MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF MA0362.1 RDS2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 7 nsites= 99 E= 0 0.343434 0.393939 0.181818 0.080808 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.120000 0.010000 0.860000 0.010000 0.168317 0.069307 0.693069 0.069307 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0362.1 MOTIF MA0363.1 REB1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 0 0.300000 0.100000 0.500000 0.100000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.600000 0.400000 0.150000 0.150000 0.550000 0.150000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0363.1 MOTIF MA1415.1 REF6 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 3687 E= 0 0.537836 0.056686 0.310279 0.095199 0.714402 0.037158 0.156496 0.091945 0.937890 0.007323 0.006509 0.048278 0.952265 0.009222 0.032004 0.006509 0.000271 0.992948 0.000271 0.006509 0.982370 0.006781 0.008137 0.002712 0.001627 0.005696 0.983184 0.009493 0.958232 0.005696 0.028478 0.007594 0.012205 0.002712 0.971250 0.013832 0.203960 0.288310 0.239761 0.267969 0.609981 0.128289 0.119609 0.142121 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1415.1 MOTIF MA0364.1 REI1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 7 nsites= 100 E= 0 0.000000 0.950000 0.000000 0.050000 0.050000 0.950000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.950000 0.050000 0.560000 0.080000 0.230000 0.130000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0364.1 MOTIF MA0101.1 REL letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 17 E= 0 0.000000 0.294118 0.470588 0.235294 0.000000 0.058824 0.882353 0.058824 0.058824 0.000000 0.882353 0.058824 0.294118 0.058824 0.529412 0.117647 0.352941 0.294118 0.176471 0.176471 0.294118 0.058824 0.058824 0.588235 0.058824 0.000000 0.000000 0.941176 0.117647 0.000000 0.000000 0.882353 0.000000 0.882353 0.000000 0.117647 0.058824 0.941176 0.000000 0.000000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0101.1 MOTIF MF0003.1 REL class letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 99 E= 0 0.000000 0.104600 0.797100 0.098300 0.000000 0.022600 0.908500 0.068900 0.014200 0.000000 0.937600 0.048200 0.291900 0.022600 0.544900 0.140600 0.423500 0.161600 0.152000 0.262900 0.194400 0.032700 0.041500 0.731400 0.014200 0.055000 0.027300 0.903500 0.028400 0.270400 0.000000 0.701200 0.021600 0.906700 0.000000 0.071700 0.041100 0.911700 0.012800 0.034400 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MF0003.1 MOTIF MA0107.1 RELA letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 18 E= 0 0.000000 0.222222 0.611111 0.166667 0.000000 0.000000 0.944444 0.055556 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.611111 0.000000 0.388889 0.000000 0.555556 0.166667 0.222222 0.055556 0.111111 0.000000 0.000000 0.888889 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.111111 0.000000 0.888889 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0107.1 MOTIF MA1117.1 RELB letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 3290 E= 0 0.241945 0.125836 0.478723 0.153495 0.374164 0.170517 0.241337 0.213982 0.861094 0.038602 0.047720 0.052584 0.063830 0.032523 0.048328 0.855319 0.027356 0.031307 0.016109 0.925228 0.043769 0.889970 0.012158 0.054103 0.027964 0.941641 0.008511 0.021884 0.044377 0.915805 0.017629 0.022188 0.024012 0.922492 0.032523 0.020973 0.241945 0.190881 0.299088 0.268085 0.216109 0.279939 0.302736 0.201216 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1117.1 MOTIF MA0138.1 REST letter-probability matrix: alength= 4 w= 19 nsites= 22 E= 0 0.045455 0.090909 0.681818 0.181818 0.318182 0.409091 0.045455 0.227273 0.045455 0.136364 0.681818 0.136364 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.045455 0.000000 0.954545 0.045455 0.181818 0.772727 0.000000 0.000000 0.000000 0.090909 0.909091 0.000000 0.863636 0.045455 0.090909 0.000000 0.954545 0.000000 0.045455 0.500000 0.136364 0.227273 0.136364 0.227273 0.045455 0.136364 0.590909 0.090909 0.000000 0.909091 0.000000 0.000000 0.045455 0.954545 0.000000 0.045455 0.000000 0.045455 0.909091 0.000000 0.136364 0.727273 0.136364 0.000000 0.954545 0.000000 0.045455 0.000000 0.045455 0.000000 0.954545 0.045455 0.045455 0.909091 0.000000 0.681818 0.045455 0.227273 0.045455 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0138.1 MOTIF MA0138.2 REST letter-probability matrix: alength= 4 w= 21 nsites= 1591 E= 0 0.132621 0.109365 0.230044 0.527970 0.036318 0.168441 0.091421 0.703820 0.047589 0.855354 0.031309 0.065748 0.906367 0.018727 0.058677 0.016230 0.021197 0.027431 0.945137 0.006234 0.076012 0.609346 0.201246 0.113396 0.980697 0.004359 0.007472 0.007472 0.001868 0.987547 0.007472 0.003113 0.021793 0.922167 0.012453 0.043587 0.568847 0.125234 0.100935 0.204984 0.136534 0.233791 0.077307 0.552369 0.024314 0.004364 0.966958 0.004364 0.012469 0.003117 0.983167 0.001247 0.877105 0.069869 0.021210 0.031815 0.008125 0.800000 0.145625 0.046250 0.983750 0.005625 0.004375 0.006250 0.026349 0.008156 0.959849 0.005646 0.128688 0.632141 0.114878 0.124294 0.229899 0.019472 0.432161 0.318467 0.133962 0.586792 0.200629 0.078616 0.112579 0.700629 0.023270 0.163522 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0138.2