MEME version 4

ALPHABET= ACGT

strands: + -

Background letter frequencies
A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25

MOTIF MA0383.1 SMP1
letter-probability matrix: alength= 4 w= 21 nsites= 999 E= 0
 0.111111  0.244244  0.235235  0.409409
 0.189379  0.188377  0.265531  0.356713
 0.569570  0.097097  0.137137  0.196196
 0.085170  0.555110  0.158317  0.201403
 0.179359  0.624248  0.047094  0.149299
 0.130130  0.147147  0.085085  0.637638
 0.408818  0.128257  0.112224  0.350701
 0.097194  0.234469  0.033066  0.635271
 0.751503  0.125251  0.046092  0.077154
 0.866733  0.018036  0.018036  0.097194
 0.097194  0.018036  0.018036  0.866733
 0.077154  0.046092  0.125251  0.751503
 0.635271  0.033066  0.234469  0.097194
 0.495992  0.041082  0.060120  0.402806
 0.637638  0.085085  0.147147  0.130130
 0.197395  0.262525  0.146293  0.393788
 0.174174  0.275275  0.271271  0.279279
 0.525526  0.104104  0.101101  0.269269
 0.156313  0.290581  0.455912  0.097194
 0.249249  0.381381  0.201201  0.168168
 0.336673  0.172345  0.229459  0.261523
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0383.1

MOTIF PF0062.1 SMTTTTGT
letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 1460 E= 0
 0.000000  0.606849  0.393151  0.000000
 0.378082  0.621918  0.000000  0.000000
 0.000000  0.000000  0.000000  1.000000
 0.000000  0.000000  0.000000  1.000000
 0.000000  0.000000  0.000000  1.000000
 0.000000  0.000000  0.000000  1.000000
 0.000000  0.000000  1.000000  0.000000
 0.000000  0.000000  0.000000  1.000000
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PF0062.1

MOTIF MA0553.1 SMZ
letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 147 E= 0
 0.000000  0.714286  0.000000  0.285714
 0.000000  0.809524  0.190476  0.000000
 0.000000  0.000000  0.000000  1.000000
 0.000000  1.000000  0.000000  0.000000
 0.000000  0.000000  1.000000  0.000000
 0.000000  0.000000  0.170068  0.829932
 0.918367  0.081633  0.000000  0.000000
 0.000000  1.000000  0.000000  0.000000
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0553.1

MOTIF PF0080.1 SNACANNNYSYAGA
letter-probability matrix: alength= 4 w= 14 nsites= 388 E= 0
 0.000000  0.925258  0.074742  0.000000
 0.002577  0.126289  0.061856  0.809278
 1.000000  0.000000  0.000000  0.000000
 0.000000  1.000000  0.000000  0.000000
 1.000000  0.000000  0.000000  0.000000
 0.515464  0.118557  0.113402  0.252577
 0.128866  0.332474  0.121134  0.417526
 0.067010  0.126289  0.036082  0.770619
 0.000000  0.845361  0.000000  0.154639
 0.000000  0.956186  0.043814  0.000000
 0.000000  0.989691  0.000000  0.010309
 1.000000  0.000000  0.000000  0.000000
 0.000000  0.000000  1.000000  0.000000
 1.000000  0.000000  0.000000  0.000000
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PF0080.1

MOTIF MA0745.1 SNAI2
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 110707 E= 0
 0.343086  0.142231  0.318372  0.196311
 0.431476  0.036015  0.406850  0.125659
 0.042022  0.903310  0.021851  0.032818
 0.947404  0.016328  0.006709  0.029559
 0.122184  0.011031  0.837552  0.029233
 0.003241  0.000000  0.993859  0.002900
 0.000512  0.004717  0.000000  0.994770
 0.104152  0.036544  0.720503  0.138802
 0.089047  0.339313  0.228849  0.342791
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0745.1

MOTIF MA0384.1 SNT2
letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 3219 E= 0
 0.000000  0.027648  0.097235  0.875116
 0.000000  0.000000  1.000000  0.000000
 0.413844  0.079234  0.506922  0.000000
 0.000000  0.000000  0.000000  1.000000
 0.988906  0.000000  0.011094  0.000000
 0.002231  0.000000  0.997769  0.000000
 0.000000  1.000000  0.000000  0.000000
 0.000000  0.000000  1.000000  0.000000
 0.002536  0.973693  0.023772  0.000000
 0.053554  0.946446  0.000000  0.000000
 0.275219  0.067347  0.485714  0.171720
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0384.1

MOTIF MA0554.1 SOC1
letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 888 E= 0
 0.324324  0.138514  0.111486  0.425676
 0.193694  0.297297  0.127252  0.381757
 0.073198  0.030405  0.038288  0.858108
 0.069820  0.000000  0.057432  0.872748
 0.131757  0.052928  0.100225  0.715090
 0.022523  0.962838  0.014640  0.000000
 0.000000  0.694820  0.010135  0.295045
 0.516892  0.041667  0.063063  0.378378
 0.154279  0.087838  0.000000  0.757883
 0.146396  0.006757  0.000000  0.846847
 0.024775  0.009009  0.000000  0.966216
 0.110360  0.027027  0.000000  0.862613
 0.101351  0.079955  0.096847  0.721847
 0.203829  0.011261  0.769144  0.015766
 0.019144  0.025901  0.748874  0.206081
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0554.1

MOTIF MA0385.1 SOK2
letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 101 E= 0
 0.495050  0.188119  0.158416  0.158416
 0.150000  0.490000  0.180000  0.180000
 0.410000  0.470000  0.090000  0.030000
 0.040000  0.010000  0.040000  0.910000
 0.040000  0.010000  0.940000  0.010000
 0.040000  0.910000  0.010000  0.040000
 0.970000  0.010000  0.010000  0.010000
 0.050000  0.050000  0.500000  0.400000
 0.170000  0.210000  0.520000  0.100000
 0.280000  0.320000  0.220000  0.180000
 0.303030  0.232323  0.232323  0.232323
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0385.1

MOTIF MA1379.1 SOL1
letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 600 E= 0
 0.320000  0.028333  0.045000  0.606667
 0.158333  0.026667  0.010000  0.805000
 0.278333  0.061667  0.011667  0.648333
 0.365000  0.115000  0.076667  0.443333
 0.735000  0.090000  0.116667  0.058333
 0.905000  0.000000  0.071667  0.023333
 0.776667  0.005000  0.110000  0.108333
 0.806667  0.000000  0.038333  0.155000
 0.000000  0.000000  0.000000  1.000000
 0.000000  0.000000  0.000000  1.000000
 0.000000  0.281667  0.000000  0.718333
 0.803333  0.000000  0.196667  0.000000
 0.925000  0.075000  0.000000  0.000000
 0.998333  0.000000  0.001667  0.000000
 0.446667  0.026667  0.000000  0.526667
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1379.1

MOTIF MA0442.1 SOX10
letter-probability matrix: alength= 4 w= 6 nsites= 22 E= 0
 0.000000  0.863636  0.000000  0.136364
 0.363636  0.090909  0.090909  0.454545
 0.000000  0.045455  0.181818  0.772727
 0.000000  0.000000  0.000000  1.000000
 0.000000  0.136364  0.863636  0.000000
 0.000000  0.000000  0.045455  0.954545
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0442.1

