MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF MA0074.1 RXRA::VDR letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 10 E= 0 0.300000 0.000000 0.700000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.900000 0.100000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.900000 0.000000 0.100000 0.900000 0.000000 0.100000 0.000000 0.400000 0.200000 0.000000 0.400000 0.200000 0.400000 0.200000 0.200000 0.200000 0.000000 0.800000 0.000000 0.500000 0.000000 0.500000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.100000 0.000000 0.000000 0.900000 0.000000 0.900000 0.000000 0.100000 0.700000 0.100000 0.200000 0.000000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0074.1 MOTIF MA0855.1 RXRB letter-probability matrix: alength= 4 w= 14 nsites= 5152 E= 0 0.277562 0.066382 0.612578 0.043478 0.306824 0.001480 0.691141 0.000555 0.003518 0.000251 0.993719 0.002513 0.000242 0.000000 0.880774 0.118984 0.000000 0.000445 0.002448 0.997107 0.004899 0.933925 0.014831 0.046345 0.997772 0.000000 0.002056 0.000171 0.974059 0.000837 0.019916 0.005188 0.962695 0.000168 0.037137 0.000000 0.000258 0.000000 0.997935 0.001806 0.000493 0.000000 0.922641 0.076866 0.000225 0.000449 0.004267 0.995060 0.002175 0.958939 0.013868 0.025017 0.947960 0.002148 0.049397 0.000496 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0855.1 MOTIF MA0856.1 RXRG letter-probability matrix: alength= 4 w= 14 nsites= 34936 E= 0 0.223952 0.108770 0.613293 0.053984 0.404125 0.001792 0.593514 0.000569 0.002069 0.000169 0.994511 0.003251 0.003868 0.000341 0.846145 0.149645 0.000127 0.000891 0.003207 0.995775 0.000454 0.923740 0.011899 0.063906 0.997895 0.000000 0.002000 0.000105 0.956753 0.000389 0.026925 0.015933 0.952687 0.000000 0.047168 0.000144 0.000304 0.000034 0.998985 0.000677 0.000377 0.000031 0.876653 0.122938 0.000053 0.000451 0.003553 0.995943 0.001445 0.925669 0.017323 0.055563 0.938751 0.001101 0.059457 0.000691 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0856.1 MOTIF PF0151.1 RYAAAKNNNNNNTTGW letter-probability matrix: alength= 4 w= 16 nsites= 240 E= 0 0.712500 0.000000 0.287500 0.000000 0.000000 0.637500 0.000000 0.362500 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.591667 0.408333 0.370833 0.158333 0.279167 0.191667 0.166667 0.208333 0.275000 0.350000 0.133333 0.308333 0.262500 0.295833 0.120833 0.320833 0.158333 0.400000 0.200000 0.479167 0.116667 0.204167 0.341667 0.220833 0.141667 0.295833 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.416667 0.000000 0.000000 0.583333 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PF0151.1 MOTIF PF0128.1 RYCACNNRNNRNCAG letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 236 E= 0 0.322034 0.000000 0.677966 0.000000 0.000000 0.572034 0.000000 0.427966 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.330508 0.262712 0.245763 0.161017 0.330508 0.161017 0.355932 0.152542 0.330508 0.000000 0.669492 0.000000 0.389831 0.165254 0.381356 0.063559 0.194915 0.228814 0.317797 0.258475 0.444915 0.000000 0.555085 0.000000 0.203390 0.216102 0.453390 0.127119 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PF0128.1 MOTIF PF0133.1 RYTAAWNNNTGAY letter-probability matrix: alength= 4 w= 13 nsites= 168 E= 0 0.392857 0.000000 0.607143 0.000000 0.000000 0.250000 0.000000 0.750000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.494048 0.000000 0.000000 0.505952 0.220238 0.208333 0.315476 0.255952 0.255952 0.113095 0.285714 0.345238 0.029762 0.315476 0.232143 0.422619 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.553571 0.000000 0.446429 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PF0133.1 MOTIF PF0053.1 RYTGCNNRGNAAC letter-probability matrix: alength= 4 w= 13 nsites= 464 E= 0 0.114224 0.000000 0.885776 0.000000 0.000000 0.157328 0.000000 0.842672 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.088362 0.443966 0.019397 0.448276 0.368534 0.116379 0.211207 0.303879 0.426724 0.000000 0.573276 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.185345 0.573276 0.086207 0.155172 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PF0053.1 MOTIF PF0087.1 RYTGCNWTGGNR letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 460 E= 0 0.165217 0.000000 0.834783 0.000000 0.000000 0.323913 0.000000 0.676087 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.095652 0.652174 0.036957 0.215217 0.873913 0.000000 0.000000 0.126087 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.215217 0.508696 0.132609 0.143478 0.506522 0.000000 0.493478 0.000000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PF0087.1 MOTIF PF0016.1 RYTTCCTG letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 4512 E= 0 0.552527 0.000000 0.447473 0.000000 0.000000 0.599291 0.000000 0.400709 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PF0016.1 MOTIF PB0053.1 Rara_1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 16 nsites= 100 E= 0 0.220000 0.180000 0.270000 0.330000 0.277228 0.356436 0.118812 0.247525 0.110000 0.270000 0.230000 0.390000 0.240000 0.410000 0.150000 0.200000 0.850000 0.050000 0.040000 0.060000 0.810000 0.010000 0.170000 0.010000 0.900990 0.009901 0.089109 0.000000 0.000000 0.000000 0.990000 0.010000 0.000000 0.000000 0.900000 0.100000 0.000000 0.000000 0.010000 0.990000 0.000000 0.970297 0.009901 0.019802 0.969697 0.000000 0.030303 0.000000 0.180000 0.520000 0.080000 0.220000 0.181818 0.383838 0.313131 0.121212 0.230000 0.230000 0.220000 0.320000 0.220000 0.170000 0.370000 0.240000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PB0053.1