MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF MA1159.1 SGR5 letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 600 E= 0 0.488333 0.210000 0.066667 0.235000 0.571667 0.095000 0.266667 0.066667 0.566667 0.080000 0.193333 0.160000 0.721667 0.000000 0.073333 0.205000 0.516667 0.026667 0.045000 0.411667 0.810000 0.036667 0.153333 0.000000 0.886667 0.006667 0.036667 0.070000 0.055000 0.000000 0.943333 0.001667 0.985000 0.010000 0.000000 0.005000 0.000000 0.998333 0.001667 0.000000 0.986667 0.001667 0.011667 0.000000 0.996667 0.001667 0.000000 0.001667 0.933333 0.016667 0.018333 0.031667 0.713333 0.056667 0.035000 0.195000 0.475000 0.138333 0.071667 0.315000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1159.1 MOTIF MA0630.1 SHOX letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 999 E= 0 0.179179 0.301301 0.162162 0.357357 0.074074 0.030030 0.009009 0.886887 0.852000 0.048000 0.055000 0.045000 0.991000 0.002000 0.005000 0.002000 0.015000 0.015000 0.027000 0.943000 0.098000 0.050000 0.084000 0.768000 0.416416 0.048048 0.424424 0.111111 0.301000 0.187000 0.379000 0.133000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0630.1 MOTIF MA0380.1 SIP4 letter-probability matrix: alength= 4 w= 7 nsites= 101 E= 0 0.079208 0.475248 0.128713 0.316832 0.000000 0.270000 0.000000 0.730000 0.000000 0.990000 0.000000 0.010000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.230000 0.000000 0.630000 0.140000 0.581633 0.163265 0.255102 0.000000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0380.1 MOTIF MA1118.1 SIX1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 1108 E= 0 0.086643 0.038809 0.775271 0.099278 0.361011 0.069495 0.081227 0.488267 0.946751 0.016245 0.005415 0.031588 0.971119 0.007220 0.009025 0.012635 0.038809 0.865523 0.010830 0.084838 0.101083 0.786101 0.027978 0.084838 0.046029 0.041516 0.027076 0.885379 0.043321 0.008123 0.925090 0.023466 0.965704 0.006318 0.009928 0.018051 0.131769 0.161552 0.260830 0.445848 0.492780 0.324910 0.065884 0.116426 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1118.1 MOTIF MA1119.1 SIX2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 16 nsites= 5453 E= 0 0.306804 0.226297 0.209976 0.256923 0.294700 0.227765 0.224830 0.252705 0.176600 0.533651 0.151843 0.137906 0.154044 0.039428 0.102879 0.703649 0.030259 0.010270 0.928847 0.030625 0.656153 0.058500 0.050064 0.235283 0.895837 0.048414 0.012103 0.043646 0.967357 0.007152 0.013571 0.011920 0.034843 0.800844 0.031175 0.133138 0.107464 0.764533 0.035944 0.092059 0.059600 0.054099 0.032092 0.854209 0.058867 0.020906 0.885751 0.034476 0.953970 0.013754 0.015588 0.016688 0.101412 0.112782 0.218779 0.567027 0.442875 0.332294 0.103246 0.121584 0.157345 0.462681 0.093710 0.286264 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1119.1 MOTIF MA1405.1 SIZF2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 99999 E= 0 0.161912 0.207032 0.393434 0.237622 0.883800 0.006270 0.083310 0.026620 0.002640 0.787102 0.204958 0.005300 0.033290 0.009180 0.012510 0.945020 0.074401 0.029530 0.887179 0.008890 0.633944 0.040730 0.047200 0.278127 0.008890 0.887179 0.029530 0.074401 0.945020 0.012510 0.009180 0.033290 0.005300 0.204958 0.787102 0.002640 0.026620 0.083310 0.006270 0.883800 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1405.1 MOTIF MA0381.1 SKN7 letter-probability matrix: alength= 4 w= 6 nsites= 100 E= 0 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.840000 0.160000 0.000000 0.485149 0.148515 0.366337 0.000000 0.212121 0.181818 0.282828 0.323232 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0381.1 MOTIF MA0382.1 SKO1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 957 E= 0 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.100301 0.000000 0.899699 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.619247 0.000000 0.000000 0.380753 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0382.1 MOTIF MA0513.1 SMAD2::SMAD3::SMAD4 letter-probability matrix: alength= 4 w= 13 nsites= 899 E= 0 0.184650 0.480534 0.186874 0.147942 0.218020 0.083426 0.037820 0.660734 0.015573 0.008899 0.975528 0.000000 0.036707 0.050056 0.114572 0.798665 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.117909 0.256952 0.599555 0.025584 0.234705 0.139043 0.311457 0.314794 0.000000 0.996663 0.003337 0.000000 0.850945 0.021135 0.020022 0.107898 0.033370 0.818687 0.147942 0.000000 0.130145 0.648498 0.052280 0.169077 0.122358 0.238042 0.038932 0.600667 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0513.1 MOTIF MA0795.1 SMAD3 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 4132 E= 0 0.134076 0.442643 0.021055 0.402227 0.005642 0.004513 0.984767 0.005078 0.027793 0.007825 0.022396 0.941986 0.002559 0.992607 0.003128 0.001706 0.000000 0.012892 0.008688 0.978419 0.985323 0.008467 0.006209 0.000000 0.000000 0.002854 0.996290 0.000856 0.930685 0.053053 0.001333 0.014929 0.005648 0.985880 0.002824 0.005648 0.698340 0.086817 0.063213 0.151630 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0795.1