 0.470000 0.010000 0.480000 0.040000 0.080808 0.444444 0.050505 0.424242 0.070000 0.150000 0.100000 0.680000 0.240000 0.270000 0.340000 0.150000 0.430000 0.190000 0.140000 0.240000 0.260000 0.250000 0.290000 0.200000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PH0001.1 MOTIF PH0002.1 Alx4 letter-probability matrix: alength= 4 w= 17 nsites= 101 E= 0 0.158416 0.584158 0.148515 0.108911 0.100000 0.240000 0.560000 0.100000 0.190000 0.440000 0.160000 0.210000 0.400000 0.150000 0.290000 0.160000 0.020202 0.343434 0.010101 0.626263 0.009901 0.079208 0.000000 0.910891 0.980198 0.009901 0.009901 0.000000 0.980000 0.000000 0.010000 0.010000 0.010000 0.010000 0.000000 0.980000 0.000000 0.009901 0.009901 0.980198 0.910891 0.000000 0.079208 0.009901 0.626263 0.010101 0.343434 0.020202 0.170000 0.230000 0.180000 0.420000 0.290000 0.280000 0.130000 0.300000 0.360000 0.230000 0.190000 0.220000 0.230000 0.290000 0.250000 0.230000 0.120000 0.430000 0.210000 0.240000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PH0002.1 MOTIF MA0853.1 Alx4 letter-probability matrix: alength= 4 w= 17 nsites= 101 E= 0 0.158416 0.584158 0.148515 0.108911 0.100000 0.240000 0.560000 0.100000 0.190000 0.440000 0.160000 0.210000 0.400000 0.150000 0.290000 0.160000 0.020202 0.343434 0.010101 0.626263 0.009901 0.079208 0.000000 0.910891 0.980198 0.009901 0.009901 0.000000 0.980000 0.000000 0.010000 0.010000 0.010000 0.010000 0.000000 0.980000 0.000000 0.009901 0.009901 0.980198 0.910891 0.000000 0.079208 0.009901 0.626263 0.010101 0.343434 0.020202 0.170000 0.230000 0.180000 0.420000 0.290000 0.280000 0.130000 0.300000 0.360000 0.230000 0.190000 0.220000 0.230000 0.290000 0.250000 0.230000 0.120000 0.430000 0.210000 0.240000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0853.1 MOTIF MA0166.1 Antp letter-probability matrix: alength= 4 w= 7 nsites= 16 E= 0 0.062500 0.062500 0.000000 0.875000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.562500 0.437500 0.937500 0.000000 0.062500 0.000000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0166.1 MOTIF MA0007.1 Ar letter-probability matrix: alength= 4 w= 22 nsites= 24 E= 0 0.375000 0.291667 0.083333 0.250000 0.375000 0.083333 0.125000 0.416667 0.458333 0.125000 0.125000 0.291667 0.666667 0.041667 0.291667 0.000000 0.000000 0.000000 0.916667 0.083333 0.500000 0.250000 0.041667 0.208333 0.875000 0.083333 0.000000 0.041667 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.625000 0.000000 0.333333 0.041667 0.166667 0.375000 0.083333 0.375000 0.208333 0.458333 0.083333 0.250000 0.250000 0.375000 0.375000 0.000000 0.125000 0.208333 0.041667 0.625000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.166667 0.000000 0.000000 0.833333 0.458333 0.208333 0.041667 0.291667 0.041667 0.916667 0.041667 0.000000 0.125000 0.666667 0.041667 0.166667 0.250000 0.291667 0.208333 0.250000 0.250000 0.208333 0.375000 0.166667 0.416667 0.458333 0.000000 0.125000 0.208333 0.458333 0.250000 0.083333 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0007.1 MOTIF MA0007.3 Ar letter-probability matrix: alength= 4 w= 17 nsites= 3102 E= 0 0.352676 0.053836 0.501289 0.092199 0.293805 0.005319 0.694931 0.005945 0.002077 0.000000 0.996365 0.001558 0.443498 0.107818 0.068173 0.380511 0.994949 0.002296 0.001377 0.001377 0.001818 0.995000 0.002273 0.000909 0.867884 0.008692 0.118644 0.004781 0.080665 0.497771 0.132955 0.288610 0.209955 0.228668 0.370883 0.190494 0.261698 0.086655 0.579896 0.071750 0.011591 0.097295 0.002810 0.888303 0.000000 0.001104 0.998620 0.000276 0.007874 0.001432 0.000000 0.990694 0.454200 0.042569 0.087419 0.415811 0.003210 0.993122 0.000000 0.003668 0.013306 0.641164 0.000832 0.344699 0.154788 0.393089 0.123470 0.328654 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0007.3 MOTIF MA0151.1 Arid3a letter-probability matrix: alength= 4 w= 6 nsites= 27 E= 0 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.037037 0.333333 0.000000 0.629630 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.740741 0.000000 0.037037 0.222222 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0151.1 MOTIF PB0001.1 Arid3a_1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 17 nsites= 100 E= 0 0.180000 0.270000 0.380000 0.170000 0.210000 0.220000 0.350000 0.220000 0.181818 0.212121 0.343434 0.262626 0.220000 0.200000 0.190000 0.390000 0.090000 0.110000 0.080000 0.720000 0.039604 0.099010 0.049505 0.811881 0.700000 0.010000 0.180000 0.110000 0.890000 0.000000 0.000000 0.110000 0.110000 0.000000 0.000000 0.890000 0.110000 0.180000 0.010000 0.700000 0.811881 0.049505 0.099010 0.039604 0.720000 0.080000 0.110000 0.090000 0.594059 0.049505 0.089109 0.267327 0.470000 0.280000 0.060000 0.190000 0.230000 0.230000 0.190000 0.350000 0.270000 0.230000 0.130000 0.370000 0.240000 0.300000 0.200000 0.260000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PB0001.1 MOTIF PB0105.1 Arid3a_2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 100 E= 0 0.310000 0.280000 0.160000 0.250000 0.250000 0.300000 0.220000 0.230000 0.257426 0.336634 0.247525 0.158416 0.270000 0.340000 0.330000 0.060000 0.373737 0.151515 0.393939 0.080808 0.070000 0.190000 0.160000 0.580000 0.810000 0.070000 0.100000 0.020000 0.040000 0.170000 0.100000 0.690000 0.180000 0.580000 0.210000 0.030000 0.505051 0.070707 0.252525 0.171717 0.350000 0.100000 0.270000 0.280000 0.440000 0.210000 0.250000 0.100000 0.247525 0.089109 0.178218 0.485149 0.220000 0.320000 0.120000 0.340000 0.200000 0.100000 0.330000 0.370000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PB0105.1 MOTIF MA0601.1 Arid3b letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 999 E= 0 0.468468 0.177177 0.177177 0.177177 0.273273 0.080080 0.080080 0.566567 0.609000 0.119000 0.034000 0.238000 0.104104 0.000000 0.000000 0.895896 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.911000 0.000000 0.000000 0.089000 0.089000 0.000000 0.000000 0.911000 0.261738 0.167832 0.072927 0.497502 0.490000 0.170000 0.170000 0.170000 0.351351 0.216216 0.216216 0.216216 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0601.1