MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF PB0057.1 Rxra_1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 17 nsites= 101 E= 0 0.237624 0.217822 0.237624 0.306931 0.141414 0.282828 0.343434 0.232323 0.260000 0.260000 0.190000 0.290000 0.120000 0.410000 0.220000 0.250000 0.217822 0.079208 0.366337 0.336634 0.000000 0.050000 0.000000 0.950000 0.030000 0.010000 0.960000 0.000000 0.990000 0.010000 0.000000 0.000000 0.110000 0.890000 0.000000 0.000000 0.010000 0.990000 0.000000 0.000000 0.000000 0.770000 0.000000 0.230000 0.010000 0.850000 0.030000 0.110000 0.326733 0.039604 0.267327 0.366337 0.210000 0.260000 0.150000 0.380000 0.386139 0.178218 0.297030 0.138614 0.400000 0.270000 0.100000 0.230000 0.202020 0.232323 0.212121 0.353535 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PB0057.1 MOTIF PB0161.1 Rxra_2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 16 nsites= 99 E= 0 0.131313 0.101010 0.363636 0.404040 0.217822 0.514851 0.188119 0.079208 0.313131 0.161616 0.383838 0.141414 0.198020 0.504950 0.138614 0.158416 0.400000 0.060000 0.490000 0.050000 0.470000 0.060000 0.010000 0.460000 0.770000 0.060000 0.010000 0.160000 0.148515 0.039604 0.752475 0.059406 0.050000 0.060000 0.530000 0.360000 0.070000 0.100000 0.190000 0.640000 0.100000 0.320000 0.140000 0.440000 0.404040 0.070707 0.474747 0.050505 0.210000 0.240000 0.210000 0.340000 0.346535 0.158416 0.207921 0.287129 0.280000 0.360000 0.160000 0.200000 0.220000 0.180000 0.290000 0.310000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PB0161.1 MOTIF PF0003.1 SCGGAAGY letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 6548 E= 0 0.000000 0.721442 0.278558 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.346518 0.000000 0.653482 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PF0003.1 MOTIF MA0743.1 SCRT1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 1324 E= 0 0.356495 0.126133 0.433535 0.083837 0.391681 0.175910 0.077123 0.355286 0.015083 0.020111 0.703871 0.260935 0.004739 0.979689 0.002031 0.013541 0.946606 0.031674 0.000000 0.021719 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000666 0.999334 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.114527 0.001808 0.880651 0.003014 0.000000 0.000000 0.998774 0.001226 0.000000 0.002629 0.001753 0.995618 0.087849 0.023959 0.742727 0.145465 0.073467 0.114693 0.546512 0.265328 0.149123 0.240829 0.237640 0.372408 0.219055 0.258143 0.096091 0.426710 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0743.1 MOTIF MA0744.1 SCRT2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 13 nsites= 1176 E= 0 0.445578 0.078231 0.398810 0.077381 0.332180 0.186851 0.025952 0.455017 0.004461 0.016571 0.775653 0.203314 0.000703 0.999297 0.000000 0.000000 0.983536 0.012998 0.002600 0.000867 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.009226 0.987225 0.001419 0.002129 0.995697 0.004303 0.000000 0.000000 0.091459 0.003362 0.905178 0.000000 0.000000 0.010020 0.989980 0.000000 0.002521 0.001681 0.000000 0.995798 0.072629 0.040350 0.726967 0.160054 0.114510 0.232941 0.440000 0.212549 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0744.1 MOTIF MA0584.1 SEP1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 18 nsites= 51 E= 0 0.274510 0.294118 0.137255 0.294118 0.274510 0.117647 0.196078 0.411765 0.215686 0.078431 0.117647 0.588235 0.372549 0.137255 0.176471 0.313725 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.901961 0.000000 0.098039 0.764706 0.098039 0.019608 0.117647 0.392157 0.039216 0.078431 0.490196 0.725490 0.000000 0.000000 0.274510 0.490196 0.000000 0.000000 0.509804 0.549020 0.078431 0.078431 0.294118 0.078431 0.117647 0.058824 0.745098 0.509804 0.000000 0.490196 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.450980 0.215686 0.058824 0.274510 0.784314 0.058824 0.000000 0.156863 0.647059 0.098039 0.098039 0.156863 0.117647 0.156863 0.333333 0.392157 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0584.1 MOTIF MA0563.1 SEP3 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 150 E= 0 0.160000 0.246667 0.193333 0.400000 0.126667 0.740000 0.033333 0.100000 0.006667 0.646667 0.006667 0.340000 0.513333 0.000000 0.000000 0.486667 0.080000 0.186667 0.033333 0.700000 0.126667 0.000000 0.033333 0.840000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.060000 0.000000 0.160000 0.780000 0.073333 0.020000 0.146667 0.760000 0.060000 0.000000 0.920000 0.020000 0.000000 0.046667 0.760000 0.193333 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0563.1 MOTIF MA0377.1 SFL1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 21 nsites= 999 E= 0 0.272272 0.183183 0.130130 0.414414 0.368737 0.262525 0.124248 0.244489 0.281563 0.244489 0.332665 0.141283 0.382382 0.256256 0.117117 0.244244 0.314629 0.098196 0.349699 0.237475 0.368368 0.221221 0.198198 0.212212 0.727728 0.030030 0.124124 0.118118 0.127127 0.178178 0.108108 0.586587 0.506507 0.261261 0.226226 0.006006 0.018036 0.010020 0.961924 0.010020 0.957916 0.016032 0.005010 0.021042 0.960922 0.009018 0.021042 0.009018 0.022044 0.047094 0.807615 0.123246 0.616617 0.129129 0.218218 0.036036 0.597194 0.134269 0.036072 0.232465 0.536072 0.221443 0.048096 0.194389 0.256513 0.156313 0.146293 0.440882 0.492986 0.096192 0.217435 0.193387 0.431864 0.067134 0.099198 0.401804 0.369739 0.123246 0.146293 0.360721 0.410231 0.121364 0.072217 0.396189 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0377.1 MOTIF MA0378.1 SFP1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 21 nsites= 997 E= 0 0.428285 0.159478 0.161484 0.250752 0.202405 0.293587 0.194389 0.309619 0.289579 0.174349 0.192385 0.343687 0.250501 0.217435 0.293587 0.238477 0.353707 0.077154 0.297595 0.271543 0.533534 0.042042 0.342342 0.082082 0.782783 0.073073 0.071071 0.073073 0.899800 0.036072 0.046092 0.018036 0.905812 0.009018 0.050100 0.035070 0.857573 0.014042 0.042126 0.086259 0.541542 0.034034 0.016016 0.408408 0.086259 0.042126 0.014042 0.857573 0.035070 0.050100 0.009018 0.905812 0.018036 0.046092 0.036072 0.899800 0.073073 0.071071 0.073073 0.782783 0.126253 0.405812 0.091182 0.376754 0.082164 0.354709 0.103206 0.459920 0.327327 0.201201 0.165165 0.306306 0.115230 0.428858 0.154309 0.301603 0.217435 0.083166 0.374749 0.324649 0.216433 0.169339 0.405812 0.208417 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0378.1 MOTIF PF0069.1 SGCGSSAAA letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 852 E= 0 0.000000 0.257042 0.742958 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.347418 0.652582 0.000000 0.000000 0.268779 0.731221 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PF0069.1