MEME version 4

ALPHABET= ACGT

strands: + -

Background letter frequencies
A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25

MOTIF MA1214.1 ATHB40
letter-probability matrix: alength= 4 w= 21 nsites= 600 E= 0
 0.388333  0.155000  0.196667  0.260000
 0.355000  0.281667  0.158333  0.205000
 0.673333  0.041667  0.113333  0.171667
 0.185000  0.541667  0.113333  0.160000
 0.035000  0.883333  0.000000  0.081667
 1.000000  0.000000  0.000000  0.000000
 1.000000  0.000000  0.000000  0.000000
 0.000000  0.000000  0.000000  1.000000
 0.646667  0.030000  0.041667  0.281667
 1.000000  0.000000  0.000000  0.000000
 0.000000  0.000000  0.000000  1.000000
 0.093333  0.008333  0.068333  0.830000
 0.153333  0.015000  0.661667  0.170000
 0.425000  0.100000  0.235000  0.240000
 0.368333  0.173333  0.210000  0.248333
 0.285000  0.241667  0.221667  0.251667
 0.320000  0.265000  0.131667  0.283333
 0.343333  0.201667  0.093333  0.361667
 0.360000  0.111667  0.116667  0.411667
 0.435000  0.106667  0.090000  0.368333
 0.368333  0.141667  0.085000  0.405000
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1214.1

MOTIF MA1215.1 ATHB53
letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 599 E= 0
 0.272120  0.410684  0.110184  0.207012
 0.180301  0.676127  0.000000  0.143573
 1.000000  0.000000  0.000000  0.000000
 1.000000  0.000000  0.000000  0.000000
 0.000000  0.000000  0.000000  1.000000
 0.939900  0.000000  0.023372  0.036728
 1.000000  0.000000  0.000000  0.000000
 0.000000  0.000000  0.000000  1.000000
 0.056761  0.000000  0.056761  0.886477
 0.217028  0.048414  0.634391  0.100167
 0.402337  0.095159  0.243740  0.258765
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1215.1

MOTIF MA0954.2 ATHB7
letter-probability matrix: alength= 4 w= 13 nsites= 600 E= 0
 0.153333  0.096667  0.113333  0.636667
 0.088333  0.648333  0.153333  0.110000
 0.788333  0.103333  0.018333  0.090000
 0.933333  0.005000  0.000000  0.061667
 0.000000  0.001667  0.001667  0.996667
 0.003333  0.003333  0.773333  0.220000
 1.000000  0.000000  0.000000  0.000000
 0.000000  0.000000  0.000000  1.000000
 0.000000  0.000000  0.003333  0.996667
 0.061667  0.005000  0.918333  0.015000
 0.540000  0.076667  0.301667  0.081667
 0.290000  0.095000  0.163333  0.451667
 0.213333  0.151667  0.155000  0.480000
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0954.2

MOTIF MA0277.1 AZF1
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 102 E= 0
 0.617647  0.127451  0.127451  0.127451
 1.000000  0.000000  0.000000  0.000000
 1.000000  0.000000  0.000000  0.000000
 0.871287  0.128713  0.000000  0.000000
 0.750000  0.000000  0.250000  0.000000
 0.000000  0.000000  1.000000  0.000000
 0.780000  0.160000  0.030000  0.030000
 0.818182  0.060606  0.060606  0.060606
 0.617647  0.127451  0.127451  0.127451
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0277.1

MOTIF MA0165.1 Abd-B
letter-probability matrix: alength= 4 w= 7 nsites= 21 E= 0
 0.047619  0.000000  0.000000  0.952381
 0.000000  0.000000  0.000000  1.000000
 0.238095  0.000000  0.000000  0.761905
 1.000000  0.000000  0.000000  0.000000
 0.000000  0.142857  0.000000  0.857143
 0.142857  0.000000  0.523810  0.333333
 0.619048  0.000000  0.238095  0.142857
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0165.1

MOTIF MA1277.1 Adof1
letter-probability matrix: alength= 4 w= 21 nsites= 595 E= 0
 0.465546  0.157983  0.163025  0.213445
 0.522689  0.119328  0.178151  0.179832
 0.556303  0.084034  0.196639  0.163025
 0.531092  0.127731  0.178151  0.163025
 0.460504  0.114286  0.205042  0.220168
 0.275630  0.233613  0.339496  0.151261
 0.652101  0.080672  0.181513  0.085714
 0.783193  0.000000  0.005042  0.211765
 1.000000  0.000000  0.000000  0.000000
 1.000000  0.000000  0.000000  0.000000
 0.966387  0.000000  0.033613  0.000000
 0.000000  0.000000  1.000000  0.000000
 0.161345  0.189916  0.157983  0.490756
 0.623529  0.030252  0.151261  0.194958
 0.574790  0.043697  0.297479  0.084034
 0.640336  0.087395  0.139496  0.132773
 0.547899  0.115966  0.110924  0.225210
 0.492437  0.085714  0.226891  0.194958
 0.484034  0.146218  0.220168  0.149580
 0.447059  0.131092  0.159664  0.262185
 0.458824  0.104202  0.253782  0.183193
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1277.1

MOTIF MA0006.1 Ahr::Arnt
letter-probability matrix: alength= 4 w= 6 nsites= 24 E= 0
 0.125000  0.333333  0.083333  0.458333
 0.000000  0.000000  0.958333  0.041667
 0.000000  0.958333  0.000000  0.041667
 0.000000  0.000000  0.958333  0.041667
 0.000000  0.000000  0.000000  1.000000
 0.000000  0.000000  1.000000  0.000000
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0006.1

MOTIF MA0854.1 Alx1
letter-probability matrix: alength= 4 w= 17 nsites= 100 E= 0
 0.190000  0.440000  0.170000  0.200000
 0.070000  0.210000  0.650000  0.070000
 0.380000  0.330000  0.140000  0.150000
 0.430000  0.090000  0.310000  0.170000
 0.050000  0.400000  0.020000  0.530000
 0.010000  0.070000  0.000000  0.920000
 0.989899  0.000000  0.010101  0.000000
 0.980000  0.000000  0.010000  0.010000
 0.010000  0.010000  0.000000  0.980000
 0.000000  0.010101  0.000000  0.989899
 0.920000  0.000000  0.070000  0.010000
 0.530000  0.020000  0.400000  0.050000
 0.150000  0.210000  0.110000  0.530000
 0.230000  0.320000  0.160000  0.290000
 0.393939  0.313131  0.121212  0.171717
 0.240000  0.290000  0.230000  0.240000
 0.150000  0.400000  0.140000  0.310000
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0854.1

MOTIF PH0010.1 Alx1_1
letter-probability matrix: alength= 4 w= 17 nsites= 100 E= 0
 0.190000  0.440000  0.170000  0.200000
 0.070000  0.210000  0.650000  0.070000
 0.380000  0.330000  0.140000  0.150000
 0.430000  0.090000  0.310000  0.170000
 0.050000  0.400000  0.020000  0.530000
 0.010000  0.070000  0.000000  0.920000
 0.989899  0.000000  0.010101  0.000000
 0.980000  0.000000  0.010000  0.010000
 0.010000  0.010000  0.000000  0.980000
 0.000000  0.010101  0.000000  0.989899
 0.920000  0.000000  0.070000  0.010000
 0.530000  0.020000  0.400000  0.050000
 0.150000  0.210000  0.110000  0.530000
 0.230000  0.320000  0.160000  0.290000
 0.393939  0.313131  0.121212  0.171717
 0.240000  0.290000  0.230000  0.240000
 0.150000  0.400000  0.140000  0.310000
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PH0010.1

MOTIF PH0011.1 Alx1_2
letter-probability matrix: alength= 4 w= 17 nsites= 100 E= 0
 0.170000  0.410000  0.200000  0.220000
 0.333333  0.212121  0.353535  0.101010
 0.292929  0.464646  0.101010  0.141414
 0.323232  0.202020  0.262626  0.212121
 0.019802  0.237624  0.009901  0.732673
 0.010000  0.040000  0.000000  0.950000
 0.989899  0.000000  0.010101  0.000000
 0.980000  0.000000  0.010000  0.010000
 0.010000  0.010000  0.000000  0.980000
 0.000000  0.010101  0.000000  0.989899
 0.950000  0.000000  0.040000  0.010000
 0.732673  0.009901  0.237624  0.019802
 0.158416  0.217822  0.198020  0.425743
 0.171717  0.232323  0.191919  0.404040
 0.242424  0.202020  0.323232  0.232323
 0.257426  0.207921  0.287129  0.247525
 0.270000  0.340000  0.210000  0.180000
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PH0011.1

