MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF MA0367.1 RGT1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 0 0.420000 0.130000 0.230000 0.220000 0.340000 0.100000 0.340000 0.220000 0.370000 0.000000 0.000000 0.630000 0.217822 0.019802 0.000000 0.762376 0.270000 0.150000 0.170000 0.410000 0.300000 0.180000 0.040000 0.480000 0.000000 0.120000 0.000000 0.880000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.039604 0.000000 0.881188 0.079208 0.320000 0.130000 0.330000 0.220000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0367.1 MOTIF PF0084.1 RGTTAMWNATT letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 212 E= 0 0.551887 0.000000 0.448113 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.570755 0.429245 0.000000 0.000000 0.415094 0.000000 0.000000 0.584906 0.169811 0.278302 0.292453 0.259434 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PF0084.1 MOTIF MA0719.1 RHOXF1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 10916 E= 0 0.295346 0.242213 0.169934 0.292506 0.199354 0.000000 0.033589 0.767058 0.451274 0.000000 0.437434 0.111292 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.324295 0.675705 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.827534 0.000000 0.172466 0.295255 0.316325 0.193936 0.194485 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0719.1 MOTIF MA0368.1 RIM101 letter-probability matrix: alength= 4 w= 7 nsites= 100 E= 0 0.090000 0.430000 0.090000 0.390000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0368.1 MOTIF MA0369.1 RLM1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 18 nsites= 38 E= 0 0.263158 0.263158 0.263158 0.210526 0.333333 0.047619 0.380952 0.238095 0.261905 0.000000 0.023810 0.714286 0.000000 0.000000 0.119048 0.880952 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.380952 0.000000 0.000000 0.619048 0.523810 0.000000 0.000000 0.476190 0.547619 0.000000 0.000000 0.452381 0.761905 0.000000 0.000000 0.238095 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.642857 0.333333 0.000000 0.023810 0.097561 0.365854 0.048780 0.487805 0.166667 0.380952 0.071429 0.380952 0.250000 0.325000 0.250000 0.175000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0369.1 MOTIF MA0370.1 RME1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 183 E= 0 0.000000 0.284153 0.000000 0.715847 0.074766 0.448598 0.154206 0.322430 0.071749 0.448430 0.219731 0.260090 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.708333 0.000000 0.160714 0.130952 0.817647 0.170588 0.000000 0.011765 0.099631 0.000000 0.900369 0.000000 0.129278 0.000000 0.870722 0.000000 0.489362 0.207447 0.186170 0.117021 0.773006 0.000000 0.116564 0.110429 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0370.1 MOTIF PF0154.1 RNCTGNYNRNCTGNY letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 236 E= 0 0.419492 0.000000 0.580508 0.000000 0.097458 0.296610 0.398305 0.207627 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.169492 0.338983 0.110169 0.381356 0.000000 0.631356 0.000000 0.368644 0.233051 0.156780 0.220339 0.389831 0.300847 0.000000 0.699153 0.000000 0.156780 0.326271 0.283898 0.233051 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.118644 0.305085 0.347458 0.228814 0.000000 0.677966 0.000000 0.322034 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PF0154.1 MOTIF PF0140.1 RNGTGGGC letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 3008 E= 0 0.477394 0.000000 0.522606 0.000000 0.250000 0.231715 0.371343 0.146941 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PF0140.1 MOTIF PF0122.1 RNTCANNRNNYNATTW letter-probability matrix: alength= 4 w= 16 nsites= 152 E= 0 0.467105 0.000000 0.532895 0.000000 0.256579 0.322368 0.184211 0.236842 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.177632 0.289474 0.144737 0.388158 0.190789 0.184211 0.144737 0.480263 0.519737 0.000000 0.480263 0.000000 0.296053 0.190789 0.230263 0.282895 0.289474 0.289474 0.065789 0.355263 0.000000 0.348684 0.000000 0.651316 0.335526 0.296053 0.052632 0.315789 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.605263 0.000000 0.000000 0.394737 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PF0122.1 MOTIF MA0071.1 RORA letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 25 E= 0 0.600000 0.040000 0.080000 0.280000 0.360000 0.040000 0.000000 0.600000 0.240000 0.480000 0.160000 0.120000 0.440000 0.080000 0.200000 0.280000 0.840000 0.000000 0.160000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0071.1