MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF MA1051.1 RAP2-3 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 1001 E= 0 0.118881 0.231768 0.542458 0.106893 0.147147 0.761762 0.033033 0.058058 0.007000 0.006000 0.982000 0.005000 0.006000 0.746000 0.244000 0.004000 0.016000 0.977000 0.004000 0.003000 0.006000 0.003000 0.976000 0.015000 0.109000 0.780000 0.026000 0.085000 0.257000 0.664000 0.006000 0.073000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1051.1 MOTIF MA1052.1 RAP2-6 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 1000 E= 0 0.034000 0.271000 0.681000 0.014000 0.027000 0.958000 0.007000 0.008000 0.007000 0.002000 0.989000 0.002000 0.001998 0.893107 0.103896 0.000999 0.012000 0.985000 0.002000 0.001000 0.004000 0.003000 0.990000 0.003000 0.019980 0.946054 0.013986 0.019980 0.066066 0.921922 0.002002 0.010010 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1052.1 MOTIF MA1216.1 RAP21 letter-probability matrix: alength= 4 w= 13 nsites= 590 E= 0 0.293220 0.055932 0.377966 0.272881 0.091525 0.144068 0.101695 0.662712 0.000000 0.000000 0.998305 0.001695 0.103390 0.001695 0.250847 0.644068 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.267797 0.000000 0.732203 0.000000 0.000000 0.961017 0.038983 0.194915 0.128814 0.615254 0.061017 0.289831 0.311864 0.083051 0.315254 0.186441 0.106780 0.513559 0.193220 0.269492 0.125424 0.413559 0.191525 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1216.1 MOTIF MA1249.1 RAP210 letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 599 E= 0 0.282137 0.233723 0.146912 0.337229 0.340568 0.111853 0.198664 0.348915 0.191987 0.173623 0.260434 0.373957 0.018364 0.163606 0.003339 0.814691 0.000000 0.000000 0.998331 0.001669 0.043406 0.000000 0.016694 0.939900 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.050083 0.000000 0.949917 0.000000 0.000000 0.757930 0.003339 0.238731 0.475793 0.056761 0.355593 0.111853 0.452421 0.076795 0.342237 0.128548 0.377295 0.257095 0.171953 0.193656 0.312187 0.136895 0.340568 0.210351 0.300501 0.128548 0.325543 0.245409 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1249.1 MOTIF MA1266.1 RAP211 letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 588 E= 0 0.180272 0.459184 0.187075 0.173469 0.180272 0.401361 0.127551 0.290816 0.222789 0.139456 0.360544 0.277211 0.117347 0.421769 0.066327 0.394558 0.146259 0.581633 0.069728 0.202381 0.277211 0.071429 0.374150 0.277211 0.025510 0.549320 0.071429 0.353741 0.103741 0.634354 0.120748 0.141156 0.042517 0.000000 0.916667 0.040816 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.190476 0.559524 0.250000 0.000000 0.952381 0.000000 0.047619 0.173469 0.224490 0.328231 0.273810 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1266.1 MOTIF MA1256.1 RAP212 letter-probability matrix: alength= 4 w= 21 nsites= 597 E= 0 0.212730 0.375209 0.199330 0.212730 0.222781 0.107203 0.479062 0.190955 0.234506 0.144054 0.462312 0.159129 0.266332 0.321608 0.150754 0.261307 0.222781 0.139028 0.418760 0.219430 0.319933 0.120603 0.418760 0.140704 0.408710 0.219430 0.087102 0.284757 0.445561 0.023451 0.284757 0.246231 0.458961 0.025126 0.308208 0.207705 0.113903 0.346734 0.006700 0.532663 0.016750 0.010050 0.827471 0.145729 0.087102 0.000000 0.907873 0.005025 0.000000 0.998325 0.000000 0.001675 0.000000 0.000000 0.998325 0.001675 0.000000 0.000000 0.998325 0.001675 0.011725 0.963149 0.000000 0.025126 0.015075 0.010050 0.865997 0.108878 0.110553 0.169179 0.673367 0.046901 0.381910 0.314908 0.082077 0.221106 0.164154 0.070352 0.586265 0.179229 0.259631 0.135678 0.422111 0.182580 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1256.1 MOTIF MA1221.1 RAP26 letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 597 E= 0 0.172529 0.232831 0.030151 0.564489 0.107203 0.036851 0.546064 0.309883 0.313233 0.018425 0.638191 0.030151 0.001675 0.961474 0.000000 0.036851 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.001675 0.025126 0.973199 0.000000 0.013400 0.949749 0.000000 0.036851 0.000000 0.005025 0.969849 0.025126 0.025126 0.100503 0.855946 0.018425 0.329983 0.519263 0.023451 0.127303 0.112228 0.015075 0.760469 0.112228 0.244556 0.078727 0.591290 0.085427 0.335008 0.289782 0.082077 0.293132 0.190955 0.053601 0.564489 0.190955 0.179229 0.103853 0.579564 0.137353 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1221.1 MOTIF MA0729.1 RARA letter-probability matrix: alength= 4 w= 18 nsites= 768 E= 0 0.325521 0.001302 0.667969 0.005208 0.933702 0.001842 0.064457 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.001305 0.000000 0.973890 0.024804 0.000000 0.008850 0.001770 0.989381 0.002721 0.961905 0.035374 0.000000 0.992481 0.000000 0.007519 0.000000 0.734637 0.000000 0.039106 0.226257 0.929329 0.000000 0.005300 0.065371 0.983051 0.009416 0.007533 0.000000 0.000000 0.000000 0.998684 0.001316 0.000000 0.000000 0.881871 0.118129 0.005464 0.000000 0.000000 0.994536 0.000000 0.997171 0.000000 0.002829 0.998152 0.000000 0.001848 0.000000 0.685751 0.045802 0.038168 0.230280 0.003584 0.000000 0.408602 0.587814 0.000000 0.207957 0.408680 0.383363 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0729.1 MOTIF MA0730.1 RARA(var.2) letter-probability matrix: alength= 4 w= 17 nsites= 1426 E= 0 0.763675 0.016830 0.219495 0.000000 0.000000 0.000000 0.998658 0.001342 0.000000 0.001312 0.952100 0.046588 0.005098 0.009346 0.014444 0.971113 0.004950 0.980198 0.004455 0.010396 0.979577 0.011268 0.007746 0.001408 0.220836 0.291269 0.061629 0.426266 0.146694 0.297521 0.402204 0.153581 0.099123 0.456507 0.105866 0.338503 0.641161 0.077836 0.130607 0.150396 0.731795 0.012257 0.250901 0.005047 0.797450 0.011331 0.190510 0.000708 0.001369 0.000000 0.995893 0.002738 0.000674 0.004720 0.971005 0.023601 0.006879 0.009458 0.011178 0.972485 0.002025 0.973671 0.013165 0.011139 0.975066 0.001969 0.016404 0.006562 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0730.1 MOTIF MA0159.1 RARA::RXRA letter-probability matrix: alength= 4 w= 17 nsites= 23 E= 0 0.521739 0.000000 0.478261 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.043478 0.000000 0.565217 0.391304 0.000000 0.000000 0.043478 0.956522 0.000000 0.782609 0.130435 0.086957 0.956522 0.000000 0.043478 0.000000 0.173913 0.304348 0.217391 0.304348 0.217391 0.347826 0.391304 0.043478 0.217391 0.173913 0.478261 0.130435 0.565217 0.043478 0.304348 0.086957 0.217391 0.260870 0.521739 0.000000 0.739130 0.130435 0.130435 0.000000 0.043478 0.043478 0.869565 0.043478 0.000000 0.043478 0.695652 0.260870 0.086957 0.043478 0.130435 0.739130 0.043478 0.739130 0.130435 0.086957 0.913043 0.000000 0.043478 0.043478 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0159.1