MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF PH0148.1 Pou3f3 letter-probability matrix: alength= 4 w= 17 nsites= 99 E= 0 0.404040 0.181818 0.131313 0.282828 0.633663 0.099010 0.089109 0.178218 0.306931 0.158416 0.306931 0.227723 0.340000 0.100000 0.270000 0.290000 0.090909 0.101010 0.030303 0.777778 0.792079 0.079208 0.029703 0.099010 0.010000 0.050000 0.000000 0.940000 0.020000 0.000000 0.950000 0.030000 0.089109 0.900990 0.000000 0.009901 0.989899 0.000000 0.010101 0.000000 0.030000 0.010000 0.010000 0.950000 0.898990 0.010101 0.010101 0.080808 0.670000 0.060000 0.010000 0.260000 0.171717 0.090909 0.232323 0.505051 0.343434 0.131313 0.272727 0.252525 0.370000 0.120000 0.240000 0.270000 0.594059 0.069307 0.099010 0.237624 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PH0148.1 MOTIF PH0149.1 Pou3f4 letter-probability matrix: alength= 4 w= 17 nsites= 99 E= 0 0.333333 0.131313 0.292929 0.242424 0.330000 0.270000 0.240000 0.160000 0.210000 0.200000 0.180000 0.410000 0.120000 0.070000 0.220000 0.590000 0.840000 0.080000 0.020000 0.060000 0.920000 0.030000 0.020000 0.030000 0.060000 0.010000 0.010000 0.920000 0.029703 0.009901 0.019802 0.940594 0.940594 0.019802 0.009901 0.029703 0.920000 0.010000 0.010000 0.060000 0.030000 0.020000 0.030000 0.920000 0.060000 0.020000 0.080000 0.840000 0.828283 0.070707 0.010101 0.090909 0.475248 0.158416 0.198020 0.168317 0.250000 0.180000 0.260000 0.310000 0.210000 0.130000 0.170000 0.490000 0.160000 0.480000 0.160000 0.200000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PH0149.1 MOTIF PH0150.1 Pou4f3 letter-probability matrix: alength= 4 w= 16 nsites= 100 E= 0 0.380000 0.200000 0.160000 0.260000 0.290000 0.230000 0.350000 0.130000 0.181818 0.070707 0.191919 0.555556 0.250000 0.220000 0.010000 0.520000 0.930000 0.010000 0.010000 0.050000 0.010000 0.020000 0.000000 0.970000 0.020000 0.000000 0.000000 0.980000 0.970000 0.000000 0.000000 0.030000 0.990000 0.000000 0.000000 0.010000 0.010000 0.010000 0.000000 0.980000 0.060000 0.010000 0.560000 0.370000 0.940000 0.030000 0.010000 0.020000 0.310000 0.120000 0.350000 0.220000 0.079208 0.108911 0.495050 0.316832 0.220000 0.270000 0.060000 0.450000 0.188119 0.544554 0.059406 0.207921 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PH0150.1 MOTIF MA0142.1 Pou5f1::Sox2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 1364 E= 0 0.046188 0.620235 0.048387 0.285191 0.423865 0.042460 0.020498 0.513177 0.008047 0.036576 0.026335 0.929042 0.034332 0.008766 0.057706 0.899196 0.086194 0.265157 0.602630 0.046019 0.303141 0.013148 0.021183 0.662527 0.150475 0.266618 0.135866 0.447042 0.902118 0.021914 0.017531 0.058437 0.012418 0.003652 0.010957 0.972973 0.007305 0.011687 0.905040 0.075968 0.010234 0.752193 0.094298 0.143275 0.769231 0.011722 0.021978 0.197070 0.651248 0.049927 0.231278 0.067548 0.881705 0.024247 0.055107 0.038942 0.145481 0.087436 0.152094 0.614989 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0142.1 MOTIF PH0151.1 Pou6f1_1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 17 nsites= 100 E= 0 0.280000 0.280000 0.340000 0.100000 0.430000 0.240000 0.080000 0.250000 0.277228 0.297030 0.217822 0.207921 0.188119 0.267327 0.455446 0.089109 0.495050 0.069307 0.019802 0.415842 0.010101 0.000000 0.000000 0.989899 0.989899 0.000000 0.000000 0.010101 0.990000 0.000000 0.000000 0.010000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.010000 0.000000 0.700000 0.290000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.009901 0.009901 0.950495 0.029703 0.080000 0.400000 0.400000 0.120000 0.207921 0.128713 0.029703 0.633663 0.170000 0.150000 0.300000 0.380000 0.240000 0.170000 0.380000 0.210000 0.297030 0.316832 0.158416 0.227723 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PH0151.1 MOTIF PH0152.1 Pou6f1_2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 17 nsites= 100 E= 0 0.380000 0.210000 0.300000 0.110000 0.346535 0.306931 0.079208 0.267327 0.356436 0.227723 0.168317 0.247525 0.230000 0.350000 0.310000 0.110000 0.752475 0.049505 0.019802 0.178218 0.010101 0.000000 0.000000 0.989899 0.989899 0.000000 0.000000 0.010101 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.010000 0.000000 0.800000 0.190000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.970000 0.030000 0.090909 0.292929 0.535354 0.080808 0.161616 0.141414 0.030303 0.666667 0.160000 0.120000 0.280000 0.440000 0.151515 0.151515 0.414141 0.282828 0.237624 0.445545 0.138614 0.178218 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PH0152.1 MOTIF MA0065.2 Pparg::Rxra letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 857 E= 0 0.109685 0.369895 0.373396 0.147025 0.117716 0.193473 0.148019 0.540793 0.453488 0.026744 0.427907 0.091860 0.116144 0.003484 0.779326 0.101045 0.161253 0.017401 0.781903 0.039443 0.168213 0.149652 0.458237 0.223898 0.082271 0.633835 0.207416 0.076477 0.949015 0.024334 0.017381 0.009270 0.604867 0.055620 0.312862 0.026651 0.825231 0.005787 0.158565 0.010417 0.095017 0.002317 0.888760 0.013905 0.047509 0.010429 0.803013 0.139050 0.025492 0.114716 0.304751 0.555041 0.062645 0.643852 0.167053 0.126450 0.784223 0.067285 0.054524 0.093968 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0065.2 MOTIF MA0200.1 Pph13 letter-probability matrix: alength= 4 w= 7 nsites= 21 E= 0 0.285714 0.380952 0.142857 0.190476 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.047619 0.000000 0.952381 0.619048 0.047619 0.285714 0.047619 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0200.1 MOTIF PH0153.1 Prop1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 17 nsites= 99 E= 0 0.242424 0.383838 0.212121 0.161616 0.210000 0.190000 0.470000 0.130000 0.360000 0.250000 0.220000 0.170000 0.470000 0.180000 0.250000 0.100000 0.019802 0.158416 0.009901 0.811881 0.010101 0.030303 0.000000 0.959596 0.970297 0.009901 0.009901 0.009901 0.980000 0.000000 0.010000 0.010000 0.010000 0.010000 0.000000 0.980000 0.009901 0.009901 0.009901 0.970297 0.959596 0.000000 0.030303 0.010101 0.811881 0.009901 0.158416 0.019802 0.160000 0.160000 0.350000 0.330000 0.450000 0.110000 0.180000 0.260000 0.310000 0.180000 0.250000 0.260000 0.350000 0.180000 0.240000 0.230000 0.140000 0.530000 0.100000 0.230000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PH0153.1 MOTIF PH0154.1 Prrx1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 17 nsites= 99 E= 0 0.252525 0.272727 0.313131 0.161616 0.140000 0.150000 0.270000 0.440000 0.550000 0.220000 0.100000 0.130000 0.640000 0.100000 0.200000 0.060000 0.030303 0.636364 0.030303 0.303030 0.010101 0.080808 0.000000 0.909091 0.980000 0.010000 0.010000 0.000000 0.990000 0.000000 0.010000 0.000000 0.000000 0.010000 0.000000 0.990000 0.000000 0.010101 0.000000 0.989899 0.940594 0.000000 0.039604 0.019802 0.490000 0.050000 0.430000 0.030000 0.030000 0.480000 0.160000 0.330000 0.090000 0.060000 0.110000 0.740000 0.396040 0.168317 0.247525 0.188119 0.200000 0.390000 0.250000 0.160000 0.050000 0.180000 0.170000 0.600000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PH0154.1