MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF MA0365.1 RFX1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 0 0.120000 0.270000 0.420000 0.190000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.310000 0.000000 0.690000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.020000 0.480000 0.020000 0.480000 0.880000 0.040000 0.040000 0.040000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0365.1 MOTIF MA0600.1 RFX2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 19 nsites= 2346 E= 0 0.158994 0.060102 0.731458 0.049446 0.026428 0.078431 0.135124 0.760017 0.081841 0.313725 0.027280 0.577153 0.183717 0.135124 0.387894 0.293265 0.014493 0.825234 0.051577 0.108696 0.000426 0.921569 0.002984 0.075021 0.667945 0.184143 0.017477 0.130435 0.069906 0.094629 0.040068 0.795396 0.247656 0.000000 0.752344 0.000000 0.082268 0.002131 0.914749 0.000853 0.091219 0.823529 0.000000 0.085251 0.893009 0.003410 0.072464 0.031117 0.985507 0.000000 0.011935 0.002558 0.000000 0.977835 0.000000 0.022165 0.323956 0.334186 0.229753 0.112106 0.250639 0.171782 0.502131 0.075448 0.173061 0.354220 0.312447 0.160273 0.249361 0.268542 0.324382 0.157715 0.264280 0.284740 0.289003 0.161978 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0600.1 MOTIF MA0600.2 RFX2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 16 nsites= 13412 E= 0 0.102967 0.421488 0.301372 0.174172 0.018971 0.000843 0.979623 0.000562 0.002012 0.002731 0.001006 0.994251 0.129263 0.057681 0.000909 0.812147 0.294935 0.017705 0.599582 0.087778 0.000813 0.894045 0.006300 0.098842 0.000127 0.784147 0.000318 0.215408 0.971471 0.003777 0.006461 0.018290 0.015567 0.006372 0.002100 0.975961 0.205323 0.000459 0.794087 0.000131 0.131927 0.008414 0.859462 0.000197 0.094982 0.579955 0.024741 0.300321 0.809682 0.002272 0.083712 0.104334 0.994462 0.001410 0.002517 0.001611 0.000487 0.977962 0.000070 0.021482 0.186328 0.281923 0.420569 0.111180 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0600.2 MOTIF MA0798.1 RFX3 letter-probability matrix: alength= 4 w= 16 nsites= 21645 E= 0 0.133102 0.351952 0.300809 0.214137 0.088406 0.001284 0.905285 0.005025 0.013843 0.026295 0.012715 0.947147 0.186227 0.120487 0.004111 0.689175 0.295696 0.042193 0.533951 0.128161 0.002707 0.882789 0.028479 0.086025 0.000053 0.778248 0.002486 0.219213 0.885533 0.018346 0.026563 0.069558 0.066320 0.014080 0.012208 0.907392 0.233469 0.002221 0.764256 0.000055 0.172475 0.021054 0.805536 0.000935 0.155848 0.497450 0.051471 0.295230 0.714217 0.004397 0.137056 0.144330 0.961031 0.008424 0.025717 0.004828 0.005675 0.942477 0.001553 0.050296 0.197589 0.319614 0.409773 0.073025 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0798.1 MOTIF MA0799.1 RFX4 letter-probability matrix: alength= 4 w= 16 nsites= 11648 E= 0 0.188530 0.356885 0.247854 0.206731 0.122698 0.000923 0.863017 0.013362 0.028489 0.025962 0.013869 0.931680 0.329752 0.136430 0.006103 0.527715 0.308716 0.033928 0.488081 0.169275 0.000273 0.849863 0.001641 0.148222 0.000081 0.715234 0.003643 0.281043 0.789132 0.065423 0.071538 0.073907 0.054798 0.037706 0.029699 0.877797 0.163528 0.003777 0.832639 0.000056 0.236091 0.029564 0.728686 0.005659 0.120666 0.518415 0.008825 0.352094 0.563666 0.008033 0.112910 0.315390 0.965237 0.014041 0.018302 0.002421 0.003614 0.961892 0.001205 0.033290 0.161005 0.278538 0.411286 0.149171 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0799.1 MOTIF MA0510.1 RFX5 letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 3868 E= 0 0.088676 0.406412 0.145036 0.359876 0.153826 0.205791 0.222854 0.417528 0.001551 0.483454 0.331696 0.183299 0.046794 0.953206 0.000000 0.000000 0.307394 0.561272 0.015770 0.115564 0.000000 0.215098 0.000000 0.784902 0.476732 0.000259 0.523009 0.000000 0.063340 0.000000 0.908480 0.028180 0.000000 0.727766 0.105481 0.166753 0.790331 0.128490 0.081179 0.000000 0.954498 0.045502 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.538780 0.202172 0.000000 0.259049 0.247156 0.093330 0.564633 0.094881 0.225181 0.358842 0.320321 0.095657 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0510.1 MOTIF MA0510.2 RFX5 letter-probability matrix: alength= 4 w= 16 nsites= 2632 E= 0 0.105243 0.408435 0.300152 0.186170 0.030843 0.000000 0.966073 0.003084 0.001354 0.011171 0.005078 0.982397 0.015682 0.032699 0.003337 0.948282 0.301949 0.029790 0.616035 0.052225 0.001206 0.955788 0.015273 0.027733 0.000351 0.742897 0.002455 0.254297 0.885679 0.017334 0.019397 0.077590 0.046542 0.018100 0.007111 0.928248 0.249589 0.003612 0.744171 0.002627 0.050088 0.016813 0.933100 0.000000 0.051577 0.598516 0.022635 0.327273 0.933218 0.004308 0.042654 0.019819 0.979574 0.009325 0.007105 0.003996 0.010467 0.957729 0.004831 0.026973 0.181675 0.349980 0.355879 0.112466 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0510.2 MOTIF PF0068.1 RGAANNTTC letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 2472 E= 0 0.463188 0.000000 0.536812 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.328074 0.230583 0.259709 0.181634 0.193770 0.271845 0.260922 0.273463 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PF0068.1 MOTIF PF0050.1 RGAGGAARY letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 1888 E= 0 0.520657 0.000000 0.479343 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.288136 0.000000 0.711864 0.000000 0.000000 0.444386 0.000000 0.555614 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PF0050.1 MOTIF MA0366.1 RGM1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 5 nsites= 100 E= 0 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.110000 0.120000 0.770000 0.000000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0366.1